大鳞副泥鳅β-肌动蛋白基因的cDNA全长克隆及表达分析-论文.pdf

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1、中国虐学通提2013,29(35):96—101ChineseAgriculturalScienceBulletin大鳞副泥鳅肌动蛋白基因的cDNA全长克隆及表达分析刘士力,王雨辰,张德华,张宇飞,练青平,李倩,胡廷尖(浙江省淡水水产研究所,浙江湖州313001;上海海洋大学,上海201306;浙江省长兴县李家港镇农科站,浙江湖州313102)摘要:为了克隆分析大鳞副泥鳅肌动蛋白基因的cDNA序列,并研究该基因的组织表达规律。采用RT-PCR和RACE法,从大鳞副泥鳅(Paramisgurnusdabrymms)肌

2、肉中分离和克隆大鳞副泥鳅肌动蛋白基因。结果表明:大鳞副泥鳅肌动蛋白基因全长1710bp,其中5’一UTR长73bp,3’一UTR长509bp,编码区长l128bp,编码375个氨基酸。大鳞副泥鳅肌动蛋白与其他鱼类氨基酸的同源性大于98%,核苷酸同源性大于87%;系统进化分析表明:大鳞副泥鳅肌动蛋白在进化上高度保守;qRT-PCR结果表明:肌动蛋白基因在大鳞副泥鳅的肌肉、心、肝、脾、肠、胃、精巢和卵巢共8种组织中都有表达。研究结果不仅为利用肌动蛋白基因作为内参基因分析大鳞副泥鳅的基因表达研究提供了序列依据,而且可为大

3、鳞副泥鳅的分子系统学研究提供序列参考。关键词:大鳞副泥鳅;RACE;p-肌动蛋白;cDNA中图分类号:Q753文献标志码:A论文编号:2013—1734CloningandExpressionAnalysisoffl-actinGenefromParamisgurnusdabryanusLiuShili一,WangYuehen~,2,ZhangDehua,ZhangYufei’LianQingping,LiQian’HuTingjian(ZhefiangInstituteofFreshwaterFisheries,

4、HuzhouZhejiang313001;ShanghaiOceanUniversity,Shanghai201306;3AgricultureStationofL~iagangVillageinChangxingCounty,HuzhonZhejiang313102)Abstract:ThepresentexperimentwasconductedtoobtainandanalyzedcDNAsequenceof/3-actingenefromParamlsgurnusdabryanus,andtostudyth

5、etissueexpressioncharacterizationof3-actinmRNAinP.dabryanus.Thecomplete/3-actincDNAsequenceswereobtainedfromtheP.dabryanusmuscletissueusingRT—PCRandRACEmethods.Thecompletefl-actincDNAofdabryanuswas1710bpinlength.containinganopenreadingframeof1128bp(encoding375

6、aminoacids),flankedby73bp5"UTRand509bp3"UTR.Sequenceanalysisindicatedthatthedabryanus/3-aetinexhibitsmorethan98%aminoacididentityand87%nucleotideidentitywiththe3-actinofotherfishes.Phylogeneticassayindicatedthatthe一actingeneofdabryanuswashighlyconservedduringe

7、volution.Resultsfromquantitativereal—timePCR(qRT—PCR)showedthe/3-aetingeneiswidelyexpressedindifferentorgansincludingskeletalmuscle,heart,liver,spleen,intestine,stomach,testisandovary.Theresultprovidedsequenceinformationnotonlyforanalyzinggene基金项目:浙江省科技厅公益技术研究

8、项目“泥鳅苗种产业化繁育关机技术的研究与示范”(2010C32033);浙江省科技厅公益技术研究项目“泥鳅种质收集与多倍体育种技术的研究”(2012C22059);湖州市水产养殖创新团队科研计划项目“泥鳅仔鱼摄食习性研究与开口饵料开发”(2010KC02—6);湖州市科技局新农村建设计划项目“泥鳅规模化繁育技术的研究”(2009YN01)。第一作者简介:刘士

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