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时间:2020-01-17
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1、第八章基因重组与基因工程基因工程:按人为的设计,通过基因克隆技术有目的地改造基因,改变生物遗传性状的系列过程称为基因工程(geneticengineering)。基因工程就是要改造DNA,涉及DNA序列的重新组合和建造,其核心即是人工的DNA重组。DNA重组:不同来源的DNA分子通过末端共价连接形成重新组合的DNA分子的过程称为DNA重组(DNArecombination)。基因克隆(DNA克隆):是指在体外对DNA分子按照既定的目的分离、剪切和重新连接,构成重组的DNA分子,然后把它导入宿主细胞,使其在宿主细胞内扩增,从而获得该DNA分子的大量拷贝。由于此克隆技术是
2、在分子水平上进行的,故又称为分子克隆(molecularcloning)。基因工程、蛋白质工程、酶工程共同构成当代新兴的学科领域——生物技术工程。第一节工具酶限制性核酸内切酶(restrictionendonucleases)DNA连接酶(DNAligase)DNA聚合酶(DNApolymerase)末端脱氧核苷腺转移酶(terminaldeoxynucleotidyltransferase,TdT)一、限制性核酸内切酶(restrictionendonucleases)又称限制性内切酶,简称为限制酶,能识别双链DNA分子内部的特异位点并裂解磷酸二酯键。5’AACGT
3、TCGAAGCTTTAGGCCCGAT3’(一)限制酶的命名与分类限制酶常以4个字母命名,第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第二、三个字母是细菌的种名,用小写;第四个字母代表株名。另外用罗马字代表同一菌株中不同限制酶的编号。如HindⅢ的H代表Haemophilus属,in代表influenzae种,d代表Rd菌株,Ⅲ代表该菌株中第三个被分离到的限制酶。限制性核酸内切酶分为Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ型,基因克隆中所用的限制酶是Ⅱ型酶。(二)Ⅱ型限制酶的识别和切割位点Ⅱ型酶的识别序列通常为4~6bp,具有回文结构(palindrom),大多数酶是错位切割双链DNA,产生5′或3
4、′末端突出的粘性末端(stickyend)。如EcoRI切割后产生5′末端突出的粘性末端;5′-G↓AATTC-3′5′-G5′AATTC-3′3′-CTTAA↑G-5′3′-CTTAA5′G-5′PstI切割后产生3′末端突出的粘性末端:5′-CTGCA↓G-3′5′-CTGCAG-3′3′-G↑ACGTC-5′3′-GACGTC-5′还有一些酶沿对称轴切割DNA,产生平端或钝端(bluntend)。如SmaI:5′-CCC↓GGG-3′5′-CCCGGG-3′3′-GGG↑CCC-5′3′-GGGCCC-5′有些限制酶识别序列不同,但切割DNA后产生相同类型的粘性
5、末端,这些酶称为同尾酶(isoaudamers),如BamHI(G↓GATCC)和Sau3AI(N↓GATCN)。由此产生的粘性末端称为配伍末端(compatibleend),可进行相互连接,在DNA重组中具有更大灵活性。二、其他工具酶1.DNA连接酶(DNAligase):催化DNA片段之间的3’-5’磷酸二酯键的形成。2.DNA聚合酶:基因克隆中常用的DNA聚合酶有大肠干菌DNA聚合酶、Klenow片段和T4DNA聚合酶。3.末端脱氧核苷腺转移酶:将dNTP逐一加到DNA的3’-OH上。三、目的基因在基因工程中,欲要克隆的基因或要表达的基因称为目的基因,又称为目的
6、DNA(targetDNA)。包括cDNA和基因组DNA(genomicDNA)。第二节基因载体外源DNA本身没有自主复制能力,导入宿主细胞后不能随宿主细胞的繁殖而复制,达不到使外源DNA片段扩增的目的。如果要将外源DNA导入宿主细胞进行扩增或表达,就需要将外源DNA与某种能在宿主细胞中进行自主复制和表达的DNA重组,并由其携带进入宿主细胞。这种可以用来插入外源DNA片段构建重组DNA分子,并将外源DNA携带进入宿主细胞并进行复制的DNA称为基因克隆载体,简称为载体(vector)。可充当克隆载体的DNA分子有质粒DNA、噬菌体DNA和病毒DNA。一、质粒(一)质粒D
7、NA的生物学特性①质粒(plasmid)是一些染色体外的环形双链DNA分子;②质粒主要发现于细菌、放线菌和真菌细胞中,大小从1kb至200kb不等;③具有自主复制能力,能在子代细胞中保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息。④由质粒产生的表型含有对抗生素的抗性基因,可供筛选用。⑤有共价闭环DNA、开环DNA、线状DNA三种存在形式(二)良好载体应具备的条件分子量相对较小,能在细菌内稳定存在,有较多的拷贝数;具有可供选择的遗传标志,便于对宿主细胞进行识别和筛选,如抗生素的抗性基因、lacZ’等;带有尽可能多的限制酶单一酶切位点,即多克隆位点(multi
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