临床医学论文肿瘤抗原MAGE

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1、临床医学论文■肿瘤抗原MAGE作者：张秀敏，隋延仿，罗二平，李增山，黄亚渝，司少艳[Abstract】AIM:TopredicttheHLAA2restrictedcytotoxicTlymphocyte(CTL)epitopesoftumorantigenMAGEAsubfamilysoastoprovideappropriateCTLepitopefortumorimmunotherapy.METHODS:TheCTLepitopesoftumorantigenMAGEAsubfamilywerepredictedbySYFPEITHIpredictionmetho

2、dcombinedwiththepolynomialmethod・TheaminoacidsequenceandthecandidateCTLepitopesofthememberofMAGEAsubfamilywereanalyzedbyDNAstarsoftware.RESULTS:FiftyHLAA2rcstrictcdCTLepitopecandidates(nonamers)derivedfromthetumorantigenMAGEAsubfamilywereselectedandsomeepitopeswerehighlysimilarorcomplete

3、lyidentical・CONCLUSION:ThecombinationofSWEITHIpredictionmethodandpolynomialmethodcanimprovethepredictionefficiencyandaccuracy.AnalyzingthehomologyofCTLepitopesandfindingcommonepitopeshelptodevelopsomepromisingantigenpeptidetumorvaccines・・[Keywords]antigens,neoplasms;MAGEAsubfamily;Tlymph

4、ocytes,cytotoxic;epitopes;forecasting;sequenceanalysis【摘要】目的：预测肿瘤抗原MAGEA亚家族的HLAA2限制性CTL表位，为肿瘤治疗选择合适的CTL表位提供依据•方法：用SYFPEITHI超基序法远程预测系统和量化基序多项式结合的预测方法进行HLAA2限制性CTL表位预测，采用DNAstar软件提供的蛋白质核酸序列编辑、分析工具，对MAGEA亚家族成员进行CTL序列同源性分析・结果：共预测出了50个HLAA2限制性CTL表位，且部分CTL表位高度相似或一致・结论：SYFPE1TH1超基序法和量化基序多项式法结合的

5、预测方法是一种高效、准确的表位预测方法，结合CTL表位的同源性分析，可为肿瘤治疗性疫苗的制备中选择合适的CTL表位提供依据.【关键词】抗原，肿瘤；MAGEA並家族；T淋巴细胞，细胞毒性；表位；预测；序列分析0引言肿瘤抗原是指细胞在癌变过程中出现的特异性抗原物质的总称，是肿瘤治疗的主要靶分子・MAGE作为人类肿瘤特异性抗原，在肿瘤生物治疗及肿瘤疫苗的硏制方面发挥着重要作用•近年硏究发现在不同肿瘤或同一肿瘤中MAGEA亚家族成员的表达上存在差异〔1〕，仅诱发针对单一MAGEA亚家族成员的CTL反应并不能杀伤所有肿瘤细胞•我们利用CIL表位预测的最新方法对MAGEA亚家族成员

6、的HLAA2限制性CTL表位进行预测，并用DNAstar软件对预测出的CTL表位进行分析，旨在寻找其共有表位及相似表位，为进一步硏制更具广谱性的肿瘤疫苗奠定基础.1材料和方法11材料MAGEA家族序列：MAGE1，MAGE2，MAGE3，MAGE4，MAGE6，MAGE8，MAGE9，MAGE10，MAGE11，MAGE12编码蛋白氨基酸全长序列(由Genbank获得).12方法121SYFPE1TH1超基序法远程预测CTL表位我们拟预测由9个氨基酸残基组成的CTL表位，具体方法：利用Intenet网络进入SYFPETTHI主页(www.unituebingen.de/

7、uni/kxi),参照文献〔2,3〕介绍的方法,对MAGEA亚家族成员HLAA2限制性CTL表位进行远程预测.122候选表位限制性抗原肽多项式方案分析当某残基R出现在某肽的第一位时，在不考虑其他肽序列的情况下,该残基对于整个肽与MHC1类分子的结合自由能提供了一个常量Ri,用在第I位为残基R大量多肽的抑制浓度(Inhibitingconcentration,IC)IC50的负loglO値的平均値来估计此常量〔4〕•分别将初步预测的九肽氨基酸残基对应的Ri値相加，选择分値大于选定阈値的抗原肽作为可能的候选肽•本硏究选择阈値为・23・123利