基因操作原重难点总结

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1、基因操作原理重难点总结1・基因操作中常用工具酶是哪些?各有什么用处?答:基因操作中最常用的修饰酶有:(1)内切酶和外切酶:识别特定的DNA序列,切割单链或双链,产生黏性末端或平末端,与伴生的甲基化酶一起形成I、II、III三种限制修饰系统。英中基因操作中最常用的是II型系统,它们识别回文对称序列,在序列内部或附近切割DNA,产生带3=疑基和磷酸基团的DNA产物,需Mg时的存在才能发挥活性,相应的修饰酶只需SAMo(2)甲基化酶(每一种限制性内切酶都对应一种甲基化酶):甲基化酶可在其识别位点内引入甲基,用

2、于保护DNA不被相应的限制酶所切割。通过甲基化修饰还可产生新的酶切位点。Dam甲基化酶可在GATC序列小的腺嚓吟N6位置上引入甲基。Dem甲基化酶识别CCAGG或CCTGG,在第二个胞圧密旋C的C5位置上引入甲基。(3)连接酶:®T4DNA连接酶可以催化DNA5-磷酸和丁-OH之间形成磷酸二酯键,用于DNA的粘性末端和平末端连接;②E.coliDNA连接酶作用需NAD'的参与,常用于DNA的.粘性末端连接和eDNA克隆;③T4RNA连接酶可以催化ssDNA或RNA的5»磷酸与另一ssDNA或RNA的3-

3、0H之I'可形成共价连接,可用于标记DNA和RNA的歹末端,单链DNA或RNA的连接;©TaqDNA连接酶:可在两个寡核营酸之间进行连接反应,同时必须与另一DNA链形成杂交体,相当于连接双链DNA中的缺口,需NA。可用与检测等位基因的变化及在PCR扩增中引入寡核昔酸,但不能替代T4DNA连接酶。(4)DNA聚合酶(依赖于DNA的DNA聚合酶):大肠杆菌DNA聚合酶I具有三种活性:5,->3QNA聚合酶活性;5J3吻、切核酸酶活性;3J5外切核酸酶活性。利用其5J3,外切核酸酶活性可用切口平移法标记DNA

4、;用于克隆eDNA中的第二链;对3一突出末端的DNA作末端标记。用蛋白酶将大肠杆菌DNA聚合酶1裂解形成的KlenowDNA聚合酶具有聚合活性和外切核酸酶活性,可补平有3,凹端的DNA或抹平3,凸端,还可对DNA进行末端标记,在eDNA克隆中合成第二链。T4噬菌体DNA聚合酶与KlenowDNA聚合酶相似,只是外切核酸酶活性更强,在诱变反应中很有用。T7噬菌体DNA聚合酶与T4DNA聚合酶活性类似,是所有DNA聚合酶中持续合成能力最强的一种,可用于长模板的引物延伸。耐热DNA聚合酶:如TaqDNA聚合酶

5、、VentDNA聚合酶、PfuDNA聚合酶等,来自嗜高温细菌,主要用于PCR反应。(5)T4多核百酸激酶(PNK):—种磷酸化酶,可将ATP的Y-磷酸基团转移至DNA或RNA的5’末端。该酶主要用于对缺乏磷酸的DNA或合成接头进行磷酸化(消耗ATP),同时可对末端进行标记(先去磷酸化ADP-ATP,再磷酸化ATP—ADP)O(6)碱性磷酸酶(如小牛肠碱性磷酸酶,CIP):该酶催化去除DNA或RNA的弘磷酸,防止DNA片段的自身连接。用该酶后要进行纯化,避免残留。(7)末端脱氧核昔酸转移酶:源于小牛胸腺的

6、一种不寻常DNA聚合酶,可不依赖于模板。在2价阳离子存在下,该酶催化dNTP加于DNA分子的3学仝基端。若dNTP为T或C,阳离子首选C<>2+;若dNTP为A或G,阳离子首选MS2+o该酶可在eDNA或载体3,末端加同聚尾,便于克隆;也可用标记的rNTP>ddNTP或ddNTP来标记DNA片段的3,末端。(8)反转录酶即依赖于RNA的DNA聚合酶:有◎孑合成DNA活性,但是无-►3,5,外切核酸酶活性,该酶主要用来eDNA克隆中第一链的合成、测定mRNA转录起始点、5,突出DNA的补平和标记、双脱氧终

7、止法测序、RT-PCR等。该酶有两种来源:AMV(禽成髄细胞瘤病毒)反转录酵!具亍孑合成DNA活性和RNaseH活性;Mo-MLV(鼠白血病病毒)反转录酶。(9)依赖于DNA的RNA聚合酶(Sp6、T7和T4噬菌体RNA聚合酶):该酶为转录中的RNA合成酶,识别DNA中各自特异的启动子序列,无需引物。用于单链RNA探针;合成mRNA用于体外蛋白质合成。(10)核酸酶:①Bal31核酸酶:主要活性为3,外切核酸酶活性(Ca2j,可从线性DNA两条链的3,端去除掉单核哥酸,达到两头缩短DNA的目的,用于缺失

8、突变,构建嵌套缺失体;也可用来制作DNA限制酶切图;确定DNA二级结构和从单链RNA±去除核昔酸。②S1核酸酶:可降解单链DNA或RNA,是一种单链核酸酶。产生带5-磷酸的单核首酸或寡核苛酸双链,可用于分析DNA:RNA杂交体的结构,去掉突出的单链尾以产生平末端;降解发夹结构。③绿豆核酸酶:与S1核酸酶相似,但更温和。④脫氧核糖核酸酶1:可优先从陀旋核哥酸的位置水解dsDNA或ssDNA。可在切口平移标记时在dsDNA±随机产生切口;在闭环

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