粗山羊草叶绿体基因rna编辑位点的鉴定与分析

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1、分类号：S330学校代码••10712UDC：581.1研究生学号：2013050083密级：公开©*灶农林奇祆大学2015届攻读硕士学位研究生学位（毕业）论文粗山羊草叶绿体基因RNA编辑位点的鉴定与分析学科专业作物遗传育种研究方向作物生物技术与育种研究生王梦醒指导教师宋卫宁教授完成时间2015年5月中国陕西杨凌Classificationcode:S330Universitycode:10712UDC:581.1Postgraduatenumber:2013050083Confidentialitylevel:PublicThe

2、sisforMaster’sDegreeNorthwestA＆FUniversityin2015IdentificationandAnalysisofRNAEditingSitesinChloroplastTranscriptsofAegilopstauschiiL.Major:CropGenetics&BreedingResearchfield:CropBiotechnology&BreedingNameofPostgraduate:WangMengxingAdviser:ProfessorSongWeiningDateofsu

3、bmission:May2015YanglingShaanxiChina研究生学位（毕业）论文的独创性声明本人声明：所呈交的硕士学位（毕业）论文是我个人在导师指导下独立进行的研究工作及取得的研究结果；论文中的研究数据及结杲的获得完全符合学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》，如果违反此规定，一切后果与法律责任均由本人承担。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究结果，也不包含其他人和自己本人已获得西北农林科技大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的

4、同事对本研究所做的任何贡献均已在论文的致谢中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名时间：>&年t月日导师指导研究生学位（毕业）论文的承诺本人承诺：我的硕士研艽生._所呈交的硕士学位（毕业）论文是在我指导下独立开展研究工作及取得的研究结果，属于我现岗职务工作的结果，并严格按照学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》而获得的研究结果。如果违反学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》，我愿接受按学校有关规定的处罚处理并承担相应导师连带责任。关于研究生学位（毕业）论文使用授权的说明本学位（毕业）论文的知识产

5、权归属西北农林科技大学。本人同意西北农林科技大学保存或向国家有关部门或机构送交论文的纸质版和电子版，允许论文被查阅和借阅；同意西北农林科技大学将本学位（毕业）论文的全部或部分内容授权汇编录入《中国优秀頌士学位论文全文数据库》进行出版，并享受相关权益。本人保证，在毕业离开（或者工作调离）西北农林科技大学后，发表或者使用本学位（毕业）论文及其相关的工作成果时，将以西北农林科技大学为第一署名单位，否则，愿意按《中华人民共和国著作权法》等有关规定接受处理并承担法律责任。任何收存和保管本论文各种版本的其他单位和个人（包括研究生本人）未经本论

6、文作者的导师同意，不得有对本论文进行复制、修改、发行、出租、改编等侵犯著作权的行为，否则，按违背《中华人民共和国著作权法》等有关规定处理并追究法律责任。(保密的学位论文在保密期限内，不得以任何方式发表、借阅、复印、缩印或扫描复制手段保存、汇编论文）研究生签名：时间：年6月5曰导师签名：时间：沐•年g&月飞粗山羊草叶绿体基因RNA编辑位点的鉴定与分析摘要RNA编辑是指基因转录后在mRNA中核苷酸插入、缺失或替换而改变原来的遗传信息的过程，是高等植物叶绿体基因转录后表达调控的一种重要方式。粗山羊草（AegilopstauschiiL.

7、）是普通小麦D组染色体的供体，其叶绿体基因组测序工作已于2014年完成，但对其RNA编辑位点的研究尚属空白。本研究首次采用三种方法——生物信息学预测、RNA-Seq数据map和分子克隆，对粗山羊草叶绿体基因组76个蛋白编码基因的RNA编辑位点进行鉴定，分析了编辑对蛋白结构的影响，并特别地与普通小麦、普通小麦其他染色体组供体种，以及大麦、黑麦、水稻、玉米和甘蔗等禾本科物种的叶绿体基因RNA编辑进行了比较，以期为解析粗山羊草叶绿体基因的表达调控和探讨禾本科物种叶绿体RNA编辑位点的起源进化提供理论依据，主要结果如下：1．在粗山羊草76

8、个叶绿体蛋白编码基因中，共预测到分布于15个基因的34个编辑位点，均为C到U的转换。其中以基因ndhB的编辑位点最多，有9个。在这些编辑位点中，88.24%的编辑位点发生在密码子的第二位碱基，其余11.76%的编辑位点发生在密码子的第一位。氨基酸的