荧光引物扩增AMG基因鉴定古代人骨遗骸的性别

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1、第42卷第1期2004年1月VoL42No.1Jan2004吉林大学学报(理学版)JOURNALOFJILINUNIVERSITY(SCIENCEEDITION)研究简报荧光引物扩增AMG基因鉴定古代人骨遗骸的性别刘树柏】,崔银秋谢承志朱泓2,周慧】』(1.吉林大学生命科学学院,长春130023;2.吉林大学边鴉考古中心考古DZA实验室・长春130023)摘要:建立一种用荧光标记引物扩增AMG基因的性染色体同源片段方法,对古代人骨遗骸进行性别鉴定.用其测定5个古代遗骸的性别,其结果与形态学结果一致・关键词:性别鉴定;聚合酶链

2、式反应;AMG基因;荧光标记引物中图分类号:Q987文献标识码:A文章编号:1671-5489(2004)01-0139・04SexidentificationofarchaeologicalhumanremainsbasedonamplificationofAMGgeneviafluorescent-labeledprimersLIUShu-bai1,CUIYin-qiu1*2,XIECheng-zhi1,ZHUHong2,ZHOUHui12.(1・CollegeofLifeScienceJilinIJniversity•

3、Changchun130023.China;2・CenterofBorderArchaeologyAncientDNALaboratory•JilinUniversity•Changchun1300239China)Abstract:Asensitiveandreliablemethod,basedontheamplificationofAMGgenebyfluorescent・labeledprimers,wasestablishedtoidentifythesexofarchaeologicalhumanremains.

4、Usingthismethod,thesexwasdeterminedforfiveskeletalremains,andtheresultsareconsistentwiththoseofmorphologicaljudgment・Thissensitiveandreliablemethodhasahighvalueinforensicmedicine>anthropologyandarchaeology.Keywords:sexidentification;polymerasechainreaction(P(:R)$am

5、elogeningene;fluorescent-labeledprimers在考古学研究中,性别鉴定对重新构建古代社会的社会结构有着龜要作用.传统人类学上骨骼的性别特征一般通过形态学分析确定,然而,对于那些成人骨骸碎片和儿童或婴儿遗骸,这些常规的人类学测定方法则无法使用.对于X和(或)Y染色体上的特异序列的DNA分析可提供一个理想方法.聚合酶链式反应(PCR)是一种敏感的方法,但古代DNA研究极易受到一些无关个体(在考古地点和实验室内的)的污染、古代DNA的高度降解和不明起源的PCR反应抑制剂的存在等限制〔2】.以DNA为

6、基础的人骨遗骸性别鉴定最早用扩增Y染色体待异序列进行⑶.如果出现特征性片段,表明个体为男性,岀现阴性结果,则常常被解释为女性,但这一结果也可能是由于DNA的保存质量不好所致・对Amelogenin基因(AMG,牙釉蛋白的编码基因)在X,Y染色体上的同源片段的差异进行扩增可以很好地解决这个问题,因为对X染色体上片段的扩增可提供一个内在的阳性对照⑶.AMG基因的第一个内含子在性染色体的同源片段中有儿处序列差异点,目前大部分性别鉴定的研究是针对其中一个189bp的删除区域⑷.然而,这个方法要求相对大量非降解的DNA模板.对于古代D

7、NA,一个收稿日期:2003-09-03.作者简介^刘树柏(1978〜八男.硕士研究生.从爭考古DNA研究.E-mail:Liushubai^hotmail.com-联系人:周急(1954〜).女・博士•教授.博士生导师.从爭分子进化研究.E-mail:Zhcuhui@mail.jlu.edu.cn・基金项目:国家自然科学基金特殊研究项目(批准号:J0030094).基于扩增AMG基因小片段的PCR反应则更为合适・本研究使用一对荧光标记的待异性引物,对AMG基因的内含子1在X,Y染色体同源片段中的部分序列进行扩增,以此来鉴定

8、个体性别•此方法灵敏度高、简便、准确,对于高度降解DNA样本的分析,比如对法医学及古代样本有很大的实用性•1材料与方法1.1材料样本由新疆文物考古研究所提供,共有5个个体的上肢骨・由于当地气候干燥少雨,样本保存良好(见表1〉・Table1Theancientsampleusedinthes

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