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时间:2019-06-14
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1、核酸的提取及琼脂糖凝胶电泳目录核酸组成理化性质核酸分离、纯化的原则核酸提取的基本步骤材料准备细胞裂解分离、纯化沉淀溶解DNA提取的常用方法RNA提取的常用方法核酸的保存琼脂糖凝胶电泳核酸DNARNAGenomicDNA(原核、真核、病毒)细胞器DNA(叶绿体、线粒体等)质粒DNA(细菌、放线菌等)mRNA(1%-5%)rRNA(80%-85%)tRNA(小分子RNA)(15%-20%)核酸(nucleicacid)核酸的提取是分子生物学实验技术中最重要、最基本的操作。核酸的理化性质理化性质DNA化学性质稳定,物理上易碎,粘度
2、大RNA化学性质比DNA活泼,易受RNA酶的污染溶解性均溶于水不溶于一般有机溶剂,在70%乙醇中形成沉淀核酸分离、纯化原则1、保持核酸分子一级结构的完整性温度不要太高控制pH值范围(pH值5-9)保持一定离子强度减少物理因素对核酸的机械剪切力核酸分离、纯化原则核酸酶能消化核酸链中的磷酸二酯键,破坏核酸一级结构。所用器械和一些试剂需高温灭菌提取缓冲液中需加核酸酶抑制剂2、防止核酸的生物降解DNA酶抑制剂金属离子螯合剂:DNA酶需要金属二价离子Mg2+、Ca2+的激活,常用EDTA(乙二胺四乙酸)离子螯合剂,可抑制DNA酶活性。
3、阴离于型表面活性剂SDS除对核酸酶有抑制作用外,还能使蛋白质变性,并与变性蛋白结合成带负电荷的复合物,该复合物有核酸酶抑制剂作用。RNA酶(RNAase)抑制剂DEPC(二乙基焦碳酸盐)粘性液体,很强的核酸酶抑制剂。与蛋白质中His结合使蛋白变性。使用注意:1.DEPC也能破坏单链核酸中大部分腺嘌呤环。2.容易降解,保存在4℃或液氮中;3.剧毒。1:手指头2:枪头3:水/缓冲液4:实验台面5:内源Rnase6:RNA样品7:质粒抽提8:RNA保存9:阳离子(Ca,Mg)10:后续实验所用的酶Rnase污染的10大来源DNA提
4、取的基本步骤I.材料准备II.裂解III.分离、纯化IV.沉淀或吸附核酸V.溶解材料准备使用新鲜材料,样品材料不要反复冻融提取血液基因组DNA时,要选择有核细胞(白细胞)含病毒的液体材料DNA含量较少,提取前先富集基因组DNA的提取细胞裂解裂解液经典的裂解液几乎都含有去污剂和盐,可以抑制样品中的核酸酶含蛋白酶的裂解方法:基因组DNA高浓度蛋白变性剂的裂解方法:RNA含CTAB的裂解法:富含多糖的样品的基因组DNA含SDS碱裂解法:质粒DNA核酸分离、纯化蛋白质的去除:酚/氯仿抽提使用变性剂变性(SDS、异硫氰酸胍等)高盐洗涤
5、核酸-蛋白质加入NaCl后,破坏静电吸力,使氢键破坏,核蛋白解聚;蛋白酶处理核酸分离、纯化多糖的去除:高盐法:用乙醇沉淀时,在待沉淀溶液中加入1/2体积的5MNaCl,高盐可溶解多糖。用多糖水解酶将多糖降解。在提取缓冲液中加一定量的氯苯,氯苯可以与多糖的羟基作用,从而去除多糖。核酸沉淀、溶解重新调整核酸的浓度;去除溶液中某些盐离子与杂质。乙醇优点:对盐类沉淀少,沉淀中所含乙醇易挥发除去,不影响以后实验。缺点:需要量大,一般要求低温操作。异丙醇优点:需体积小,速度快,适于浓度低、体积大的DNA样品沉淀。一般不需低温。缺点:易使
6、盐类、蔗糖与DNA共沉淀.异丙醇难以挥发除去。所以,最后用70%乙醇漂洗。有机沉淀剂核酸的保存(1)对DNA①DNA样品溶于pH8.0的TE,4℃或-20℃保存;②长期保存样品中可加入1滴氯仿。(2)对RNA①RNA样品溶于0.3mol/LNaAc(pH5.2)或双蒸灭菌水中,-70℃保存;②长期保存可以沉淀形式贮于乙醇中;DNA提取的常用方法基因组DNA的提取SDS法其它原理基因组DNA-SDS法SDS在高温(55~65℃)条件下能裂解细胞,使染色体离析,蛋白变性,释放出核酸;上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,反复抽提后用乙
7、醇沉淀水相中的DNA。组份Tris-HCl(pH8.0)EDTA(pH8.0)NaClSDS终浓度100mM20mM1.4M2%(W/V)SDS提取缓冲液的配方Tris-HCl(pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;NaCl提供一个高盐环境,使DNA充分溶解,存在于液相中;SDS裂解细胞,使蛋白变性,染色体离析;吸附材料结合法:根据核酸分离纯化方式的不同有:高盐低pH值结合核酸,低盐高pH值洗脱。快捷高效。低盐高pH值结合核酸,高盐低pH值洗脱。适用于纯度要求高
8、的实验。磁性微粒挂上不同基团可吸附不同的目的物,从而达到分离目的。其他方法硅质材料阴离子交换树脂磁珠低盐高pH值结合核酸,高盐低pH值洗脱。适用于纯度要求高的实验。阴离子交换树脂磁珠低盐高pH值结合核酸,高盐低pH值洗脱。适用于纯度要求高的实验。阴离子交换树脂磁性微粒挂上不同基团可吸附不同
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