月季响应黑斑病的早期差异表达基因分析

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1、园艺学报,2015,42(4):731–740.ActaHorticulturaeSinicadoi:10.16420/j.issn.0513-353x.2014-0894;http://www.ahs.ac.cn731月季响应黑斑病的早期差异表达基因分析1,21111,*刘瑞峰,刘强,张非亚,袁晓娜,贾桂霞1(北京林业大学园林学院,花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室,国家花卉工程技术研究中心,北京100083;2中南林业科技大学林学院,长沙410004)摘要:为了获得月季抗黑斑病的相关基因,探究月季抗病分

2、子机制,以月季高抗黑斑病品种‘粉和平’叶片为材料,采用单孢子离体接种法对其接种黑斑病菌,以接种24、48和72h的cDNA等量混合样为检测子,以相应对照的cDNA混合样为驱动子,构建抑制差减杂交文库。挑选200个阳性克隆进行测序、BLASTx比对分析,获得37条非冗余EST序列,其中32条序列在蛋白数据库中具有同源序列。将获得的EST序列导入相应样本的转录组测序数据库,以其在两个样本中的RPKM比值作为基因相对表达量。结果表明,接种病原菌后,上调表达基因涉及信号识别、离子转运、活性氧清除、光呼吸途径及苯丙烷代谢

3、等方面,其中以活性氧清除、光呼吸途径和苯丙烷代谢途径的基因数最多。这一结果说明月季抗病是通过多基因的协同作用实现的,活性氧清除、光呼吸途径和苯丙烷代谢途径在月季抵抗黑斑病菌过程中发挥重要作用。关键词:月季;黑斑病;抑制差减杂交;活性氧清除;光呼吸;苯丙烷途径中图分类号:S685.12文献标志码:A文章编号:0513-353X(2015)04-0731-10TheAnalysisofDifferentialExpressionGenesforRoseEarlyRespondingtoBlack-spotDisea

4、se1,21111,*LIURui-feng,LIUQiang,ZHANGFei-ya,YUANXiao-na,andJIAGui-xia1(BeijingKeyLaboratoryofOrnamentalPlants,GermplasmInnovationandMolecularBreeding,NationalEngineeringResearchCenterforFlowers,CollegeofLandscapeArchitecture,BeijingForestryUniversity,Beijing

5、100083,China;2CollegeofForestry,CentralSouthUniversityofForestryandTechnology,Changsha410004,China)Abstract:Black-spotdiseaseisthemostseriousdiseaseforroses.Inordertoisolatethegenesrelatedwiththeroseresistanceandfurthertoexploretheinteractionmoleculemechanis

6、mbetweenroseandDiplocarponrosaeWolf.‘PinkPeace’asthehighresistancevarietyinthepreliminaryscreeningwasselectedasthematerial,thecDNAofitsinoculatedleavesin24h,48hand72hweremixedequivalently,andthemixturewasregardedasthetester,thecDNAmixtureofnon-inoculatedleav

7、escorrespondinghourswereusedasthedriver.Basedonthese,thesubtractedcDNAlibrarywerebuilted.Atotalof200positivecloneswerepickedandsequenced,and37non-redundantsequenceswereobtained.Amongthem,32ESTsshowedsimilaritytoknownsequencesinGenBank.Then,all37ESTsequences

8、wereimportedtothedatabaseoftranscriptomesequencingbuiltwiththesamplesofthesametwomixtures,andtheirRPKMratiosoftheinoculatedsamplestonon-inoculatedoneswereregardedasthegenerelative收稿日期:2014–11–18

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