猪肌纤维和眼肌面积性状全基因组关联研究

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1、ＮＸ誦１懂码……学号Ｂ２０１２１０３３ｖ＾ｉｆＡ＃全曰制博±学位论文猪肌纤维和眼肌面巧性状全基因组关联研究姓名；郭云雁指导教师：刘文忠教授王立贤研究员学科专业；动物遗传育种与繁殖培养单位；动物科技学院中国？山西？太谷二〇－五年六月Ｍａｓｔ：ｅｒＤｅｒｅｅＤｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎｇ－ｗＧｅｎｏｍｅｉｄｅ乂ｓｓｏｃｉａ村ｏｎＳｔｕｄｙｏｎＭｕｓｃｌｅＦｉｂｅｒａｎｄＥｙｅＭｕｓｃｌｅＡｒｅａＴｒａｉｔｓｉｎＳｗｉｎｅＹｕｎｙａｎＧｕｏｃｒｖ＊Ｓｕｉｓｏｉ；Ｐｒｏ化ｓｓｏｒＷｅｎｚｈｏｎＬ

2、ｉｕｐｇＰｒｏｆｅｓｓｏｒＬｉｘｉａｎＷａｎｇＭａｏｒ：ＡｎｉｍａｌＧｅｎｅｔｉｃｓＢｒｅｅｄｉｎａｎｄｊ，ｇＲｅｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎＲｅｓｅａｒｃｈＦｉｅｌｄ：ＭｏｌｅｃｕｌａｒＥｖａｌｕａｔｉｏｎａｎｄＣｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎｏｆＡｎｉｍａｌＧｅｎｅｔｉｃＲｅｓｏｕｒｃｅｓＴａｉｕＳｈａｎｘｉＣｈｉｎａｇＪｕｎｅ２０１４，学位论文原削性声明本人郑重声明：所提交的学位论文，是在导师指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体色经发表或撰写过的作品成果。对本文研究

3、做出过重要贡献的个人和集体，均已在文中ｋ义明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担。作者签《（亲笔）：ｉｘ＾ｗ主年月１曰眼７詩学位论文版枚使用授枚书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定。即学位论文的知识产权属山西农业大学；同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的原件、复印件和电子版；允许论文被查阅和借阅；本人授权山西农业大学可ｋ乂将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｖ乂采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。作者签為玄｜（亲笔）：詔棘疋〇（少年《月Ｉｆ曰导师签《（亲笔）：ｗＡ年

4、谷月曰＾＾本硏究由＂Ｗ国家十二五科技支撑计划（２０１１ＢＡＤ２８Ｂ０１）；－００３现代农业产业技术体系（２０１１ＺＸ０８００６）；－５中国农业科学院基本科研业务专项（２０１１Ｃｊ；２０１２ＺＬ０６９）项目资助Ｔｈｉｓｒｅｓｅａｒｃｈｗａｓｓｕｐｐｏｒｔｅｄｂｙ：ＮａｔｉｏｎａｌＫｅＴｅｃｈｎｏｌｏＲ＆ＤＰｒｏｒａｍｙｇｙｇＮｏ．２Ｄ＂ＢＡＤ２８Ｂ０＂（Ｍｏｄｅｒｎ－ＡｒｏｉｎｄｕｓｔｒＴｅｃｈｎｏｌｏＲｅｓｅａｒｃｈＳｓｔｅｍｇｙｇｙｙＮＯ－．２０１１ＺＸ０８００６００３（）Ｃｈｉｎｅ化乂ｃａｄｃｍｏｆＡｒｉｃｕｌｔ

5、ｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓＦｏｉｍｄａｔｉｏｎｙｇ２０１１ｃ－５２０１２ＺＬ０６９（ｊ；）目录一第章文献综述３１３．１研究背景１．２猪肉质性状概述４１．２４．１度量猪肉质性状的常用指标１．２．２影响猪肉质的因素５１．３肌纤维和眼肌面巧的研究现状６１．３６．１肌纤维组织学对肉质的影响１．３．２肌纤维的类型６１．３．３家畜的肌纤维生长发育规律８１．３．４影响畜禽肌纤维性状的因素８１．３．５眼肌面积的研究现状１０１１１．４鉴定主效基因的几种主要方法１．４．１基因组扫描（Ｇｅｎｏｍｅｓｃａｎｎｉｎｇ）法１

6、１１．４．２候选基因（Ｃａｎｄｉｄａｔｅｅｎｅ）法１３ｇ１．４．３全基因组关联分析ＧＷＡＳ）法１４（１．４．４肌纤维和眼肌面积的ＱＴＬ研究现状１５１．５全基因组关联分析的研究进展１５１１．５．１全基因組关联分析的优势及现状５１．５．２影响全基因组关联分析准确性的因素１６１．５１７．３全基因组关联分析在动物育种中的应用现状１１．５．４全基因组关联分析在人类复杂疾病中的研究成果８一１．５．５全基因组关联分析中存在的些问题１９１．５．６全基因组关联分析的展望１９２０１．６研究目的及意义第二章材料与方法２１２２１．

7、１试验材料２丄１试验动物２１２２２丄２姐织样品采集与保存２丄３主要试剂和溶液配制２２２２试验方法２４２．２．１试验程序２４４２．２．２肌纤维组织学性状与眼肌面积的测定Ｗ及记录２２．２．３猪基因组ＤＮＡ的提取与检测２６２．２．４ＳＮＰ基因型的判定２７２．３数据整理与分析２９２．３．１表型数据分析２９２．３．２全基因组关联分析２９２．３．３