猪常见病PCR检测程序.doc

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1、猪病检测手册17目录猪瘟RT-PCR检测程序3猪繁殖与呼吸综合症RT-PCR检测程序5高致病性猪繁殖与呼吸综合症RT-PCR检测程序7猪流行性乙型脑炎RT-PCR检测程序9猪伪狂犬病毒(PRV)PCR检测程序11猪细小病毒(PPV)PCR检测程序13猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)PCR检测程序15细菌学检测程序1717猪瘟RT-PCR检测程序一、病毒RNA的提取1、阳性对照RNA的提取材料冻干猪瘟兔化弱毒疫苗、检测用病毒RNA提取试剂盒(天跟公司产品)。方法将1瓶猪瘟兔化弱毒冻干疫苗用1.5ml蒸馏水或PB

2、S液稀释,用1mlRNase-free管分装,每管500µl,-20℃保存。取出冻存的猪瘟病毒,解冻后离心,取上清用于RNA的提取。RNA提取按试剂盒说明进行,最后用50µlRNAase-free水溶解RNA,得到RNA溶液。2、疑似病料RNA的提取样品采集采集病死或扑杀的猪,取血清、扁桃体、淋巴结(包括肺门、腹股沟和肠系膜淋巴结)、肺脏、脾脏、肾脏、流产胎儿等组织病变与健康部交界处组织;待检活猪,用注射器取血5ml,4℃保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。附:通常木乃伊胎不能作为检测样品。对于

3、新鲜流产的胎儿,可作为检测样品。对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;如果是晚期流产的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。胎儿的保存方法同上。组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5mlPBS(PH7.2)继续研磨制成1:3的组织匀浆液,转至1.5ml灭菌离心管中,8000r/min离心2min,取上清液用于RNA的提取;全血样品处理:待血凝后取血清用于RNA的提取。RNA提取待检样品RNA的提取按试剂盒说明进行,最后用50µlRNAase-free水溶解RNA,得到R

4、NA溶液。二、RT-PCR反应1、材料RT试剂盒(东洋纺产品)、PCR试剂盒(天跟公司产品)。引物序列:F:5’-GACCTGGATGCGACTGACC-3’,19bp,TM为61.88。R:5’-GCGGCGAGTTGTTCTGTTAG-3’,20bp,TM为59.85。扩增的目的片段为133bp。2、RT体系及反应程序:名称弱毒疫苗阳性对照检测病料RNase-Free水6µl0特异性下游引物1µl1µl模板RNA5µl11µlTotal12µl12µl置于PCR仪上65℃10min,立即冰浴5min

5、。然后加入以下试剂:17变性后的RNA溶液12µl5×RTbuffer4µldNTPmixture2µlRNaseInhibitor1µlReverTraACE1µlTotal20µl按以下程序反转录:1、42℃,45min2、99℃,5min将cDNA-20℃保存。2、PCR反应体系及程序ddH2O7.5µlcDNA3µl上游引物1µl下游引物1µl2×Mastermix12.5µlTotal25µl反应程序:1、94℃,3min2、95℃,30sec3、56℃,30sec×35cycles4、72℃

6、,1min5、72℃,10min三、电泳用TAE电泳缓冲液配制1.8%的琼脂糖凝胶,100ml加入5µl染色液。80V/70Ma电泳40min观察结果,在阳性对照出现133bp条带、阴性对照无条带的情况下,检测样品如出现133bp的条带,判定为猪瘟病毒阳性。17猪繁殖与呼吸综合症RT-PCR检测程序一、病毒RNA的提取1、阳性对照RNA的提取材料冻干PRRS弱毒疫苗、检测用病毒RNA提取试剂盒(天跟公司产品)。方法将1瓶PRRS弱毒冻干疫苗用2ml生理盐水或PBS液稀释,用1mlRNAase-free管

7、分装,每管200µl,-20℃保存。取出冻存的病毒,解冻后用于RNA的提取。RNA提取按试剂盒说明进行,最后用50µlRNAase-free水溶解RNA,得到RNA溶液。2、疑似病料RNA的提取样品采集病死或扑杀猪,取病死或扑杀猪,取血清、淋巴结(包括肺门和腹股沟淋巴结)、肺脏、脾脏、流产胎儿等病变明显部位与正常组织交替处组织(检测蓝耳病必须包括淋巴结和肺脏样本);待检活猪,用注射器取血5ml,4℃保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。附:通常木乃伊胎不能作为检测样品。对于新鲜流产的胎儿,可作为检

8、测样品。对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;如果是晚期流产的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。胎儿的保存方法同上。组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5mlPBS(pH7.2)继续研磨制成1:3的组织匀浆液,转至1.5ml灭菌离心管中,8000r/min离心2min,取上清液用于RNA的提取;全血样品处理:待血凝后取血清用于RNA的提取。RNA提取待检样品RNA的提取按试剂盒说明进行,最后用50µlR

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