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时间:2020-04-27
《大鳞副泥鳅7个群体遗传变异的微卫星分析-论文.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第33卷第1期水生态学杂志Vo1.33,No.12012年1月JournalofHydroecologyJan.,2012大鳞副泥鳅7个群体遗传变异的微卫星分析游翠红,童金苟,俞小牧(1.淡水生态与生物技术国家重点实验室,中国科学院水生生物研究所,湖北武汉4300722.汕头大学海洋生物研究所,广东汕头515063)摘要:利用泥鳅(Misgurnusanguillicaudatus)的微卫星引物跨种扩增大鳞副泥鳅(Paramisgurnusdabryanus),通过家系扩增、PCR产物测序筛选出6个座位,用于大鳞副泥鳅7个
2、野生群体的遗传结构分析。结果显示,群体的平均等位基因数在3.167~4.833,平均观测杂合度(Ho)在0.248~0.417,平均期望杂合度(He)在0.379~0.505,多个座位存在零等位基因、杂合子缺失现象,显示大鳞副泥鳅种群遗传多样性较低。采用UPGMA法对7个群体基于遗传距离进行聚类,可分为4类,位于长江中下游的沙市、澧县、武汉、鄱阳湖群体先聚为一类,后与石首群体聚类,最后与珠江水系的广州群体聚类,而位于长江上游的泸州群体则单独聚为一类。群体的F一统计量(F)为0.2987,表明群体问存在显著的遗传分化,主要由
3、泸州群体与其它地区群体间的遗传分化引起。关键词:大鳞副泥鳅;微卫星;遗传多样性中图分类号:Q812文献标志码:A文章编号:1674—3075(2012)O1—0084—08大鳞副泥鳅(Paramisgurnusdabryanus)隶属鲤1材料和方法形目(Cypriniformes)、鳅科(Cobitidae)、副泥鳅属(Paramisgurnus),其外部形态与泥鳅(Misgurnusan—1.1样品采集及总DNA的提取guillicaudatus)极为相似,俗称“红泥鳅”,主要分布大鳞副泥鳅野生样品采自长江水系和珠江共7
4、于我国长江中下游流域与台湾地区,具有极高的食个地区,分别是四川省泸州(Luzhou,30尾)、湖北用价值和药用价值,是我国重要的小型经济鱼类,主省荆州市的沙市(Shashi,39尾)和石首(Shishou,要与泥鳅一起出口至日本、韩国等地。近年来,由于29尾)、武汉(Wuhan,40尾)、湖南省澧县(Lixian,捕捞强度的增加,其野生资源量正在逐渐减少。充32尾)、江西省鄱阳湖(Poyanghu,30尾)及广东省分了解大鳞副泥鳅的种质资源现状,对其保护和开广州(Guangzhou,22尾),共计222尾个体。依据大发具有
5、重要意义;此外,李康等(1983)观察到湖北鳞副泥鳅的胸鳍基部是否存在突起等特征来鉴定雌沙市地区大鳞副泥鳅群体存在染色体数目为48与雄,剪尾鳍保存于95%乙醇中;此外,在繁殖季节采49的两个种群,部分个体增加了一条端部着丝粒染用人工授精的方法获得大鳞副泥鳅全同胞自交家系色体。因此,有必要进一步探讨沙市地区群体是否2个。从每个家系中各取30~50尾7日龄子代,用存在种群亚分化的问题。95%乙醇固定备用。成鱼尾鳍与幼鱼总DNA的提本研究采用在真核生物基因组中分布广泛、呈取参照萨姆布鲁克和拉舍尔(2002)的酚·氯仿·共显性遗传
6、的微卫星分子标记,分析长江流域与珠异戊醇方法,稍加修改。江水系共7个地区大鳞副泥鳅野生群体的遗传多样1.2PCR扩增及凝胶电泳性与遗传分化,以期为大鳞副泥鳅种质资源的评估、微卫星位点的引物来自已发表的15对泥鳅引保护和持续利用提供理论依据。物序列(Mac2~Mac4、Mac9、Mac11、Mac15、Mac24、Mac35~Mac37、Mac40、Mac44~Mac45、Mac49~Mac50)(Morishimaetal,2001),由上海生工生物工收稿日期:2011—09—11程有限公司合成,经PCR筛选后扩增大鳞副泥
7、鳅群基金项目:国家自然科学基金项目(30370225);973项目体。有价值的引物应符合在大鳞副泥鳅样品中扩增(2010CB126305);农业部专项课题(200903045,2011.G12);FEBL清晰、稳定、多态性高,并且在其自交家系中扩增符课题(2011FBZ20)。合孟德尔遗传。PCR反应总体积为12.5L,包括通讯作者:童金苟。E—mail:jgtong@ihb.acan10~50ngDNA,1×PCR缓冲液(10mmol/LTris—作者简介:游翠红,1976年生,女,博士,主要从事鱼类遗传育种研究。E—m
8、ail:chyou@stu.edu.cnHC1pH8.3,1.5mmol/LMgC12,50mmol/LKC1),2012年第1期游翠红等,大鳞副泥鳅7个群体遗传变异的微卫星分析85120~mol/LdNTPs,200ixmol/L引物和0.5UTaq酶通过标记检验(Signtest)与Wilcoxon
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