杉木叶绿体微卫星及其单倍型变异分析.pdf

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1、第34卷第3期中南林业科技大学学报、，o1．34No．32014年3月JournalofCentralSouthUniversityofForestry&TechnologyMar．2014杉木叶绿体微卫星及其单倍型变异分析文亚峰，韩文军，周宏(1．中南林业科技大学，湖南长沙410004；2．广东省韶关市林业局，广东韶关512000)摘要：杉木是我国南方重要的用材林树种，但其分子标记开发滞后于其他树种。文章利用种(属、科)间扩增法，从来源于黑松、日本柳杉等的21个叶绿体微卫星(SSR)位点中为杉木筛选适合的标记。结果表明：候选标记位点中有1

2、0个能够成功扩增，其中2个位点(CJCP1m004和CJCP2m002)具有多态性，其单倍型数量()分别为2和6，多样性指数()为0．233和0．733。多态性位点的单倍型序列分析结果表明，源于日本柳杉的CJCP2m002在杉木中属高变异位点，其SSR重复单元类型为(AT)··(T)，不同于来源物种的重复单元类型一(AT)。筛选得到的叶绿体微卫星(SSR)标记在杉木分子遗传学研究中具有重要用途。关键词：杉木；叶绿体微卫星；单倍型；多态性位点；种间扩增中图分类号：$791．27文献标志码：A文章编号：1673．923X(2014)03．000

3、1．05CharacterizationofchloroplastsSSRmarkersandtheirhaplotypevariationofCunninghamialanceolataWENYa-feng，HANWen-jun，ZHOUHong(1．CentralSouthUniversityofForestry&Technology,Changsha410004，Hunan，China；2．ShaoguanForestryAdministration，Shaoguan512000，Guangdong，China)Abstract：Ch

4、inesefir(Cunninghamialanceolata)isaveryimportantplantationspeciesthatismainlydistributedinSouthernChina．However,thegenomicanalysesofClanceolatahavelaggedsignificantlybehindthoseofotherconiferspeciesduetoalackofsuitablemarkers．Usingthemethodofcross-speciesamplification，1wen

5、tyonecandidatecp—SSRmarkersfromPinusthunbergiiandCryptomeriajaponicawereexaminedtoselectpolymorphiclociforChinesefir．Thegenotypingresultsshowthat，ofcandidatemarkerloci，tenlocihadbeensuccessfullyamplifiedwithinPCRbands，andoftheten，2loci(CJCP1m004，CJCP2m002)werepolymorphism，

6、theirs__numbersofhaplotypesperlocuswere2and6testedin16individualsandtheirsgeneticindexeswereO．233and0．733．respectively．Theanalysisofsequencingresultssuggestedthatthemotifs[(AT(T)]oflocusCJCP2m_002differedgreatlyfromoriginalspecies(Cjaponica)．CJCP2m_002wasthehighvariationlo

7、cusinChinese缸Thesecp—SSRmarkerswillbeusefulinfuturegeneticanalysesofClanceolataandrelatedspecies．Keywords：Cunninghamialanceolata；chloroplastsSSRmarkers；haplotype；polymorphicloci；inter-specificamplification杉木Cunninghamialanceolata是我国南方重遗传，保守性强，具有分子量小、多拷贝和结构要的用材林树种，具有生长快、产量高

8、、材质好、简单等特点】。基于短核苷酸重复序列而开发的用途广等特点。但杉木分子遗传学研究基础非常叶绿体微卫星(cp—SSR)是一种新型标记技术，薄弱，严重滞后于杨树、桉树、松树等其