鲤连锁图谱及生长、肉质性状qtl定位研究

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1、学校代码：10264研究生学号：D090101013上上上海海海海海海海海洋洋洋洋大大大大学学学学博博士学位论文博士学位论文题题题题目目目目：：：：鲤连锁图谱及生长、肉质性状QTL定位研究GeneticLinkageMapandQTLAnalysisof英文题目英文题目：英文题目：：：Growth-relatedandMeatQualityTraitsinCommonCarp专专专专业业业业：：：：水产养殖研究方向研究方向：研究方向：：：水产生物技术与遗传育种姓姓姓姓名名名名：：：：郑先虎指导教师指导

2、教师：指导教师：：：孙效文研究员二二二O一一一二一二二二年年年年五五五五月月月月上海海洋大学学位论文原创性声明上海海洋大学学位论文原创性声明上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学

3、学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年上海海洋大学博博士学位论文博士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注严云勤东北农业大学教授主席孙中武东

4、北林业大学教授委员滕春波东北林业大学教授委员梁利群黑龙江水产研究所研究员委员尹家胜黑龙江水产研究所研究员委员张晓峰黑龙江水产研究所副研究员秘书答辩地点黑龙江水产研究所答辩日期2012-05-25鲤连锁图谱及生长、肉质性状QTL定位研究摘要鲤（Cprinuscarpio）作为世界性的养殖鱼类，以年产340万吨，约占全球淡水养殖鱼类产量的14%，而在世界水产养殖业占据重要地位。鲤也是我国主要养殖鱼类，同时也是培养出品种最多的水产养殖种，养殖历史悠久，养殖产量高，在过去的几十年里大大促进了我国水产养殖业的发

5、展，极大的满足了人们对动物蛋白的需求。但随着人们消费水平的提高，对水产品质量的需求已超过了对数量的需求。改善肉质不仅是畜禽行业面临的问题，也是水产行业不得不面临的问题。因此，对鲤肌肉品质性状进行选育是十分必要的。鱼类的肌肉品质是十分复杂的性状，受养殖环境、营养饲料等因素影响较大。传统的育种手段无法有效解决低遗传力性状的改良问题，分子育种技术的出现使我们对这类性状的选育成为了可能。在鱼类的分子标记育种中，要对特定的性状进行选育，一个首要的前提是获得控制该性状发育的基因，或者是控制性状发育的QTL位点。可

6、以认为遗传连锁图谱的构建及性状的QTL定位是进行分子标记育种的前提。自2000年第一张鲤遗传图谱问世以来，鲤分子育种工作取得了较快的发展，目前已经构建了鲤的第三代连锁图谱，获得了一大批生长、饲料转化率和生理生化等性状的QTL结果。但早期的图谱采用的标记大都为显性标记（如RAPD、AFLP等）和少量的微卫星标记，图谱的标记少，图距大，分辨率和覆盖率大都较低，其利用率十分有限。本论文从两个方面出发，第一，利用高分辨率的SNP标记构建鲤的整合图谱及与斑马鱼基因组的比较图谱；利用整合图谱进行多群体QTL比较分

7、析。第二，利用全同胞家系进行脂肪酶活力、肌肉脂肪含量、肌肉蛋白含量、灰分等肉质性状的QTL定位研究。具体研究结果如下：1、采用1536个SNP标记和300个微卫星标记，对3个群体的父母本及443个子代进行基因型分析，构建连锁图谱，并与实验室先前构建的图谱（68群体）进行整合。得到的整合图谱包含678个标记（421个SNP和257个微卫星），分布于42个连锁群上，图谱长度为2371.6cM，图谱覆盖率为86.7%，标记间平均间隔为3.7cM，连锁群平均标记为16个，连锁群长度范围3.2-201.0cM，

8、标记范围为3-41个，连锁群平均间隔为1.4-24.1cM，连锁群内标记最大间隔为1.7-43.7cM。2、将整合图谱的标记序列与5种模式鱼的基因组进行比对，其同源标记分别I为斑马鱼（Daniorerio）72.9%（489/671）、红鳍东方鲀（Takifugurubripes）30.6%（205/671）、黑青斑河豚（Tetraodonnigroviridis）28.9%（194/671）、青鳉（Oryziaslatips）25.2%（169/671