浙贝母中内生菌的多样性及组成分析.pdf

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1、浙江中医药大学学报2014年9月第38卷第9期浙贝母中内生菌的多样性及组成分析彭三妹王博林路京丁志山袁小风浙江中医药大学杭州310053摘要：[目的】研究浙贝母器官内生茵群，以期探明浙贝母道地性的形成机制，为开发其潜在的内生茵资源提供理论依据。[方法]本实验用PCR一变性凝胶梯度电泳(DGGE)对浙贝母的根、鳞茎、地上茎以及叶中的内生茵多样性和组成进行了检测和分析。果】DGGE结果表明，浙贝母不同器官中的内生茵多样性和结构均有差异。根部条带明显比其它器官多，内生细菌多样性指数最高(2．69)，而且

2、出现不少特异性条带；茎中的细菌多样性为244；叶中最低，仅2．21。测序结果表明，浙贝母中的内生细菌主要为蓝细菌、根瘤茵、睾丸酮假单胞茵、伯克氏菌属和燕麦噬酸茵，后两种茵均为p一变形茵，该茵的存在可能会对浙贝母的生长产生不利影响，而根瘤茵和丛毛单胞茵则对其生长有利。根部特异性细菌包括蓝细菌(B4)、伯克氏茵属(B23)、根瘤茵(B5、B24)以及3种不可培养细菌(B6一B8)。与细菌相比，内生真菌DGGE图谱在不同器官之间的差异更小，大部分为共有条带，只是亮度有差异。当然也有特异条带，如曲霉属(F

3、1o)仅在鳞茎中出现。镰孢茵属(F11)以及2种不可培养的真菌(F5、F6)为根部特有。与细菌不同，地上茎中的真菌shannon指数最高(282)，其次是鳞茎和根，叶最低253。利用DGGE检测到浙贝母的内生真茵主要为侧齿霉、镰孢霉和曲霉，而利用传统方法还分离到交链孢霉、青霉、拟茎点霉、葡萄孢、卵形孢霉、枝链孢霉、毛壳菌、丝核茵以及束丝茵等属，说明对浙贝母而言，传统方法更适合。【结论1浙贝母不同器官中内生细茵和真菌的多样性及组成均存在差异，但地下鳞茎和地上茎差异较小；真菌的器官差异不如细菌明显。浙

4、贝母内生菌的分布跟其它植物明显不同，其茵群组成主要取决于浙贝母宿主植物本身。不同的内生茵占据不同生态位，执行不同功能，有的对促进浙贝母的生长，而有的则影响生长，其中侧齿霉属值得进一步研究。关键词：浙贝母；PCR—DGGE；内生细菌；内生真茵；Shannon指数；聚类分析中图分类号：R228．71文献标识码：A文章编号：1005-5509(2014)09—1091-07DiversityandStructureofEndophyteinVegetativeOrgansofFritilliathunb

5、ergiiPengSanmei，WangBolin，LuJing，etalZhejiangChineseMedi—colUniversity,Hangzhou(310053)Abstract：『ObiectivelAsakindofimportantmicroorganismresources，endophytescommunitiesinFritillariathunbehelpstoknowthemechanismofgeoherbhsmandfind~lentmicrobialresourc

6、es．[Methods】Hereweappliedpolymerasechainreaction—denaturedgradientgelelectrophoresis(PCR—DGGE)forstudyingthediversityandcompositionofendophytesinfourorgansofFthunberei．[Result]DGGEresultsshowedobviousdiferencesindiversityandstructureofendophyteinVeget

7、ativeOrgansofthunbeAmongtheseorgans，rootshowedthemostbandsandthehighestShannonindexofbacteria(2．69)，folowedbystem(2．44)andleaves(2．21)ThedominantendophyticbacteriawereThermosynechococcuselongatus，Rhizobium,Comamonastestosteroni．BurkholderiaandAcidovor

8、axavena．RhizobiumandComaDzona$testosteronmaybebeneficialtothegrowthofFthunbereii，whileBurkholderiaandAcidovoraxarenahadtheoppositeefectwhichbothbelongedtop—Proteobacteria．RootdemonstratedsomespecificendophyticbacteriaincludingCyanobacteria(B4)