基于结构频谱的蛋白质三维结构研究

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1、分类号:——密级:——单位代码:!Q鲤Z学号:2QQ垒!Q!18西北大学博士学位论文指导教师周塑全专业技术职务筮攮学科(专业)一一盐簋查噬盐鱼墨途答辩日期学位授予日期二oo七年六月AStudyOnThreeDimensionalProteinStructureBasedOnStructuralSpectrumABSTRACTOneoftheaimsofHm'nanGg'nomeProjectistoelucidatethestructures,functionsandinternalinteractionsofaboutahundredthousandprotein

2、sofhumanbeingaswellastheirrelationswithvariousdiseases.n把threedimaasionaistructureofproteiniscloserelatedwithit’sfunction,thusthestudyofproteinstructureisthecoreissueofProtcomics.However,comparingthree-dimensionalstructuresbe

3、嘶嘞proteinsisataskofcomputergraphics.Thcdissertationfocuseson

4、keytechniquesofsuchcomparison,whichisdoneinbothglobalandlocalgcnseandproposeseffluentmethodsinmulti-levelcomparisonofprotein’Sspacialslxucturvs.11leresearchworks黜asfollows:1.Wilh盐integrationofdatamining,computergraphicsanddigitalimageprocessing,thedissertationfirstexaminesthedatanormal

5、izationofprotein’sthreedimensionalm-uctures,thmfeatureextractionandthemulti.1evelcomparisonofthreedimensionalstruct甜es,andfinallyproposesamechanismofcan了ingouttheprotein'sspacialcomparisoninbothglobalandlocalsense.2.Visualizationofprotein'sthree-dimensionalstructure.3.Bymeansofanalyzin

6、gtheprotein'swincipalcomponentwithsecond-ordermoments,establishthethree-dimeusionalunifiedcoordinatesofproteins.Underthecoordinates,implementwavelettransformtobuildthemulti.scalespectrumofthespatials仃ucturethatrepresentsprotein'sa-carbondistanceanditscoordinatesequencerespectively.Thus

7、,theprotein'smulti-levelfeaturesareextracted.4.Utilizethegreyincidencetheorytocomparetheprotein'sspatialstructureandthenanalyzetheprotein'sstructuralspectrum,whichcomprehensivelydescribethesimilaritiesoftheprotdn'sspacialstnlcturesinmulti-scales翻1辩.5.Implementfractalanalysistothesimila

8、rifiesoftheprotein'sspacialstructurespectrum,whichshowsanotherwayofmulti.1evelcomparisonbetweenproteins.ThisresearchisfundedpartlybytheNa6伽lalNaturalScienceFoundationofChinaandfullybydedicatedresearchplanofShaanxieducationbureau,Keywords:structuralspectrum,unifiedcoordinates,greyinci

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