基因芯片分析急性心肌梗死患者外周血差异基因表达谱

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1、基因芯片分析急性心肌梗死患者外周血差异基因表达谱MicroarrayanalysisofgeneexpressedprofileinperipheralbloodRNAinpatientswithacutemyocardialinfarction作者姓名：郭旭东专业名称：内科学指导教师：孟繁波教授学位类别：临床医学硕士答辩日期：2015年5月27日II中文摘要背景急性心肌梗死（acutemyocardialinfarction，AMI）作为冠状动脉性心脏病（Coronaryheartdisease，CHD）中较为严重的类型，其发病急、病死率高，对人民健康形成了严重的威胁。目前急性心肌梗死的诊断

2、多依赖于临床表现、心电图的动态变化及血清生物标志物。如何更早的对急性心肌梗死进行诊断及预防，一直是我们研究的重要课题。而随着人类基因组计划完成和基因芯片技术的发展，许多单基因疾病的致病基因被发现，并应用到疾病的诊断与治疗当中。而AMI作为一种受多种遗传与环境因素影响的疾病，遗传学在AMI发病中的作用仍未明确。具体是哪些基因，通过何种细胞过程，有哪些通路参与了AMI过程尚未明确。本研究通过AMI的外周血RNA表达谱差异分析，来研究具体有哪些基因参与了AMI过程，为将来AMI早期基因诊断奠定基础。目的通过对AMI患者与健康患者外周血RNA进行基因芯片分析，筛选参与AMI疾病过程的表达差异基因，寻找

3、AMI早期诊断的分子标记。方法我们应用基因芯片方法，分析了AMI病人及健康人的外周血RNA表达谱。选取2012.06－2014.08在我院住院治疗并明确诊断的急性心肌梗死患者12例与12例健康人作为对照组。提取外周血白细胞中的mRNA，反转录成cDNA.。选取其中3例AMI患者与3例对照组患者进行基因芯片检测。其它样品用于验证基因芯片结果的可信性。随机选择V基因CYP4F3、IL13RA1、USP25分别做为高表达组、表达无差异组和低表达组基因。行实时荧光定量PCR分析这些基因在不同分组中表达差异。结果基因芯片检测结果显示，559个基因在急性心肌梗死组表达异常，其中288个基因高表达，271个

4、基因低表达（结果按照p-value≤0.05,

5、logFC

6、＞1）。GO分析显示：这些差异基因归属于128个细胞组成，参与了521个生物过程和151个分子功能；KEGG分析显示：这些差异基因共参与107个基因通路。荧光定量PCR结果：基因CYP4F3在急性心肌梗死患者组表达高于对照组（1.62±0.27,p=0.006）；基因USP25在急性心肌梗死患者表达低于对照组（0.56±0.07,p=0.003），基因IL13RA1在心肌梗死组表达与对照组无差异（1.11±0.35,p=0.681）。结论基因芯片分析结果可信，急性心肌梗死患者与健康对照人群外周血中RNA表达存在差异，CYP4F3与US

7、P25可能成为急性心肌梗死诊断的基因标记。关键词：急性心肌梗死,RNA表达差异,基因芯片VIAbstractMicroarrayanalysisofgeneexpressedprofileinperipheralbloodRNAinpatientswithacutemyocardialinfarctionBackgroundAsatypeofcoronaryheartdisease,acutemyocardialinfarction(AMI)ismoreserious,anditsacuteonsetandhighfatalityratethreatenedpeople'shealthseri

8、ously.AtpresentthediagnosisofAMIisdeterminedbytheclinicalmanifestation,characteristicsofelectrocardiogramandthedynamicchangesinserumbiomarkers.ithasbeenanimportantsubjectofourresearchtoearlierdiagnosisandpreventionofacutemyocardialinfarction。Withthecompletionofhumangenomeprojectandthedevelopmentofmi

9、croarraytechnology,virulencegenesofmanysinglegenediseaseswerefoundandappliedtothediagnosisandtreatmentofdiseases.Asakindofdiseaseaffectedbyavarietyofgeneticandenvironmentalfactors,thepathogenesisofAMI