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《适于玉米杂交种纯度鉴定的SSR核心引物的确定及纯度鉴定图谱绘制》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、农业生物技术学报JournalofAgriculturalBiotechnology2007,15(6):964~969·研究论文·适于玉米杂交种纯度鉴定的SSR核心引物的确定*1,2, 赵久然1**,王璐1, 易红梅1, 郭景伦1, 戴景瑞2**, 原亚萍3, 卢柏山1,杨国航1王凤格(1.北京市农林科学院玉米研究中心，北京100097；2.中国农业大学农学与生物技术学院，北京100094；3.吉林大学植物科学学院，长春130062)摘要:为了确定一套适于玉米杂交种纯度鉴定的核心SSR引物，利用10个SSR引物对420份已知玉米（）杂交种进行DNA指纹分析。综合考
2、虑多态性和杂合率两个指标，确定bnlg161和bnlg1450为玉米杂交种纯度鉴定的首选核心引物，利用这两个引物进行筛选，412个品种(占98%)能够找到具有杂合带型的鉴定引物,确定5个引物bnlg439、bnlg125、umc2105、umc1705和bnlg1792为玉米杂交种纯度鉴定的备选核心引物。研究了纯度鉴定所用特异引物的选择，将特异引物分为两类：第一类是利用单个引物检测，某品种的基因型仅出现1次，将该引物作为该品种在特定品种范围内的特异引物，在420个品种中，累计29个品种具有第一类特异引物，其中umc1705和bnlg1450作为特异引物的次数最多，均
3、为8个，phi072和phi065没有作为特异引物；第二类是根据引物基因频率表，将预测基因型频率低于2.40E03(即1/420)的基因型作为特异基因型，除了phi072和bnlg161外，其它8个引物均可能成为具有特定基因型品种的第二类特异引物。利用推荐的7个纯度鉴定用核心引物可进一步筛选每个玉米杂交种的双亲互补型引物，建立了已知玉米杂交种的纯度鉴定DNA指纹图谱。关键词:玉米；杂交种；SSR；纯度鉴定；核心引物中图分类号:S188文献标识码:A 文章编号:10061304(2007)06096406DeterminationofSSRCorePrimersfor
4、MaizeHybridPurityIdentificationWANGFengge1,2,ZHAOJiuran 1**,WANGLu 1,YIHongmei 1,GUOJinglun 1,DAIJingrui 2**, YUANYaping 3,LUBaishan 1,YANGGuohang 1InordertodetermineasetofSSRcoreprimersfittingformaizehybrids'purityidentification,420maize（）hybridswereanalyzedby10SSRprimers,bnlg439,bnlg
5、125,umc2105,phi072,umc1705,bnlg161,bnlg1792,bnlg162,phi065andbnlg1450,respectively.andtwoprimersbnlg161andbnlg1450weredeterminedaccordingtotheirpolymorpismandheterogositerateaspreferredcoreprimersformaizehybridpurityidentification.Fourhundredandtwelvehybrids(accountingfor98%)havehetero
6、zygosisbandtypeinatleastoneprimerifthetwopreferredcoreprimersbnlg161andbnlg1450wereused;fiveprimersbnlg439,bnlg125,umc2105,umc1705andbnlg1792weredeterminedascandidatecoreprimersformaizehybridpurityidentification. Specificprimersforpurityidentificationwerealsostudied,thereweretwosortsof
7、specificprimer:(1)withinspecificrangeofvarieties,thegenotypeofaprimerappearedonlyinonevariety,thentheprimerwasusedasspecificprimerofthevariety. Twentyninevarietieshadspecificprimerswithinthe420varieties,bothumc1705andbnlg1450wereusedasspecificprimersof8varieties,whilephi072andphi065w
