PFGE脉冲场凝胶电泳分子分型识别系统介绍.doc

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1、PFGE脉冲场凝胶电泳分子分型识别系统介绍一、系统简介“PFGE脉冲场凝胶电泳分子分型识别系统”是基于国家十二五重大科技专项开发的专业软件系统。系统主要功能是PFGE图谱分子分型在线识别和处理，提供二叉层级聚树，MLVA、MLST字符类型的最小生成树，SEQUENCE基因片段类型的亲缘树计算和图形绘制，用于分析菌株之间的相关性，协助追踪感染来源以及有效控制疫情。系统结合了计算机技术、分子生物学、统计学、图像识别技术、地理信息技术，能够对微生物的分子分型数据进行专业处理和分析，准确识别出相似性。系统于2015年6月通过由国家疾控中心、解放

2、军疾病预防控制所、军事医学科学院、清华大学以及国内著名医院等单位组成的专家组验收。专家组认为本系统在疾控行业、食品卫生行业、医院以及科研部门均有较强的易用性和稳定性，业务逻辑清晰，功能齐全，且具自主知识产权，安全可控；系统申报2项发明专利，并已获得12个软件著作权。二、系统解决的主要问题1、疾控行业：送检样本细菌的相似性判定和带型编码、疾病暴发的溯源分析、疾病分布特征分析和预警分析。在发生感染和疫情时，可以帮助业务人员尽早定位感染来源，提高疫情调查、追踪和控制的效率。2、医疗机构：院内感染问题、医学研究。3、食品检疫：对食品中常见致病微

3、生物进行分子分型分析、食源性疾病微生物的溯源。4、农业和林业：家畜和动物携带治病菌的溯源、引发动物流行性感冒的研究和监控、动物、环境和饲养员耐药菌的研究。三、系统特点1、优秀的成本控制：采用B/S模式，一次性部署即可搭建成功，在采购成本、升级成本、维护成本上，具有压倒性优势。2、高效的计算能力：拥有计算功能强大的分析计算服务，可以一次性聚类1000株菌，并在15秒内完成。3、强大的客户端绘图能力：客户端提供直观的图形展示和良好的交互体验，操作简便，分析结果一目了然。4、良好的易用性：全中文操作界面，简单易用，确保用户可以快速上手。5、可

4、靠的用户信息安全保障：自主知识产权软件，为用户的信息安全提供可靠的保障。6、实验数据的积累：系统在使用过程中会积累下多样化的实验数据，数据积累的数量越多、年份跨度越广，则分析结果的准确性越高。四、系统使用效果对比1、使用前（1）细菌的识别定性采用传统的物理和化学检测，识别准确度相对差。（2）细菌的识别分型结果，不能在相关机构中统一认可。（3）疾病暴发、食品中毒、院内感染发生时，不能及时应对情况，造成诊断延迟，失去了最佳的处置时机。（4）没有相关的分子分型数据留存，不利于医疗研究和诊断经验数据积累。2、使用后（1）细菌的识别定性与国际接轨

5、，识别准确度高。（2）识别结果可以在不同机构之间比较，识别结果权威性高。（3）当疾病暴发、食品中毒、院内感染发生时，机构可以直接采集样本，分析识别定性。（4）能够积累大量的细菌分子分型数据，提高机构在重大疫情中的溯源成功率，提高机构的知名度。