不同遗传谱系肠外大肠埃希菌毒力因子检测

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1、分类号:R378.2密级:学位类别:科学学位团专业学位口学校代码:学号:学科门类:夭肄普科鼻普Tl矗NJIN黼毫OleAl-U鞫lV毫RSl.I广Y硕士学位论文MASTER’SDISSERTATION论文题目:不同遗传谱系肠外大肠埃希菌毒力因子检测TITLEDetectionofextraintestinalpathogenicE.colivirulencefactorsbasedondifferentphylogeneticgroups一级学科:临床医学二级学科:内科学传染病论文作者:刘双庆指导教师:魏殿军导师组成员:张敬伟天津医科大学研究生院二。一三年五月6忆裟畔学位论文原创性声明

2、本人郑重声明:所呈交的论文是我个人在导师指导下独立进行研究工作取得的研究成果。除了文中特别加以标注引用的内容和致谢的地方外,论文中不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果,与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。学位论文作者签名:型丛日期驯;年,月站日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解天津医科大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,并采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编以供查阅和借阅。同意学校向国家有关部门或机构送交论文,并编入有关数据库。保密口,在——年解密后适用本

3、授权书。本论文属于不保密囡。(请在相对应的方框内打“√”)学位论文作者签名:导师签名:日期:弘f弓年上月订日日期:洲;年j月谚日天津医科大学硕士学位论文中文摘要目的:肠外致病性大肠埃希菌(ExPEC)是引起泌尿系感染的最主要致病菌,同时也是引起新生儿脑膜炎和新生儿败血症的主要致病菌之一,也可以引起医院获得性肺炎等多种疾病。与致腹泻性大肠埃希菌不同的是ExPEC的致病机制主要由其携带的毒力因子情况决定,ExPEC的致病严重程度也与其遗传谱系分型情况相关。为了了解天津地区ExPEC毒力因子携带情况及遗传谱系分型情况,本课题选取210株不同来源的ExPEC菌株作为研究对象,通过检测菌株30种

4、毒力因子(VFs),了解其基因的检出情况,不同来源单个基因的分布情况;通过对ExPEC菌株进行遗传谱系分型,将菌株分为A组、Bl组、B2组和D组,了解其系统化分组情况,不同来源菌株系统化分组的差异情况。初步探讨ExPEC毒力因子与遗传谱系分型之间的关系,探究ExPEC的分子流行病学特点,以便为更好的了解ExPEC提供临床解读。方法:收集2010年12月至2011年12月分离的共210株分离自痰液、尿液、血液及其他部位的非重复感染大肠埃希茵作为实验菌株。根据来源不同将菌株分为I组(痰液组)、II组(尿液组)和ⅡI组(血液、拭子及分泌物等)。将30对毒力因子基因根据扩增片段的大小分为5组,

5、分别采用6重3步PCR方法进行基因片段扩增,然后通过琼脂糖凝胶电泳的方式判断毒力因子基因的检出情况;并分别统计不同来源菌株单个毒力因子基因检出情况及单个菌株毒力因子基因检出数量进行比较。采用3重2步PCR方法对遗传谱系分型3种基因进行扩增,通过比对琼脂糖凝胶电泳产生条带情况对ExPEC菌株进行分组,并根据不同来源菌株进行分组比较。对临床分离菌株毒力因子基因的检出情况与遗传谱系分型情况进行统计学分析,比较菌株遗传谱系分型各组间毒力因子基因的检出情况有否差异。争士甲当口木:ExPEC中毒力因子基因fimH、痧uA、traT,iutA、kpsMTll、PAl的检出率较高,分别为79%、75%

6、、74%、73%、62%和46%;不同来源的ExPEC菌天津医科大学硕士学位论文株分组比较显示有5种毒力因子在非尿液来源中检出率更高,分别是papGalleleII(InternaO、papC、papA、papEF和咖。ExPEC菌株遗传谱系分型4个系统进化组A组、B1组、B2组和D组分别以3个基因的检出情况判断:chuA(一)、YjaA(+/一)和TSPE4.C2(一);chuA(一),vjaA(+/一)和TSPE4.C2(+);chuA(+),YjaA(+),TSPE4.C2(+/-)和chuA(+),Y:jaA(一)和TSPE4.C2(+/一)。4个系统进化组所占比例分别为24%

7、、11%、29%和36%;不同来源的ExPEC遗传谱系分型情况也略有不同,统计结果显示痰标本来源的菌株比尿液标本来源的菌株中分型为B2组的更多,而其他各组之间的比较无统计学意义。在进行ExPEC菌株遗传谱系分型各组之间毒力因子基因检出情况的统计学比较显示,6种毒力因子基因的检出情况与细菌遗传谱系分型之间无统计学差异,它们分别是traI,,iutA、pagGalle仍、ibeA、papGflanking、sfaS;毒力因子中有8种仅与B2组联系密

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