坛紫菜Mn-sod 的克隆与分析【开题报告+文献综述+毕业设计】

坛紫菜Mn-sod 的克隆与分析【开题报告+文献综述+毕业设计】

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1、本科毕业论文系列开题报告海洋生物资源与环境坛紫菜Mn-sod的克隆与分析一、选题的背景与意义1、背景紫菜是目前世界上人工养殖经济价值最高的海藻之一,全世界年总产值接近20亿美元,约占人工养殖海藻的2/3,我国的紫菜产量位居世界首位[1]。坛紫菜(Porphyrahaitanensis)属于红藻门红毛菜科紫菜属,为我国特有的暖温带性海藻,是我国两个主要紫菜栽培品种之一。坛紫菜原产于福建,在闽、浙、粤沿海地区被广泛栽培,其产量约占全国紫菜总产量的75%[1]。超氧化物歧化酶(superoxidedismutase,SOD)是一种广泛存在于生物体内的重要的氧自由基清除剂,与铜(Cu)、锌(Zn)、铁

2、(Fe)、锰(Mn)等微量元素(taceelements)代谢有密切关系。根据其活性中心结合的微量元素的不同,SOD主要分为3种类型:Cu/Zn-SOD、Fe-SOD和Mn-SOD。SOD能够平衡机体的氧自由基,从而避免当机体内超氧阴离子自由基浓度过高时引起的不良反应,在防辐射、抗衰老、消炎、抑制肿瘤和癌症、自身免疫治疗等方面具有独特的功能,因而受到国内外学者和研究者的广泛关注。目前,对SOD的研究已涉及到化学、生物学、医学、食品科学和畜牧兽医学等多个学科[2,3,4]。坛紫菜的基因组特性使其成为研究海洋藻类的模式物种,具有较高的科学研究价值,具有丰富飞营养价值,使其成为重要的经济藻类。尽管坛

3、紫菜的科学和经济价值已经逐渐被人们认识,但是目前只有少数几个基因被克隆,其功能基因的研究还处于起始阶段,其分子生物学研究还有待深入开展。2、意义海洋养殖业是我国海洋经济的支柱产业之一。目前,我国的大型海藻养殖产量居世界第一位。超氧化物岐化酶在植物抗逆防御中具有重要作用,克隆坛紫菜Mn-SOD基因cDNA及基因组DNA全长序列,并进行序列特性相关分析,为研究紫菜抗逆的分子机制,进行抗性育种奠定基础,为下一步研究该基因的表达模式与环境变化的相关性和紫菜抗性育种奠定了基础,有利于推动紫菜产业的持续健康发展。14二、研究的基本内容与拟解决的主要问题:基本内容:本研究从坛紫菜的叶状体cDNA中,经PCR

4、扩增得到了Mn-SOD基因cDNA及基因组DNA全长序列,将它们与GenBank中其他物种的Mn-SOD进行了同源性比较与分析,分析ORF、氨基酸序列、蛋白结构和系统进化等,为进行该基因的功能验证提供实验基础。重点难点:Mn-sod基因cDNA及基因组DNA全长序列的获得。三、研究的方法与技术路线:提取坛紫菜RNA逆转录成cDNA设计特异性引物cDNA为模板,用引物扩增得到核心片段用RACE技术获得cDNA全长序列分析ORF、氨基酸序列和蛋白结构等用GenomeWalking技术获得Mn-sod基因全序列四、研究的总体安排与进度:2010.06-2010.09查阅文献,熟悉实验操作。2010.

5、10-2010.11开题报告,综述等撰写2011.02-2011.03提取紫菜RNA,设计引物,获取Mn-sod基因核心片段和全长序列等。2011.03-2011.04实验数据的整理分析以及对整个试验的补充、完善。2010.04-2010.05撰写论文,结题、答辩。五、主要参考文献:[1]方允中,李文杰.自由基与酶—基础理论及其在生物学和医学中的应用[M].北京科学出版社,1994.[2]WEJTASZEKP.Oxidativeburst:anearlyplanttopathogeninfection[J].BiochemJ.1997,(322):681~692.14[3]MannT,Keil

6、inD.Haemocupreinandhepatocuprein,copper-proteincompoundsofbloodandliverinmammals[J].ProRSocB.1938,(126):303~315.[4]McCordJM,IrwinFridovich,Superoxide:Anenzymaticfunctionforerythrocuprein(hemocuprein)[J].JBiolChem,1969,(244):6049~6055.[5]李东旭,吴蕾,任云霞.超氧化物歧化酶的提取和纯化技术研究进展[J].食品研究与开发,2008,29(3):183~185[6]

7、胡滨,赵艳丽,吴兆亮.大肠杆菌发酵生产SOD最佳条件研究[J].生物技术,2002,12(3):144~146.[7]GuiXF,YangP,QiuYX.StudiesonthepreparationandthestabilityofSODmodifiedbyLaurieacid[J].WuhanUniversityJournalofNaturalSciences,2003,3(2):247~25

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