芽孢杆菌PY1的菌种鉴定及其抗真菌产物的分离纯化、性质研究和结构鉴定

芽孢杆菌PY1的菌种鉴定及其抗真菌产物的分离纯化、性质研究和结构鉴定

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时间:2019-05-11

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1、四川大学博士学位论文芽孢杆菌PY-1的菌种鉴定及其抗真菌产物的分离纯化、性质研究和结构鉴定姓名:龚萌申请学位级别:博士专业:遗传学指导教师:程惊秋20060331四川大学博士学位论文断大小并加以回收;将16SrDNA片段连接入测序质粒载体,转化大肠杆菌后,通过蓝白斑筛选,挑取阳性克隆进行测序;将测得的序列提交到16SrRNA序列分析网站进行比对,鉴定PY一1菌的分类,并查找同源性最高的菌株,建立它们之间的系统进化树。最终两种鉴定结果一致判定PY—l菌是一株枯草芽孢杆菌。对APS的纯化,采用了分两步进行的方案:(1)使用酸沉

2、淀、甲醇抽提、分子筛层析的方法制得APS的初提品(后来由温江发酵工业研究所对该法进行进一步优化);(2)使用反相高效液相色谱,对APS实施精细纯化,得到了五个活性组分(命名APSI一5)。本研究中使用了SephasilPeptideC8、S叫RCE15RPC和SoURCE5RPC三种的反相层析柱对APS的纯化条件进行摸索,并用CosmosilC18分析柱分析分离产物的纯度;在比较分析了三种层析柱应用于APS分离的优缺点后,最终确定使用SOURCE5RPC反相层析柱纯化制备大量APS。纯化后的APS对双缩脲反应呈阳性以及酸解

3、后对茚三酮的显色反应,确认了其本身氨基酸、肽键结构的存在;但天然状态APS对茚三酮的阴性反应,提示着APS有不同于普通多肽的特殊结构。稳定性测试表明APS具有很高的稳定性,它对酸、碱、高温和变性剂都有很强的耐受性。使用紫外光谱和荧光光谱对APS进行了分析:APS在275nm处有特征紫外吸收峰;用277nm激发光可以使APS产生最强荧光;APS在281nm激发光下发射荧光在307nm处出现最大值,而在295nm的激发光下基本不产生荧光:这些结果表明APS有酪氨酸残基,而无色氨酸残基,并且酪氨酸残基位于分子表面直接暴露在水相中

4、。APS具有广谱的高效抗真菌作用,对多种动植物真菌病原体以及酵母都有优于氟康唑的抑制作用,而且APS卜5具有活性增强的趋势。以氨基酸组成分析为参考,主要应用质谱和核磁共振技术对APS的n四川I大学博t学位论文化学结构进行了解析:使用电喷雾时间飞行质谱测定了APS的分子量,从APSI一5分别为1042,1056,1056,1072,1072,猜测五种APS为同系物。选取APSI和APS4进行氨基酸组成分析,结果表明它们的氨基酸组成一样,即含Asx、Glx、Pro、Ser和Tyr,比例为3:1:l:1:1,推测五种APS都是相

5、同的氨基酸组成。用高分辨率质谱结果计算出APSI的合理分子式。结合氨基酸组成,使用快原子碰撞诱导碎裂串联质谱(FAB—MS:/MSCID)识别APS中的氨基酸残基,从谱图中分析出两套离子碎片,以此判定APS为一类环肽,并推导出APS的氨基酸序列;由1H-1HCOSY、1H-'HTOCSY、‘H-'HNOESY三种核磁共振谱再次识别APS的氮基酸残基并推导序列,并与质谱结果相互映证,最终确认APS的氨基酸序列为cyclo-Tyr-Asn—Gln—Pro—Asn—Ser—BAA-Asn。五种APS氨基酸序列相同,其差别在于B氨

6、基酸(BAA)的碳链长度和构型,B氨基酸的结构由一维碳谱、DEPT谱和HSQc谱共同识别。关键词:芽孢杆菌PY_l;抗真菌多肽APS;菌种鉴定;分离纯化;理化和生物学性质;结构鉴定。IllldentificationofBaci,lusPY一1StralnandPurification。CharacterStudyandStructuraIAnalysisofItsAntifungaIProductAbstractAtpresent,utilizationofantibioticdrugswasthemainmethodt

7、ocurebacterialinfection,butthereisshortofeffectivedrugsagainstfungalinfectionyet.Aseukaryote,fungihavethesimilarcellstructureandenzymecatalysissystemasplantandanimal,sotheantibioticsagainstbacteriacannotaffectfungiandantifungaldrugsoftenhavestrongtoxicitytothecell

8、sofplantandanimal.Fungalpathogensoftenattackthepatientswhoseimmunesystemwasruined,suchastheAIDSpatlents,terminalcancerpatients(especiallyafterradiothera

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