《基因定位》PPT课件

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1、基因组学Genomics第四章基因定位10/1/20211基因组学Genomics§4基因定位§4.1基因的鉴定§4.2主基因定位§4.3QTL定位§4.4分子标记辅助选择10/1/20212基因组学Genomics§4Mappingofgenes§4.1基因的鉴定基因定位（Mappingofgenes）是指通过遗传作图的方法，确定基因与遗传标记之间的关系。基因定位的前提，是要准确地鉴定基因。10/1/20213基因组学Genomics§4.1基因的鉴定§4.1.1基因的概念基因的广义概念：基因是具有某种功能的DNA片段，包括结构基因和调控基因，即包括能

2、转录和不能转录的具有某种功能的DNA序列，其含义非常广泛。10/1/20214基因组学Genomics§4.1基因的鉴定§4.1.1基因的概念分子遗传学的概念：基因是DNA的一个转录单位。转录产物RNA通过反转录可以合成cDNA，因此通常认为一个cDNA相当于一个基因。但是，目前大多数cDNA的功能尚不知道，因此这种基因是通过转录来识别的。DNARNA转录10/1/20215基因组学Genomics§4.1基因的鉴定§4.1.1基因的概念孟德尔遗传学的概念：基因是控制某一性状的遗传因子。基因是通过表现型来识别的，即表现型是基因型控制的，通过表现型可以分析

3、基因型。10/1/20216基因组学Genomics§4.1基因的鉴定§4.1.1基因的概念主效基因和微效基因：从孟德尔遗传学的基因概念来看，基因型是通过表现型来认识的，根据基因对表现型影响的大小，通常把基因划分为主效基因（majorgene）和微效基因（minorgene）。10/1/20217基因组学Genomics§4.1基因的鉴定§4.1.1基因的概念主效基因:又称主基因，是一类控制质量性状的基因，其性状表现为不连续的变异。微效基因:是一类控制数量性状的基因，因此通常称为数量性状座位（quantitativetraitlocus，QTL），其性状

4、表现为连续的变异。10/1/20218基因组学Genomics§4.1基因的鉴定§4.1.1基因的概念基因座位与等位基因：基因座位（locus）：基因在遗传图上的位置。等位基因（allele）：在相同的基因座上，两种或多种变异基因之一。由两个以上等位基因组成的一组等位基因称为复等位基因（multiplealleles）。ABCA1B1C1A2B2C210/1/20219基因组学Genomics§4.1基因的鉴定§4.1.2遗传分析判断某一性状是否由主基因控制和受多少对基因控制，首先需要对该性状作遗传分析。遗传分析的基本方法是：（1）选择具有相对性状的两个

5、亲本杂交；（2）在F1中观察该性状属于完全显性，还是不完全显性；（3）在F2中分析分离群体中相对性状的分离。10/1/202110基因组学Genomics§4.1基因的鉴定§4.1.3等位性测定由于有些基因已经定位，因此在基因定位之前，需要做基因的等位性（allelism）测定，以明确要定位的基因尚没有定位。基因的等位性测定的基本方法是：（1）查阅有关文献，了解该性状目前的研究情况，包括该性状已发现多少个基因，哪些基因已定位等。（2）如果不知道要定位的基因与已定位的基因之间的关系，但它们的表现型相同，则存在它们是同一个基因的可能性，需要确定它们之间的关系

6、。10/1/202111基因组学Genomics§4Mappingofgenes§4.2主基因定位基因定位通常指的是主基因的定位。而微效基因的定位通常用专有名词QTL定位。10/1/202112基因组学Genomics§4.2主基因定位§4.2.1基因定位的原理无论是遗传标记还是基因，都在染色体上占有它们的座位，而这些座位都是DNA的一个片段，因此从座位上看，它们并没有什么区别。通过遗传图谱的构建，很多分子标记在染色体上的位置已经确定，因此只要确定基因与分子标记之间的连锁关系，就可以确定基因在染色体上的位置。10/1/202113基因组学Genomics

7、§4.2主基因定位§4.2.1基因定位的原理分子标记是通过它们产生的带型来识别的，而基因是通过它们产生的表现型来识别的。因此与前面讲述的遗传作图不同，基因定位既要分析分子标记的带型，又要分析基因型产生的表现型。基因定位的基本原理是通过分析分子标记与表现型之间的连锁关系，确定基因在遗传图谱中的位置。Zhangetal.1996,TAG10/1/202114基因组学Genomics§4.2主基因定位§4.2.2表型分析作图群体的发展：作图群体是基因定位中不可缺少的试验材料。作图群体的基本要求是：（1）双亲具有相对性状的差异；（2）双亲应具有较高程度的多态性，

8、以便找到紧密连锁的分子标记；（3）作图群体的大小应符合要求；（4）作图群体中相对