1(1).实验一.ppt

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1、分子生物学其它常用实验仪器1.恒温摇床2.超净工作台3.高压灭菌锅4.高速台式离心机5.微量取液器实验一聚合酶链式反应(PCR)扩增DNA片段实验目的实验原理实验仪器、材料与试剂实验步骤实验结果与讨论实验目的掌握PCR反应的原理及技术实验原理聚合酶链式反应(polymerasechainreaction)简称PCR技术,是一种体外扩增特异DNA片段的技术;利用PCR技术可在短时间内获得数百万个特异的DNA序列的拷贝;PCR技术在分子克隆、遗传病的基因诊断等方面得到了广泛的应用。PCR技术实际上是在模板DNA、引物和4种脱氧核苷酸存在的条件下依赖于

2、DNA聚合酶的酶促合成反应。PCR技术的特异性取决于引物和模板DNA结合的特异性。PCR:变性-退火-延伸PCR(c)(b)引物25’3’3’3’5’5’(d)新引物5’3’靶DNA的扩增(a)5’3’引物13’5’3’5’引物2互补链引物1互补链单位长度的链不同长度的链5’3’3’5’引物1互补链引物2互补链目的片段(不同长度的链未示出)聚合酶链式反应示意图(e)(f)(g)反应分为三步:变性:在高温条件下,DNA双链解离形成单链DNA;退火:当温度突然降低时引物与其互补的模板在局部形成杂交链;延伸:在DNA聚合酶、dNTPs和Mg2+存在的条

3、件下,聚合酶催化以引物为起始点的DNA链延伸反应。以上三步为一个循环,每一循环的产物可以作为下一个循环的模板,几十个循环之后,介于两个引物之间的特异性DNA片段得到了大量复制,数量可达到106-107个拷贝。PCR技术的参数主要有7个:聚合酶、引物、dNTPs、反应buffer、二价离子、模板、一价离子。三、实验仪器、材料与试剂(一)仪器1.PCR仪2.台式离心机3.微量取液器4.紫外荧光观测仪5.高压灭菌的微量离心管6.DNA扩增系统7.琼脂糖凝胶电泳系统(二)材料模板DNA:800bp的片段插入在pEASY-T1载体(或pMD18-T或KS载

4、体)(三)试剂1.10×PCRbuffer2.dNTPs:2.5mM×43.Taq酶:5U/µL4.引物1和2(M13F,M13R):2μmol/LpMD18-TVector四、实验步骤1.在0.2mlEppendorf管内配制25μl反应体系:ddH2O:18.25µl(25-6.75)×710×PCRbuffer:2.5µl×7dNTPs(2.5mM×4)2µl×7M13-F(10µM):0.5µl×7M13-R(10µM):0.5µl×7Taq酶:0.25ul×7模板:1µl/每管注:做一管阴性对照,即模板为灭菌的双蒸水2.按下述循环程序进

5、行扩增94℃5(3)分钟,1个循环;94℃30秒,58℃30秒,72℃1分25秒;30个循环;72℃延伸10分钟。4℃保温。3.扩增结束后,取全部PCR扩增产物进行1%的琼脂糖电泳,检测扩增情况、分析结果。并在紫外灯下切割扩增的琼脂糖胶块中的DNA片段、放入Eppendorf管中。4℃冰箱存放,用于回收。五、实验结果与讨论PCR体系的调制过程中应尽量减少污染的机会,以免出现目的条带以外的杂带。如退火温度过低,也可能出现杂带。12345678910111213M使用3mg的DNAMarkerDL2,000(500ng/条带)进行1%的琼脂糖凝胶电泳

6、后,各DNA条带自上至下分别为2kb,1Kb,750bp,500bp,250bp,100bp。注意事项PCR反应是在一个在没有DNA污染的干净环境中进行。一般而言,只要能够得到可靠的结果,模板纯化的方法越简单越好。要使用新配制的或适当贮存的未使用过的试剂或缓冲液来提取核酸,不要使用以前用于别的样品的试剂。所用的所有溶液都应该没有核酸和核酸酶的污染。配制试剂,操作样品,建立反应和以后的检测扩增产物过程中最好都使用手套。所有PCR试剂中使用的水都应该用新鲜蒸馏的去离子水,高压灭菌后分装备用。所有试剂都应该以大体积配制,试验一下是否满意,然后分装成小份

7、以确保实验间的连续性。所有试剂或样品准备过程中都要使用一次性灭菌的塑料瓶和离心管,玻璃器皿应洗涤干净并高压灭菌。PCR样品应在冰浴上化开,并且要充分混匀。扩增反应应当设计不加模板的阴性对照,电泳时应当加标准DNA分子量标记(Marker)以估计产物的大小。琼脂糖凝胶电泳对DNA分子的检测,主要基于在凝胶中加入溴化乙锭,这样溴化乙锭分子就会嵌入DNA分子中形成络合物,使DNA在紫外光下发射很强的荧光,而在紫外光下DNA发出的荧光是可见光。在溴化乙锭足够的情况下,荧光的强度正比于DNA的含量,因而DNA的检测很方便。如将已知大小和浓度的标准样品(Ma

8、rker)作电泳对照,就可估计出待测样品的大小和浓度。1.琼脂糖2.TAE电泳缓冲液(50×):Tris242g,冰醋酸57.1ml,0

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