小细胞肺癌全基因组测序研究_程颖

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1、2016年2月循证医学Feb.2016第16卷第1期TheJournalofEvidence-BasedMedicineVol.16No.1·循证评价·小细胞肺癌全基因组测序研究1评价者：程颖2文献合成者：苟兰英（1.吉林省肿瘤医院，长春130012；2.广东省人民医院肿瘤中心、广东省医学科学院、广东省肺癌研究所，广州510080）程颖，主任医师，二级教授，博士研究生导师，享受国务院特殊津贴，卫计委有突出贡献中青年专家。现任吉林省肿瘤医院院长、吉林省肿瘤研究所所长、吉林省抗癌协会理事长；中国抗癌协会常务理事，中国临床肿瘤学会（CSCO）副理事长、CSCO小细胞肺癌专家委员会主任委员、中国抗癌协

2、会肺癌专业委员会副主任委员、中国抗癌协会肿瘤临床化疗专业委员会副主任委员、中华医学会肿瘤学分会委员、全国医师定期考核肿瘤专业编辑委员会副主任委员、中国医师协会肺癌专业委员会副主任委员、吉林省医师协会肿瘤医师分会主任委员、吉林省医学会肿瘤专业委员会主任委员等。担任《中华肿瘤杂志》、《中华肿瘤防治杂志》、《中华临床医师杂志（电子版）》、《临床肿瘤学杂志》、《实用癌症杂志》、《中国肺癌杂志》、《肿瘤研究与临床》等20余本杂志的常务编委或编委。在国内外发表论文150余篇，主编专著5部，承担国家及省市科研课题49项，包括国家十二五、十一五重大科技攻关、863、国家自然科学基金在内多个科研课题。获得吉林省

3、科技进步一等奖1项，吉林省自然科学学术成果一等奖2项，吉林省科技进步二等奖3项、三等奖3项。［关键词］小细胞肺癌；全基因组测序；TP53；RB1；ComprehensivegenomicprofilesofsmallcelllungTP73；NOTHCcancer［J］.Nature，2015，524（7563）：47-53.［中图分类号］R734.2研究二：NiederstMJ，SequistLV，PoirierJT，［文献标识码］Aetal.RBlossinresistantEGFRmutantlungDOI：10.12019/j.issn.1671⁃5144.2016.01.009ade

4、nocarcinomasthattransformtosmall⁃celllungComprehensiveGenomicProfilesofSmallCellLung1cancer［J］.NatCommun，2015，6：6377.Cancer//Reviewer：CHENGYing，LiteratureCo⁃worker：GOULan⁃ying22证据水平Keywords：smallcelllungcancer；whole⁃genesequencing；TP53；RB1；TP73；NOTHC2b。Reviewer’saddress：JilinCancerHospital，Changchun

5、3背景130012，China研究一：小细胞肺癌（smallcelllungcancer，1文献来源SCLC）患者很少接受手术治疗，因此用于基因组研究一：GeorgeJ，LimJS，JangSJ，etal.学研究的肿瘤组织有限。既往有小样本研究采程颖，等.小细胞肺癌全基因组测序研究33用全外显子测序的方法发现了少量的基因改变。•研究条件：德国科隆大学翻译基因组学研研究二：有个案报道EGFR突变的非小细胞肺究中心和病理科。癌（non⁃smallcelllungcancer，NSCLC）耐药后转化•研究对象：来自于多个研究所的152例Ⅰ~为SCLC，同时在其他小样本研究中再活检证实了Ⅳ期SCLC患

6、者的肿瘤标本。SCLC大鼠模型：SCLC的存在，但其分子机制目前尚不明确。TRP53、RB1二联基因敲出（DKO）和TRP53、RB1、RB2三联基因敲出（TKO）。4目的•研究方法：全基组测序和全外显子测序。研究一：探索SCLC全面而复杂的基因改变•干预措施：将SCLC患者肿瘤标本-80℃保图谱。存，提取DNA进行全基因组测序和全外显子测研究二：明确EGFR突变的NSCLC耐药后转序；取DKO和TKO大鼠模型的肿瘤进行全基因组化为经典SCLC的分子机制。和全外显子测序。•研究流程：见图1。5研究设计•评价指标：110例患者肿瘤的全基因测序数研究一：据主要分析反复出现的突变基因。大鼠肿瘤基因图

7、1小细胞肺癌基因图谱分析和既往人工构建的SCLC大鼠模型GEMM和数据瘤标本原代培养形成。库CancerGeneCensus14COSMIC的SCLC突变基•研究方法：二代测序、CGH、qPCR和IHC方因进行对比。法比较耐药后SCLC和耐药前NSCLC的分子特点。研究二：•干预措施：在EGFR突变的细胞中敲除RB1•研究条件：美国麻省总医院肿瘤中心和美基因；BCL2靶向药物干预转化为SCLC的细