DNA非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳银染配方及步骤

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时间:2019-07-31

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1、DNA非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳银染配方及步骤最近需要做DNA非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,需要用银染显示条带,但是找不到具体的配方和步骤,不知和蛋白PAGE电泳银染有什么差别,哪位师兄师姐有配方可否发一份,十分感谢!一、电泳试剂:1、30%聚丙烯酰胺(29:1)丙稀酰胺29克,Bis1克,水100ml。2、10%过硫酸胺过硫酸胺1克,水10ml。3、TEMED4、5xTBETris27克,硼酸13.75克,0.5MEDTA(pH8.0)10ml,定容至500ml。二、银染试剂1、固定液:100ml无水乙醇,5ml冰醋酸

2、,定容至1000ml。2、0.2%AgNO3:AgNO31克,水500ml。3、1.5%NaOH:NaOH7.5克,水500ml。4、37%甲醛。三、配胶(6%):30%聚丙烯酰胺(29:1)8ml,5xTBE8ml,定容至40ml,加10%过硫酸胺200ul;TEMED20ul。室温凝固时间>1小时。四、银染:1、固定液固定10m。2、水洗2mx3次。3、0.2%AgNO3100ml+37%甲醛50ul,混匀,避光染色30~50m。4、水洗20秒x2次。5、1.5%NaOH100ml,加37%甲醛0.5ml,混匀

3、,显色3~10m。6、水洗若干次,终止显色。电泳时间:150vx3h,溴酚兰的位置相当于40bp。银染后胶面积将膨胀10%。在终止显色过程中,将依惯性继续显色,所以不等显色到位即可进行终止显色。显色到位后立即拍摄,水浸泡过夜将使背景加深转贴!!!聚丙烯酰胺凝胶电泳是分子生物学常用的一种技术。我们实验室应用该项技术进行基因组甲基化的筛选,取得了一定结果。因为全基因组的筛选需要很高的灵敏度,背景干扰降到最低,因此在对凝胶进行染色时,往往采用同位素法或银染法,而且配制的胶往往很大,我们配制的是大约40×35cm的胶,0.

4、4mm厚。同位素十分灵敏,特异,但是由于其操作的复杂性,许多实验室开展有一定困难。银染法相对简便易行,便于一般的实验室开展。需要指出的是,应用与筛选基因组的银染往往采用测序胶的染色方法,这样才能保证灵敏性,我们在长期的工作中积累了一些银染的经验,与大家分享。下面是网上的一个银染方法,我们使用后觉得效果不错,然后以此为基础,介绍一下我们的经验测序凝胶的银染  染色过程要求凝胶浸在塑料盘中。因而至少使用两个盘子,大小与玻璃板类似。在盘中加入新鲜溶液之前须用高质量的水洗涤盘子。    1.电泳完毕后用一个塑料片子小心地分

5、开两板,凝胶应该牢固地附着在短玻璃板上。    2.固定凝胶:将凝胶(连玻璃板)放入塑料盘,用固定/停止溶液浸没,充分振荡20分钟或直至样品中染料完全消失,胶可在固定/停止溶液中保存过夜(不振荡)。保留固定/停止溶液,用于终止显影反应。    3.洗胶:用超纯水振荡洗胶3次,每次2分钟。从水中取出,当转移至下一溶液时拿着胶板边沿静止10-20秒,使水流尽。    4.凝胶染色:把凝胶移至染色溶液充分摇动30分钟。    5.凝胶显影:   (1).在显影溶液中加入甲醛(3ml)和硫代硫酸钠溶液(400μl)以完成显

6、影液的配制。   (2).从染色溶液中取出凝胶放入装有超纯水的盘中浸洗5-10秒。注重,把凝胶从超纯水转移到显影溶液的总时间不能长于5-10秒。浸泡时间过长则导致信号微弱或丧失信号。若浸泡时间过长,可重复第五步用染色液浸泡。   (3).马上将凝胶转移至1升(总量的一半)预冷的显影液充分振荡直至模板带开始显现或开始出现第一批条带,把凝胶移入剩下的1升显影液中继续显影2--3分钟,或直至所有条带出现。    6.固定凝胶:在显影液中直接加入等体积的固定/停止溶液。停止显影反应,固定凝胶。    7.在超纯水中浸洗凝胶

7、两次,每次2分钟,注重在本操作中戴手套拿着胶板边缘避免在胶上印上指纹。  8.将凝胶置于室温干燥或用抽气加热法干燥。在可见光灯箱或亮白,黄色背景(如纸)上观察凝胶,若需永久保存的记录,则可用EDF胶片保留实验结果。经验分享:(1)固定液:网上有好几种固定液的配制方法,我们采用的是10%的冰乙酸,用蒸馏水稀释即可,简便易行。可提前配制,室温放置。(2)染色液:我们用的是0.1%的硝酸银溶液,加入3ml甲醛。硝酸银要现用现配,时间长了硝酸银会分解,一般在固定的时候配制,要有一段时间让硝酸银充分溶解。(3)显影液:用10

8、%碳酸钠,北化的质量就不错,完全不用买进口的,显影液要提前配制,放入4度冰箱预冷。这一步很重要,假如没有充分预冷,显色时很难控制显色时间,不是染过了导致背景很高,就是染的很浅。因此在固定前就要把显影液配好。(4)在2L显影溶液中加入甲醛(3ml)和硫代硫酸钠溶液(400μl)以完成显影液的配制,这一步要在显影前加,不要提前加。原理忘记了,但是一般都是这样做的

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