利用芯片技术研究黄瓜离体雌核发育早期基因表达差异

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1、中图分类号：UDC：学校代码：10055密级：公开尚脚大謦专业硕士学位论文利用芯片技术研究黄瓜离体雌核发育早期基因表达差异IdentificationofGenesRelatedtoCucumberinvitroGynogenesisinEarlyStageUsingGeneChips学科专业生塑王猩答辩委员会主席．塞塞左塾援指导教师王室主麴援南开大学研究生院二O一三年五月㈣南开大学学位论文使用授权书根据《南开大学关于研究生学位论文收藏和利用管理办法》，我校的博士、硕士学位获得者均须向南开大学提交本人的学位论文纸质本及相应电子版。本人完全了解南开大

2、学有关研究生学位论文收藏和利用的管理规定。南开大学拥有在《著作权法》规定范围内的学位论文使用权，即：(1)学位获得者必须按规定提交学位论文(包括纸质印刷本及电子版)，学校可以采用影印、缩印或其他复制手段保存研究生学位论文，并编入《南开大学博硕士学位论文全文数据库》；(2)为教学和科研目的，学校可以将公开的学位论文作为资料在图书馆等场所提供校内师生阅读，在校园网上提供论文目录检索、文摘以及论文全文浏览、下载等免费信息服务：(3)根据教育部有关规定，南开大学向教育部指定单位提交公开的学位论文；(4)学位论文作者授权学校向中国科技信息研究所及其万方数据电

3、子出版社和中国学术期刊(光盘)电子出版社提交规定范围的学位论文及其电子版并收入相应学位论文数据库，通过其相关网站对外进行信息服务。同时本人保留在其他媒体发表论文的权利。非公开学位论文，保密期限内不向外提交和提供服务，解密后提交和服务同公开论文。论文电子版提交至校图书馆网站：http：／／202．113．20．161：8001／index．htm。本人承诺：本人的学位论文是在南开大学学习期间创作完成的作品，并已通过论文答辩；提交的学位论文电子版与纸质本论文的内容一致，如因不同造成不良后果由本人自负。本人同意遵守上述规定。本授权书签署一式两份，由研究生

4、院和图书馆留作者暨授权人签字：亟堕虹2013年5月25日南开大学研究生学位论文作者信息论文题目利用芯片技术研究黄瓜离体雌核发育早期基因表达差异姓名张晓帆学号2120111028答辩日期2013年5月19日论文类别博士口学历硕士口硕士专业学位、／高校教师口同等学力硕士口院／系／所生命科学学院专业生物工程联系电话15822330926EmailBiozhxiaofan@163．com通信地址mS编)：天津市卫津路94号南开大学生物站B102室备注：是否批准为非公开论文否注：本授权书适用我校授予的所有博士、硕士的学位论文。由作者填写(一式两份)签字后交校

5、图书馆，非公开学位论文须附《南开大学研究生申请非公开学位论文审批表》。南开大学学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师指导下进行研究工作所取得的研究成果。除文中已经注明引用的内容外，本学位论文的研究成果不包含任何他人创作的、已公开发表或者没有公开发表的作品的内容。对本论文所涉及的研究工作做出贡献的其他个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本学位论文原创性声明的法律责任由本人承担。学位论文作者签名：张晓帆2013年5月25日非公开学位论文标注说明(本页表中填写内容须打印)根据南开大学有关规定，非公开学位论文须经指导教师同意、作者

6、本人申请和相关部门批准方能标注。未经批准的均为公开学位论文，公开学位论文本说明为空白。论文题目申请密级口限制(≤2年)口秘密(≤10年)口机密(≤20年)保密期限20年月日至20年月日审批表编号批准日期20年月日南开大学学位评定委员会办公室盖章(有效)注：限制★2年(可少于2年)：秘密★10年(可少于10年)：机密★20年(可少于20年)摘要摘要本研究的目的是利用基因芯片技术对黄瓜未受精子房离体培养过程中的差异基因进行检测，通过生物信息学分析，获得与黄瓜离体雌核发育早期启动相关的基因和生物路径，为提高黄瓜未受精子房离体培养的植株再生率、缩短育种年限

7、提供理论基础。选取高频黄瓜基因型W7未受精子房离体培养过程中0、2、4、6天的材料，建立了胚珠．体细胞剥离技术，将外植体分为胚珠和子房壁体细胞两个部位；建立了FPA．水杨酸甲酯透明检测体系，保证所取材料有较高的发生频率，减少取样误差；分别提取了两个部位的总RNA进行芯片杂交；运用生物信息学软件对芯片数据进行深度分析。通过对差异基因的GO富集分析发现参与调节基因、血红素结合等功能基因富集程度较高：KEGG途径富集分析表明激素代谢，苯丙氨酸代谢及苯丙胺素合成等途径相关的基因显著富集，且苯丙氨酸代谢途径在胚珠部位的富集程度明显高于子房壁体细胞部位的富集程

8、度，暗示了在黄瓜离体雌核早期发育过程中苯丙氨酸代谢及苯丙胺素合成可能起着重要作用。关键词：黄瓜，离体雌核发育，差异基因Ab