异速生长的QTL定位模型及一因多效性扩展-论文.pdf

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1、第38卷第3期南京林业大学学报(自然科学版)Vo1．38．No．32014年5月JournalofNanjingForestryUniversity(NaturalSciencesEdition)May，2014doi：10．3969／j．issn．1000—2006．2014．03．007异速生长的QTL定位模型及一因多效性扩展李婕，王忠，李永慈外，盖钧镒4，黄中文，邬荣领(1．北京林业大学林学院，北京100083；2．北京林业大学生物学院，北京100083；3．北京林业大学理学院，北京100083；4．南京农业大学农学院，江苏南京210095

2、；5．河南科技学院农学系，河南新乡453003)摘要：异速生长是生物界被广泛研究的一个重要生长规律。为了揭示异速生长相关的QTL及一因多效性，考虑了生物生长过程的动态特性，并基于功能作图的框架，构造了一个解析异速生长关系的QTL定位模型。使用这个模型，对一个大豆重组自交系群体(RIL)的叶片生物量和总生物量的异速生长关系进行了分析，并在第24号连锁群上检测到一个影响这一异速生长关系的QTL，同时使用Logistic生长曲线，在此QTL区间内检测到了影响叶片动态生长的QTL。模拟实验结果发现，通过该算法可提高QTL定位的准确性，也能评估异速生长的生

3、长指数等参数。关键词：异速生长；功能作图；大豆生物量；QTL定位中图分类号：$722；文献标志码：A文章编号：1000—2006(2014)03—0035—05AnovelQTLmappingmodelforallometricgrowthandpleiotropicextensionLIJie，WANGZhong，LIYongci外，GAIJunyi，HUANGZhongwen，WURongling(1．CollegeofForestry，BeijingForestryUniversity，Beijing100083，China；2．Colle

4、geofBiology，BeijingForestryUniversity，Bering100083，China；3．CollegeofScience，BeringForestryUniversity，Bering100083，China；4．CollegeofAgronomy，NanjingAgriculturalUniversity，Nanjing210095，China；5．DepartmentofAgronomy，HenanInstituteofScienceandTechnology，Xinxiang453003，China)Abstr

5、act：Allometricgrowthhasbeenwidelystudiedasanimportantlawinbiology．Inordertorevealallometricgrowthanditspleiotropism，anewmodelisproposedtomaptheQTLwhichisrelatedtoallometricgrowthbasedontheframe—workoffunctionalmappinginthispaper．Usingthismodel，asoybeanpopulationofrecombinanti

6、nbredlines(RIL)isdemonstratedtoanalyzetheQTLswhichaffectallometricgrowthbetweenleafbiomassandtotalweight．TheQTLsinthe24thlinkagegroupsdetectedbythismodelaretestifiedbytheLogisticmodeltofindoutpleiotropism．ThisextendedmodelimprovestheaccuracyofQTLmappingandestimateoftheparamet

7、ersofallometricgrowthbymeansoftwomer-its，whichthedynamictraitsofbiologicalgrowthprocessesareconceivedandmuhipletimepointsintheexperimentaldataareemployed．Keywords：allometricgrowth；functionalmapping；soybeanbiomass；QTLmapping虽然在医学领域已经进行了大量全基因组关被克隆分离出来J，导致这一问题最可能的原联分析研究，但在农业和林业领

8、域，有些物种并不因，是通过严格的统计检验检测出的QTL与生物具备全基因组分析的条件，而基于分子标记的连锁学不相关。为了提高QTL定位的准