人乳头瘤病毒16及58型DNA在宫颈脱落细胞中的整合及其甲基化分析

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1、密级:博士学位论文2012年12月ByHuiLiADissertationSubmittedtoUniversityofChineseAcademyofSciencesInpartialfulfillmentoftherequirementForthedegreeofDoctorofPhilosophyInstituteOfMicrobiology,ChineseAcademyofSciencesDecember,2012㈣6Ⅲ4㈣2哪2哪8删3,哪2川川u丫HPVPCRICTVURRVLPsPsVsQVHSPGsHSECMBMPCNDl0E6APIRF3TLRCINLSILHSILV

2、LPsTRAH。FADDDISCTNF.R1TRADDcIAP一2Bcl.2BakIGFBP.3TERTFISHAPOTDlPSBSPMSPHC2RFLPFDAGSKBCCLINESlNELTRAbbrevationsHumanpapillomavirusesPolymerasechainreactionInternationalCouncilonTaxonomyofVirusesUpstreamregulatoryregionVirus·likeparticlesPseudovirusesQuasivirionsHeparansulfateproteoglycansHeparansu

3、lfateextracellularmatrixBasementmembraneProproteinconvertaseNucleardomainsProteinE6.associatedproteinInterferonresponsefactor3TolllikereceptorCervicalintraepithelialneoplasiaLowgradesquamousintraepitheliallesionHighgradesquamousintraepitheliallesionViral.1ikeParticlesTumornecrosisfactor-relateda

4、poptosisinducingligandFas.aasociateddeathdomainDeath—inducingsignalingcomplexTNFreceptor-1TNFreceptor1associateddeathdomainproteinCellularinhibitorofapoptosisprotein2B.celllymphoma2Bcl一2homologuskillerInsulin—likegrowthfactor-bindingprotein一3TelomerasereversetranscriptaseFluorescenceinsituhybrid

5、izationAmplificationofPapillomaVirusOncogeneTranscriptsDetectionofIntegratedPapillomavirusSequencesBisulfate—sequencingPCRMethylation.specificPCRTheHybridCaptureIIsystemRestrictionfragmentlengthpolymorphismFoodandDrugAdministrationGlaxoSmithKlineBenigncellularchangeslonginterspersednuclearelemem

6、sshortinterspersedelementslongterminalrepeatelements摘要人乳头瘤病毒16及58型DNA在宫颈脱落细胞中的整合及其甲基化分析李惠(遗传学)导师:朱宝利研究员高危型人乳头瘤病毒(Humanpapillomavirus,HPV)在宫颈上皮的持续感染能引起宫颈癌。病毒DNA在宿主基因组中的整合以及病毒自身DNA的甲基化可能在癌症发生过程中起了十分重要的作用。为了探索HPV整合的位点偏好性及整合与病情的联系,本文利用DIPS—PCR(DetectionofIntegratedPapillomavirusSequences,DIPS)方法结合DN

7、Ai则序对46例HPVl6单一感染及13侈qHPV58单一感染的宫颈脱落细胞样品中的病毒整合状态进行了研究,并详细分析了病毒DNA在宿主基因组中的整合位点及病毒自身基因组的断裂位点的分布。同时,为了探讨HPV基因组的DNA甲基化与宫颈癌变的相关性,本文利用硫酸盐测序PCR(Bisulfate.sequencingPCR,BSP)方法对上述临床样品中HPV增强子和启动子区CpG位点的DNA甲基化进行了研究。在病毒整合分析中,本研究从3l例HPVl

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