大豆GmWRI1a基因克隆及生物信息学分析-论文.pdf

《大豆GmWRI1a基因克隆及生物信息学分析-论文.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、第44卷第7期东北农业大学学报44(7)：11-162013年7月JournalofNortheastAgriculturalUniversityJtdy2013网络出版时间2013—7—1118：45：51[URL]http：／／www．cnki．net／kems／detail／23．1391．S．2013071l_1845．013．html大豆GinWRIla基因克隆及生物信息学分析王志坤，常健敏，李丹丹，李文滨(东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室(农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室)，哈尔滨150030)摘要：利用Phytozome数据

2、库、NCBI网站等软件对大豆(Glycinem)基因纽中WRI1同源基因进行生物信息学分析，发现大豆WRI1转录因子有2个拷贝，分布在第8和15号染色体上。以大豆未成熟种子cDNA为模板，克隆15号染色体WRI1转录因子的cDNA全长序列，命名为GmWRIla。应用生物学软件发现，GmWRIla蛋白含有2个AP2／EREBP结构域(60—225)。进化树分析表明，GmWRIla包含在第一个分支里，与AtWRI1距离较近，推断其与AtWRI1属于同源基因，具有相似的功能。对与GmwRI1a蛋白存在相互作用的蛋白进行预测分析，发现与其相互作用的蛋白多数参与

3、糖降解或质体脂肪酸合成，结果表明，GmWRlla转录因子可能在控制种子发育中时从糖到油的碳流动中起重要作用。关键词：大豆；GmWRIla基因；生物信息学；转录因子；含油量中图分类号：$565．1文献标志码：A文章编号：1005—9369(2013)07—0011-06王志坤，常健敏，李丹丹，等．大豆GmWRJ1a基因克隆及生物信息学分析【J】．东北农业大学学报，2013，44(7)：11-16．WangZhikun．ChangJianmin，LiDandan，eta1．CloningandbioinformaticsanalysisofGmWRI1ai

4、nsoybean[J]．JournalofNo~heastAgriculturalUniversitY,2013，44(7)：11-16．(inChinesewithEnglishabstract)CloningandbioinformaticsanalysisofGmWRI1ainsoybean／WANGZhikun，CHANGJianmin，LIDandan，LIWenbin(KeyLaboratoryofSoybeanBiologyinChineseMinistryofEducation(KeyLaboratoryofSoybeanBiology

5、andBreeding／GeneticsofChineseAgricultureMinistry)，NortheastAgriculturalUniversity,Harbin150030，China)Abstract：BioinformaticsofWRI1homologsinsoybeangenomewasanalyzedusingPhytozomedatabaseandNCB1website．TwocopiesofsoybeanWRI1homologswerefoundtodistributeonchro-mosome8and15，respect

6、ively．Weclonedonegeneonchrosome15，andnamedGmWRf1a．GmWRI1ainsoybeangenomehadtwoAP2，EREBPdomains．PhylogeneticrelaUonsresultsshowedthatGmWRIlaandAtWRl1hadtheclosestrelationship．Therefore．preservedthatGmWRI1agenewasamemberofaplantspecificfamilyoftranscriptionfactors(AP2／EREBP)thatsh

7、aredtwocopiesofDNA-bindingdomaincalledtheAP2domain．PutativetargetsofGmWRI1aencodedenzymesoflateglycolysis，thefattyacidsynthesispathway．Thus，GmWRI1awasputativelyanimportantroleinregulatorynetworkcontrollingoiIaccumulationinseeds．Keywords：soybean；GmWR『1agene；bioinformaticsanalysis

8、；transcriptionfactor；oilcontent植物脂肪代谢是维系其生命活动的基