人类埃柯病毒6的基因特征分析

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1、510预防医学情报杂志2012年7月第28卷第7期JPrevMedInf，July．2012，Vol.28，No.7【论著】人类埃柯病毒6的基因特征分析田炳均，丁峥嵘，陆林，汤晶晶，张杰，罗梅［摘要］目的对来自10个国家和中国4个省不同时间分离的69株ECHO6病毒VP1区基因特征进行分析。方法在GenBank，EMBL和DDBJ3个基因库中进行BLASTN搜索，共得到69株ECHO6病毒基因可用，用Mega软件计算病毒基因同源性并构建基因进化树。结果69株ECHO6病毒可分为4个基因型(基因型A～D)，C基因型又可分为7个亚型，D基因型可分为8个亚型。不同

2、毒株的核苷酸差异率为10.6%～24.5%(氨基酸差异率为0.8%～7.3%)，不同基因型之间的核苷酸差异率为17.6%～22.4%(氨基酸差异率3.5%～6.6%)。结论ECHO6不同基因型/亚型可以在同一个地区流行很长时间，同一时间内不同的基因型/亚型又可在不同的地区流行，具有明显的时间和地域流行特点。［关键词］埃柯病毒6型;基因特征［中图分类号］R512.39［文献标识码］A［文章编号］1006－4028(2012)07－0510－05GeneticCharacteristicsofEchovirus6TIANBing-jun，DINGZheng-ro

3、ng，LULin，TANGJing-jing，ZHANGJie，LUOMeiEPIDepartment，YunnanCenterforDiseaseControlandPrevention，Kunming650022，YunnanProvince，China．AbstractObjectiveToanalyzethegeneticcharacteristicsofVP1zonein69strainsofechovirus6(ECHO6)i-solatedfrom10countriesand4provincesinChinaatdifferenttime．Me

4、thodsBLASTNsearchedinGenBank，EMBLandDDBJ，totally69ECHO6strainswereavailableinthestudy;thegeneticsimilarityandphylogenetictreeweredonebyMegasoftaware．ResultsSixty-nineECHO6strainsweredividedinto4genotypes(A-D)，genotypeCwasfurtherdividedinto7subgenotypesandgenotypeDinto8subgenotypes．

5、Thesequencediversi-tybetweendifferentstrainswas10.6%－24.5%(aadiversitywas0.8%－7.3%)，andbetweendifferentgen-otypeswas17.6%－22.4%(aadiversitywas3.5%－6.6%)．ConclusionECHO6prevalenceindifferentgenotypes/subtypescouldlastforalongtime，andatthesametimeindifferentgenotypes/subtypescouldals

6、oprevalentindifferentregions，withsignificanttimeandgeographicalcharacteristics．Keywordsechovirus6(ECHO6);geneticcharacteristics［1～4］人类肠道病毒(humanenterovirus，HEVs)是一区进行基因测序。对病毒基因型的鉴定是在对类形态较小的无胞膜病毒。对肠道病毒的诊断是用病毒株基因差异和进化关系分析的基础上进行的，不同的细胞系分离病毒并用中和实验或对病毒VP1对不同基因型的地区分布和时间分布的研究，可以了解病毒传播动态，评

7、价病毒的地方性传播并可解释病毒流行的程度。埃柯病毒6(ECHO6)是全球最常分离到的肠道作者单位:云南省疾病预防控制中心免疫规划科(昆明病毒，它常常与轻型非特异性疾病，小儿麻痹，心肌650022)炎和严重的新生儿疾病有关，还与病毒性脑炎的暴作者简介:田炳均(1965－)，男，主任技师，肠道病毒的分子流［5～8］发和散发有关。本文对10个国家和中国4个行病学预防医学情报杂志2012年7月第28卷第7期JPrevMedInf，July．2012，Vol.28，No.7511省不同时间分离的69株ECHO6病毒VP1区基因特为100%，它们与其他C亚型的nt差异率

8、为征进行了分析。14.0%～20.3%。C3单独由1