刺参(Apostichopus japonicus)重要经济性状相关QTL位点的验证分析.pdf

《刺参(Apostichopus japonicus)重要经济性状相关QTL位点的验证分析.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、上海海洋大学硕士学位论文学校代码：10264研究生学号：M150150278上海海洋大学硕士学位论文刺参(Apostichopusjaponicus)重要经济性题目：状相关QTL位点的验证分析ValidationofQTLsAssociatedwithImportantEconomicTraitsofSea英文题目：Cucumber(Apostichopusjaponicus)专业：渔业研究方向：刺参遗传育种姓名：刘安然指导教师：廖梅杰副研究员二O一八年五月上海海洋大学硕士学位论文上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明

2、：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部

3、分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年月日上海海洋大学硕士学位论文上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注答辩地点答辩时间上海海洋大学硕士学位论文刺参(Apostichopusjaponicus)重要经济性状相关QTL位点的验证分析ValidationofQTLsAssociatedwithImportantEconomicTraitsofSeaCu

4、cumber(Apostichopusjaponicus)学位论文完成日期：指导教师签字：答辩委员会成员签字：上海海洋大学硕士学位论文刺参重要经济性状相关QTL位点的验证分析摘要刺参属于棘皮动物门(Echinodermata)、海参纲(Holothuroidea)，是我国北方重要的海珍品之一。近年来，我国刺参养殖得以长足发展，规模拓展迅猛，直接经济产值约300亿元，是我国海水养殖产业中单一产值最大的物种，为沿海渔业经济结构的调整和渔民就业及增产增收提供了重要途径。随着刺参产业规模的逐渐扩大，种质退化、生长缓慢、养殖周期长、

5、抵御环境变化能力差、病害频发等一系列制约或潜在制约产业发展的瓶颈问题也日益凸显，分子标记辅助育种是解决上述问题的有效手段。随着分子技术的发展，构建遗传连锁图谱，利用与目标性状紧密连锁的分子标记对性状的遗传改良是当今水产动物遗传育种的研究热点。但由于小样本作图QTL区间过大和易受环境影响的原因，导致QTL的检测和对QTL效应评估发生偏离，因此对QTL进行验证是实施MAS的前提。本研究在前期构建的刺参高密度遗传连锁图谱的基础上筛选重要性状相关的QTL位点并进行验证和生产性应用实践，利用SSR对刺参进行亲子鉴定分析，以期为刺参分

6、子标记辅助育种提供基础数据。本文研究结果如下：1.刺参重要经济性状相关SNP标记的筛选实验室前期构建了刺参高密度遗传连锁图谱，该图谱包含4002条SLAF标签。结合构建图谱家系所用子代的性状数据，筛选出与体长、体宽、体重、棘刺总数及抗病力(抗灿烂弧菌侵染)这5个性状相关的9个QTL区域，包含81条SLAF标签。本研究在以上基础上开展性状相关SNP标记筛选，在81个SLAF标签上共获得841个SNP位点，SNP位点与性状相关性分析共获得189个性状相关SNP位点，进一步开展了这些SNP位点基因型与性状相关性分析筛选到具有相关

7、性状优势基因型的SNP位点79个，结合HRM(Highresolutionmelting,HRM)小片段法基因分型引物设计要求获得能用于HRM小片段法基因分型与性状显著相关且不同基因型之间的差异显著性的SNP位点共26个。其中与体长、体宽、体重、棘刺总数和抗病相关的标记分别8、14、9、8、18个(其中15个位点与多个性状相关)。根据所筛选的26个SNP标记的序列信息，成功设计可用于小片段法SNP基因分型的特异性引物14对，对14个SNP位点进行基因分型检测，SNP107在检测群体中有明显的多态性但未分型成功，得到能分型的

8、引物13对。I上海海洋大学硕士学位论文2.重要经济性状相关SNP标记在大规模刺参养殖群体中的验证在扩大繁育群体中利用HRM小片段法对这13个刺参重要经济性状相关的候选SNP位点进行分型和多态性检测并结合扩大群体的相关性状数据进行位点验证。对13个SNP位点进行基因分型和多态性检测结果表明：有3个单态性位