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1、刚地弓形虫棒状体蛋白10的生物信息学分析刘荣荣张进顺张晓磊刘楠贾晓晖王璐瑶河北北方学院病原生物学与免疫学研究所摘要：目的对刚地弓形虫棒状体蛋口10(TgROPIO)进行生物信息学预测，分析其免疫原性。方法运用生物信息学在线分析程序ProtParanixSOSUI、ProtScalcxTMHMM、SignalP-4,kTargetPl.lServer>SOPMA、MotifScan>SWISS-MODEL、SYFPEITHI和Bcepred等并结合牛物信息学软件DNASTAR和DNAMAN分析预测TgROPl0的理化性质、可溶性、亲疏水性、跨膜结构域、信号肽、胞内定位、二级
2、结构、蛋白翻译后修饰位点、三级结构、柔韧性、表面可及性和B细胞、T细胞抗原表位等。结果TgROPIO蛋口由586个氨基酸组成，分子式为C2562H4045N7390964S9,分子质量单位(Mr)为60.91221X103,理论等电点为4.19,吸光度值为0.476,半衰期为30h,不稳定系数为55.56,脂溶性指数为56.25,总平均亲水性系数为-0.699,属于亲水性蛋白；该蛋白无跨膜结构区域，信号肽切割位点在22-23位氨基酸Z间，亚细胞定位预测可能是分泌蛋白；二级结构中Q螺旋和B折叠分别占26.79%和13.31%,B转角和无规则卷曲分别占6.48%和53.41%
3、,有6种翻译后修饰位点，15个B细胞抗原表位，3个CTL细胞抗原表位，12个Th细胞抗原表位，28个亲水性参数得分1.9的区域，15个柔韧性参数得分2.0的区域，27个表面可及性参数得分1.9的区域，3个暴露表面参数得分2.3的区域。结论生物信息学预测TgROPl0含多个抗原表位，具有免疫原性，可作为弓形虫疫苗备选蛋白。关键词：刚地弓形虫;TgROPIO;生物信息学;免疫原性;作者简介：张进顺，E-mai1:bfxyzjs@126.com作者简介：刘荣荣(1990-)，女，河北石家庄人，硕士，主要从事寄生虫分子生物学研究。E-mail:944921573@qq.com收稿
4、日期：2017-05-09基金：河北省自然科学基金项目(NO.H2013405091)Bioinformaticanalysisofrhoptryprotein10ofToxoplasmagondiiLIURong-rongZHANGJin-shunZHANGXiao-leiLIUNanJIAXiao-huiWANGLu-yaoPathogenBiologyandImmunologyResearchInstitute,HebeiNorthUniversity;Abstract：ObjectiveTobioinformaticallyanalyzetherhoptrypro
5、tein10ofToxoplasmagondii(TgROPIO)inordertoanalyzeitsimmunogenicity.MethodsThephysico-chemicalpropertics,solubility,hydrophilicityandhydrophobicity,transmembranedomains,signalpeptides,intracellularlocalization,secondarystructure,posttranslationalmodificationsites,tertiarystructure,flexibil
6、ityandsurfaceaccessibility,andspecificepitopesofTgROPIOwereanalyzedandpredictedwithbioinfonnaticsoftwaresuchasProtParam,SOSUI,ProtScale,TMHMM,SignalP-4.1,TargetPl.IServer,SOPMA,MotifScan,SWISS-MODEL,SYFPE1TH1,Bcepred,DNASTAR,andDNAMAX.ResultsTgROPIOconsistsof586aminoacidswithamolecularfor
7、mulaof2562H4045N7390964S9,amolecularweightof60.91221X103,atheoreticalisoelectricpointof4.19,anabsorbaneecoefficientof0.476,anestimatedhalf-lifeof30h,aninstabilityindexof55.56,analiphaticindexof56.25,andagrandaverageofhydropathicityof-0.699.TgROPIOisahydrophilicprote
