微阵列比较基因组杂交技术及其应用

微阵列比较基因组杂交技术及其应用

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1、万方数据国匾遣佳堂盘查垫塑生丝旦!i旦筮丝鲞箜!翅!堕』堡!!盟垒E!:!!:!螋!。!!!:丝:盟!:兰微阵列比较基因组杂交技术及其应用张艳亮涂植光戴勇【摘要】基因组DNA拷贝数变化在许多人类疾病如肿瘤、遗传性疾病的发生发展中起重要作用。经典的细胞遗传技术(如核型分析和比较基因组杂交)由于分辨率低,只能检测较大的拷贝数变化。虽然荧光定量PCR和荧光原位杂交的分辨率大大提高了,但需要预先知道拷贝数变化的位置和类型,且一次只能分析少数位点,缺乏整体性。微阵列比较基因组杂交具有高分辨率、高灵敏度、高通量、自动化和快速等优点。能准确地检测微缺失、微复制

2、和扩增等基因组不平衡,精确地确定断裂点,并把结果直接定位于基因组上,为肿瘤、遗传性疾病及正常人群的基因组DNA拷贝数变化的检测和研究提供了一种有效的方法。【关键词】微阵列比较基因组杂交技术;基因组;拷贝数变化Array—BasedComparativeGenomicHybridizationandApplicationZHANGYan—liang,rUZhi—guang,DAIYong.(LaboratoryDepartment,ChongqingUniversityofMedicine,Chongqing400016,China)Corresp

3、ondingauthor:DAIyo昭.E—mail:daiyon922@yahoo.con.ca【Abstract】GenomicDNAcopynumberalterationsplayaveryimportantroleinpathogenesisanddevel-opmentofmanyhumandiseases,suchastumorsandgeneticdiseases.Onlylargecopynumberalterationscanbedetectedbyclassiccytogeneticmethodsduetotheirlimi

4、tedresolution.QuantitativefluorescentPCRandflu-orescenceinsituhybridizationrequirepriorknowledgeofthetypeandlocationofexpectedaberrationsandcanonlybeusedfortheanalysisofalimitednumberofchromosomallociatonetime.Array—basedcomparativege—nomichybridizationcandetectsinglecopyloss

5、,duplication,amplificationanddirectlylocatethesegeneticim—balancestogenomebecauseofitshighresolution,sensitivityandhigh-throughput.ItisaneffectivemethodfordetectinggenomicDNAcopynumberalterationsintumors,geneticdiseasesandnormalpopulation.【Keywords】Array—basedcomparativegenom

6、ichybridization;Genome;Copynumberalterations基因组DNA拷贝数变化(copynumberahera.tions,CNVs)在许多人类疾病如肿瘤、遗传性疾病的发生发展中起重要作用,也是这些疾病的细胞遗传学表现。为了深入研究CNVs与这些疾病的相关性,需要有高分辨率和准确的染色体分析方法。染色体显带已被运用了几十年,具有其高度的可靠性并成为染色体分析的金标准,但其分辨率低(约为5~10Mb),需要中期细胞,操作费时费力,结果需要有经验的细胞遗传学家进行分析判断⋯。虽然荧光原位杂交(fluorescencei

7、nsituhybridization,FISH)和荧光定量PCR(quantitativefluorescencep01.ymerasechainreaction,QF—PCR)的分辨率大大提高了,但需要预先知道待测CNVs的类型和位置,且一DOI:10.3760/cma.j.issn.1673-4386.2009.02.005作者单位:400016,重庆医科大学检验系通信作者:戴勇(E—mail:daiyon922@yahoo.con.cn)·综述·次检测,仅能对少数位点进行分析,缺乏整体性,不适合于基因组的筛查。比较基因组杂交(compara

8、—tivegenomichybridization,CGH)一次实验能对整个基因组进行筛查,能检测染色体的非整倍体、缺失、复制和扩增等,

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