志贺菌中整合子及iscr1携带情况及其与耐药性的关系

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1、分类号:R378.2学校代码:10062密级:公开学号:2012602371硕士学位论文MASTER’SDISSERTATION论文题目:志贺菌中整合子及ISCR1携带情况及其与耐药性的关系TITLETheCarriageofIntegronandISCR1inShigellaIsolatesandtherelationshipwithResistance一级学科:临床医学二级学科:内科学传染病论文作者:董利娟指导教师:祁伟天津医科大学研究生院二〇一五年五月分类号:R387.2学校代码:10062密级:公开学号:2012602371学位类别:科学学位专业学位学科门类:医学硕

2、士学位论文MASTER’SDISSERTATION论文题目:志贺菌中整合子及ISCR1携带情况及其与耐药性的关系TITLETheCarriageofIntegronandISCR1inShigellaIsolatesandtherelationshipwithResistance一级学科:临床医学二级学科:内科学传染病论文作者:董利娟指导教师:祁伟天津医科大学研究生院二〇一五年五月学位论文原创性声明本人郑重声明:所呈交的论文是我个人在导师指导下独立进行研究工作取得的研究成果。除了文中特别加以标注引用的内容和致谢的地方外,论文中不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果,

3、与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。学位论文作者签名:日期:年月日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解天津医科大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,并采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编以供查阅和借阅。同意学校向国家有关部门或机构送交论文,并编入有关数据库。保密,在年解密后适用本授权书。本论文属于不保密。(请在相对应的方框内打“√”)学位论文作者签名:日期:年月日导师签名:日期:年月日天津医科大学硕士学位论文中文摘要细菌性痢疾(简称菌痢)以志贺菌为病原体,从发现至今

4、已有百余年的历史,是常见急性肠道传染病,也是我国最常见的感染性腹泻之一,居于法定传染病发病率的第3位。每年的发病患者数接近50万,发病率居37种监测感染性疾病[1]的前几位,对公众健康造成严重威胁。近年来我国经济迅猛发展,人民生活水平日益提高,菌痢的发病率呈现逐年下降趋势,但由于志贺菌型繁多易变迁,且菌型之间无交叉免疫,及耐药菌株的不断产生,使得细菌性痢疾的发生和流行仍较严重。抗生素的应用为临床中治疗细菌性痢疾带来类福音,但是随着长时间大量的使用,甚至滥用,志贺菌耐药率逐年上升,并呈现多重耐药趋势。对其耐药机制的研究发现,整合子及插入序列共同区(ISCR)作为一种可移动[2]元

5、件,与志贺菌属耐药率上升及多重耐药趋势的出现密切相关。整合子基本结构主要由5'保守区(5'conservedsegment,5'CS)、3'保守区(3'conservedsegment,3'CS)和两者之间的可变区(variableregion)组成。整合子5'CS包括intI、attI和Pant,分别编码整合酶、整合子重组位点和整合子可变区启动子;可变区包括不同数量和类型的基因盒,其中大部分是耐药基因盒,被称[3]之为多种耐药基因的储存库,目前已发现有70余种;3’CS区则因整合子类型不同而异。目前已被分为10类,相关研究表明,1类、2类整合子与志贺菌的多[4]重耐药现象密切

6、相关。ISCR作为一类新型的可移动遗传元件,不需要特异识别即可移动任何邻近的细菌DNA序列,它是通过和整合子序列的相互作用把基因加到系统中,从而[5]使得整个耐药基因组件能从一个细菌的细胞转移到另一个细菌细胞当中。根据其氨基酸序列以及同源性的不同,目前,ISCR家族已发现有24个成员。研究发现,肠杆菌科细菌中以ISCR1常见,并且ISCR1的下游与许多耐药基因相连,如氨基糖苷类耐药基因(armA,rmtB)、喹诺酮类耐药基因qnr、β-内酰胺类耐药基因和氯霉素类耐药基因(catAⅡ)等;其对目前已有的抗感染方案,尤其是对抗革兰阴性菌感染的方案造成严重威胁。研究目的:为了解天津地

7、区志贺菌临床株1类、2类整合子及ISCR1携带情况并分析其与耐药性的关系。材料与方法:收集2009-2013年分离自天津医科大学第二医院、天津市儿童医院和天津医科大学总医院3所三级甲等医院肠道门诊就诊患者的粪便标本中志贺I天津医科大学硕士学位论文菌,共计159株,采用生化及血清凝集法鉴定其血清学分群,采用K-B纸片扩散法对14种临床常用抗生素进行药敏试验,分析并比较志贺菌不同血清型对不同抗菌药物的耐药率。通过PCR基因扩增技术对1、2类整合子及ISCR1在志贺菌中的分布情况、携带的耐药基因盒

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