蒙古马与纯血马骨髓表达谱差异基因研究

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1、内蒙古农业大学研究生学位论文独创声明本人申明所呈交的学位论文是我本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包括其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包括为获得我校或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料,与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。申请学位论文与资料若有不实之处,本人承担一切相关责任。论文作者签名:戤葺茏日期:弛笸!ff内蒙古农业大学研究生学位论文版权使用授权书本人完全了解内蒙古农业大学有关保护知识产权的规定,即:研究生在攻读学位期间论文工作的知识产权单位

2、属内蒙古农业大学。本人保证毕业离校后,发表论文或使用论文工作成果时署名单位为内蒙古农业大学,且导师为通讯作者,通讯作者单位亦署名为内蒙古农业大学。学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子文档,允许论文被查阅和借阅。学校可以公布学位论文的全部或部分内容(保密内容除外),采用影印、缩印或其他手段保存论文。论文作者签名:指导教师签名:日期:do,乒·多·/,摘要ⅢIIIfllJllIIIJUrrfllJfllIllIIfY260nnun'0"'"'17

3、

4、11

5、0

6、uan4.nm

7、t随着人们消费观念和文化结构的不断改变,马匹的作用已由过去的役用转变为现在

8、的健身休闲娱乐骑乘工具。培育具有良好的观赏性且速度耐力兼具,并有良好的抗病力和适应性的马匹品种,是马匹育种工作的热点。骨髓是研究免疫功能的典型器官,在机体起着造血和免疫细胞及免疫因子生成的功能。对骨髓表达谱的研究,有助于解析不同生物个体间免疫差异的分子机理。本实验利用llluminaMiseq高通量测序技术,对构建的两个蒙古马和纯血马骨髓表达谱文库进行测序,得到的数据用软件处理后,在KO、KEGG、KOG等数据库进行注释,得到的结果如下:1.蒙古马和纯血马骨髓表达谱文库测序得到的原始数据经过去杂和筛选后,分别获得了7116170和7219956的有效reads。2

9、.对测序得到的基因数据在染色体上进行注释,两个文库注释到l号、8号和11号染色体的reads最多,注释到29号、30号和31号的reads最少。3.两个文库共筛出318差异表达基因,对比纯血马骨髓,蒙古马骨髓表达量显著上调的基因共有241个,表达量显著下调的基因共有77,其中有21个差异表达基因与免疫相关。4.GO功能富集分析和KEGG功能富集分析中均显示存在免疫相关差异基因。KOG功能富集分析显示:蒙古马在氨基酸转运代谢和脂质转运代谢通路中,下调基因数目高于上调基因。关键词:蒙古马;纯血马;免疫:骨髓:表达谱;差异表达基因AnalysistheDifferenc

10、esbetweenMongolianHorseandThoroughbreds’BoneMarrowExpressionProfilesAbStract.Withpeople’Schangeofconsumerattitudesandculturalstructures,Theroleofhorsesfromthepasttothepresent,changingintorecreationalridingfitnesst001.ItisahotjobofBreedinghorsestocultivateafinevarietiesofhorsewhichhasb

11、othgoodspeedandendurance,butalsoadaptabilityandhighresistancetodisease.Bonemarrowisthetypicalorganforstudyingtheimmunefunction.Thefunctionsofthebonemarrowishaemopoiesisandgeneratingimmunecellsandfactors.Thisstudyishelpfoltoanalysisthedifferencesofimmunesystembetweendifferentindividual

12、s.Inthisstudy,IlluminaMiseqhigh—throughputsequencingtechnologyisusedtosequenceMongolianHorseandThoroughbreds’bonemarrowexpressionprofiles.Afterprocessingthedataobtainedwiththesoftware,thenuseGeneOntology、KOGandKyotoEncyclopediaofGenesandGenomestocommentthegenesweget.Theresultshows:1.M

13、ongol

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