pdz结构域的结构特点及其识别特异性配体的机制

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1、ISSN1007-7626中国生物化学与分子生物学报http://cjbmb．bjmu．edu．cn2011年12月CN11-3870/QChineseJournalofBiochemistryandMolecularBiology27(12):1107～1112·综述·PDZ结构域的结构特点及其识别特异性配体的机制1)2)3)*李华，林葵，吴更(上海交通大学生命科学技术学院，微生物代谢国家重点实验室，上海200240)摘要PDZ结构域作为介导蛋白质之间相互作用的重要结构域之一，参与到细胞内运输、离子通道、以及各种信号传导通路等多种生物学过程．PDZ结构域是由80～100个氨基酸组成的小

2、的球状结构域，对某些多PDZ结构域蛋白来说，需要一前一后形成串联体才能正确折叠．另外，PDZ结构域相互之间也可以形成同源或异源二聚体．这些PDZ结构域的突出特点是能特异性地识别配体靶蛋白C末端短的氨基酸序列，但有些也能识别靶蛋白的内部β发夹结构．而一些支架蛋白的PDZ结构域与细胞膜上脂类的相互作用则增加了其与膜的亲和性．本文简要概括了PDZ结构域的结构特点及其对配体的各种特异性识别的机制，从而为研究各种PDZ蛋白的功能提供了结构基础．关键词PDZ结构域;PDZ-PDZ二聚体;配体;内部序列中图分类号Q51StructuralCharacterizationofPDZDomainsandM

3、olecularMechanismofTheirRecognitionbySpecificLigands1)2)3)*LIHua，LINKui，WUGeng(SchoolofLifeSciencesandBiotechnology，StateKeyLaboratoryofMicrobialMetabolism，ShanghaiJiaoTongUniversity，Shanghai200240，China)AbstractPDZdomainsareoneclassofimportantprotein-proteinrecognitionmodulesthatregulatemultiple

4、biologicalprocessessuchasintracellulartransport，ionchannels，andvarioussignaltransductionpathways．PDZdomainsaresmallglobulardomainscomposedof80～100aminoacidresidues．SomePDZdomainsrepeatedinmulti-PDZproteinsneedtoconnectinatandemarrangementtofoldproperly．OtherPDZdomainscanalsobindtoeachothertoformh

5、omo-orhetero-dimers．ThesedomainsspecificallyrecognizeshortpeptidemotifsattheextremeC-terminaloftargetproteins，butsomedomainscanbindtointernalsequencesfoldedinaβ-hairpinstructure．TheinteractionsofPDZdomainsinsomescaffoldproteinswithmembranelipidsincreasetheiraffinitytomembrane．Thisreviewdiscussedt

6、hestructuralcharacterizationofPDZdomainsandthemolecularmechanismoftheirrecognitionbyspecificligands．TheseresultsprovideastructuralbasisforunderstandingthefunctionofPDZ-containingproteins．KeywordsPDZdomains;PDZ-PDZdimer;ligand;internalsequencePDZ结构域是介导蛋白质之间相互作用的重要的结构域之一．PDZ的名称来源于最早发现含有此收稿日期:2011-0

7、9-09;接受日期:2011-11-07国家自然科学基金项目(No．30900225，30821005，90919021);上海市教育结构域的3个蛋白质:Post-synapticdensityprotein-委员会科技创新项目(No．09ZZ23);上海市曙光计划(No．08SG11)95(PSD-95)、Discslarge(DLG)、Zonulaoccludens1*联系人Tel:021-34205914;E-mail:gen