精制透骨消痛颗粒防治骨性关节炎的计算机药理学.pdf

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1、物理化学学报(WuliHuaxueXuebao)MarchActaPhys．一Chim．Sin．，2010，26(3)：775-783775[Article]WWW．whxb．pku．edu．Clq精制透骨消痛颗粒防治骨性关节炎的计算机药理学郑春松徐筱杰，刘献祥”叶蕻芝(福建中医学院中西医结合研究院，福州350108；北京大学化学与分子工程学院，北京100871)摘要：采用分子相似性分析、化学空间、分子对接、生物网络技术和药代动力学性质预测等计算机药理学方法研究中药精制透骨消痛颗粒中514个化合物的药理

2、学机制．结果表明：该复方所含化合物在化学结构上具有多样性及大部分化合物在化学空问上具有类药性质；通过514个与35个骨性关节炎疾病相关的公认靶标的相互作用及它们在靶空间的分布上阐明了精制透骨消痛颗粒防治骨性关节炎的可能作用机理，发现了一些潜在的活性分子；通过分析药物库中骨性关节炎的药物一靶点的作用网络及精制透骨消痛颗粒中分子一靶点的作用网络的异质性值、特征路径长度等特征，揭示精制透骨消痛颗粒的多药物、多靶点、多途径分子作用机制．结果有助于理解中药精制透骨消痛颗粒的复杂作用机制．关键词：分子对接；化学空间

3、；靶空间；骨性关节炎；计算药理学中图分类号：O641ComputationalPharmacologyofJingzhiTouguXiaotongGranuleinPreventingandTreating0ste0arthritisZHENGChun—SongXUXiao—Jie。LIUXian—XiangYEHong-Zhic~AcademyofIntegrativeMe~cine,FujianUniversityofTraditionalChineseMedicine，Fuzhou350108,P

4、．R．Ch#zaCollegeofChemistryandMolecularEngineering,PekingUniversity，Beijing100871，R．China)Abstract：Thepharmacologicalmechanismof514compoundscontainedinaChinesemedicine，JingzhiTouguXiaotongGranule(JZTGXTG)wasstudiedbycomputationalpharmacologicalmethodsincl

5、udinganalysisofmolecularsimilarity，chemicalspace，moleculardocking，networktechnology，andthepredictionsofabsorption，distribution，metabolism，excretionandtoxicity(ADM匣／T)．ResultsshowthatcompoundsinJZTGXTGhavethediversestructuralpropertiesandmostofthesecompou

6、ndshavegooddrug—likepropertiesintheirchemicalspaces．TIlepossibleactionmechanismisilluminatedandpotentialactive—moleculesofJZTGXTGarefoundbystudyingtheinteractionsbetween514compoundsofJZTGXTGand35drugtargetsrelatedtoosteoarthritisdiseaseandthedistribution

7、of514compoundsindrug—targetspace．ByanalyzingnetworkparametersofJZTGXTGcompound-targetinteractionnetworkanddrug—targetinteractionnetworkincludingnetworkheterogeneityandcharacteristicpathlength，theresultsrevealthemolecularmechanismofmulti—drugs，multi—targe

8、ts，andmulti—pathwaysinJZTGXTG．Theresultsarehelpfu1forunderstandingthecomplicatedmechanismofJzTGXTG．KeyWords：Moleculardocking；Chemicalspace；Targetspace；Osteoarthritis；ComputationalpharmacologyReceived：November2，209；Revised：