仿刺参（apostichopus japonicus）高密度遗传连锁图谱构建及生长性状qtl精细定位

《仿刺参（apostichopus japonicus）高密度遗传连锁图谱构建及生长性状qtl精细定位》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、瓜義）相作乐ＯＣＥＡＮＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹＯＦＣＨＩＮＡ博±学位论文ＤＯＣＴＯ民ＤＩＳＳＥＲＴＡＴＩＯＮ＇＇（ｏｓｔ／ｃＡｏｐｕｓａｐｏ／７／ｃｔ／ｓ）仿刺参心＿／高密度遗传ＴＬ论文题目；连锁图谱构建及生长性状Ｑ精细定位ｓｔｒｕｃｏｎｆ－ａｎｄＣｏｎｔｉｏａＨｉｇｈＤｅｎｓｉｔｙＧｅｎｅｔｉｃＭａｐＱｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅＴｒａｉｔＬｏｃｕｓＦｉｎｅＭａｐｐｉｎｇ英文题目：ｉｎＡｐｏｓｔｉｃｈｏｐｕｓａｐｏｎｉｃｕｓｊ作者：田

2、梅琳＾指导教师；包振民教授学位类别；学术学位专业名称：遗传学研究方向二海洋动物遗传学谨ｌｉ（此论文献给我敬爱的导师和亲爱的家人仿刺参（心ｙＳｙＰＣＷ／ＣＷ）高密度遗传连锁图谱构建及生长性状ＱＴＬ精细定位学位论文答辩日期：指导教师签字：－－－答辩委员会成员签字：－／《令义Ｊ方）独创声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的，论文中不包含其研究成果，。据我所知除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外他人己经发表或

3、撰写过的研究成果，也不包含未获得（，注＝如没有其他需要特别声明的本栏可空）或其他教育机构的学位或证书使一同工作的同志对本研究所做的巧何贡献均己在论文中作了明用过的材料。与我确的说明并表示谢意。（：３学位论文作者签名：嘛爾签字曰期乃１年月曰学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，并同意Ｗ下事项：，允许１、学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和磁盘论文被查阅和借阅。，可２、学校可＾将学位论文的全部或部分内容编入有关数

4、据库进行检索＾＾＾＇＇采用影印。同时授权清华大学中、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文＂ＣＮＫＩ《中国知识资源总库》国学术期刊用于出版和编入，（光盘版）电子杂志社授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名：导师签字：：签字曰期：＞度年＾月＜＾曰签字曰期从钉年月夺曰５‘仿刺参（作０５沁々０／７１／５７却０？１＜？？５）高密度遗传连锁图谱构建及生长性状ＱＴＬ精细定位摘要／？＞（１仿

5、刺参＾；？〇５舶７０１？０？／＜：＾５６６１１］＜：３１８６７）作为棘皮动物口的代表性物种／．／％一之，是我国水产养殖业中商业价值较高的经济物种，随着养殖规模的发展，仿刺参养殖己逐渐成为我国水产养殖业的支柱产业－ＲＡＤ。木研究利用２ｂ一■－（化ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎｓ－）ｉｔｅａｓｓｏｃｉａｔｅｄＤＮＡ技术，对仿刺参杂交家系子代个体进行了高通量的ＳＮＰ标记的开发，。构建了高密度、高精度的仿刺参遗传连锁图谱进行了生长性状的精细定位。为仿刺参全基因组测序及其他基因组学和遗传学研究

6、提供了丰富的信息和理论基础。同时也为仿刺参生长机制和分子标记辅助肯种提供了理论和物质基础。１－．作图家系的选择及仿刺参化ＲＡＤ测序文炸的构建＂双假拟测交’’本研究中建立遗传图谱的家系的构建方法采用（ｄｏｕｂｌｅｓｅｕｄｏ－ｐｔｅｓｔｃｒｏｓｓ）策略，有目的地挑选了达到性成熟期的年．长性状优良的个体分。＂别作为建立家系的父巧木，构建了９个同父异巧的全同胞家系。在家系子代生长到１龄的时间点，进行采样和后期的家系鉴定，最终确定用于构建遗传图谱的家系材料。Ｗ杂交家系两个亲木和子一代

7、１００个个体的基因组ＤＮＡ为实验材料，经ＢｓａＸＩ限制性酶切得到随机分布于基因组各处的３３ｂｐ的ＤＮＡ片段；酶切片段与带有选择性碱基的特异性接头相连；通过两轮ＰＣＲ扩增反应向测序文库中引入特定Ｂａｒｃｏｄｅ序列。测序文库构建完成后首先随机选取测巧文库进行克隆测序，而后又对两个亲本和随机的１０个子代个体独立重复的进行了测序文库构建和测序＾１。。１验证本研究中实验操作的稳定性和实验技术的可重复性２．仿刺参高密度遗传连锁图谱的构建本研究在经过标签聚类、参考位点的建立、子代标签与参考位点

8、的比对等步骤的测序数据处理，Ｗ及子代个体分型率的筛选和孟德尔分离比的筛选后，共计获得３０６。其中用于母本连锁图谱构建的１１个位点用于后期遗传连锁图谱的构建６３１１为５５１７个，亲本共享的ＳＮＰ标位点为个，用于父本连锁图谱构建的位点－＝５２２ｖａｌｕｅ０．０５。本研究选择使用的遗传连锁图谱作图软件为记总数为（ｐ）Ｊｏｎｍａ４，制定了如下图谱构建流程：对作，ｉｐ．０针对该软件自身计算容量的限