玉米谷氨酰胺合成酶基因gln1-3和gln1-4的序列变异及其与产量相关性状的关联分析

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2、２２５００９等＼杨泽峰副教授，扬州大学，江苏扬州，—＾．－■：硕壬学科专业名称：作物遗传育种申请学位级别；／１５论文提交日期；２０年５月论文答辩日期：２０１５年５月起ｙ畫三＾＇峡－２０１５学位授予单化扬州大学学位授予日期：年６月一一＾觀麵結、’哼＾辜若苗寒？＾菩＇秦議聲气巧ｔ舞縷詳參私皆若嗦’為巧泰卢券早黎讓弓勢裝１ＳｅｑｕｅｎｃｅＶａｒｉａｔｉｏｎＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＧｌｕｔａｍｉｎｅＳｙｎｔｈｅｔａｓｅＧｅｎｅ－５ａｎｄＧ－Ｇ７ｗｉ／ｗ７４ａｎｄＩｔｓＡｗｏｃｉａｔｉｏｎｗｋｈＧｒａｉｎＹｉｅｌｄＲｅｌａｔｅｄＴ

3、ｒａｉｔｓｉｎＭａｉｚｅＺｅａｍａｓＬ．（ｙ）ＢｙＹａｏＺｈｅｎｇＡＤｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎＳｕｂｍｉｔｔｅｄｔ；ｏＹａｎｇｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｉｎＰａｒｔｉａｌＦｕｌｆｉｌｌｍｅｎｔｏｆ化ｅＲｅｑｕｉｒｅｍｅｎｔｆｏｒｔｈｅＭａｓｔｅｒＤｅｇｒｅｅｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＳｕｐｅｒｖｉｓｏｒＢｙＰｒｏｆ．ＣｈｅｎｗｕＸｕＡｎｄＡｓｓｏｃｉａｔｅＰｒｏｆ．Ｚ却如Ｉ舟客妨客ＹａｎｇｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＹａｎｚｈｏｕ２２５００９ＲＲ．Ｃｈｉｎａｇ，，Ｍ

4、ａｙ２０１５玉米谷氨献胺合成酶基因饼和的序列变异及其与产量相关性状的关联分析中文摘要玉米是我国重要的粮一、经、饲Ｈ元作物。玉米产量是个复杂的数量性状，受诸多因素的影响。在玉米种质资源中蕴含着许多影响玉米产量相关性状基因的等位变异，鉴定出这些等位变异，并开发与这些变异紧密相关的功能性标记，从而通过分子标记选择的手段进行种质创新和遗传改良。和基因是玉米谷氨醜胺合成酶（ＧＳ）基因家族的重要成员，编码穗部与茎巧同工酶，与巧粒产量和柯粒大小紧密相关。本研巧Ｗ８７份变异丰富的的优良玉米自交系为试验群体，基于ＮｉｍｂｌｅＧｅｎ目标序列捕获平台技术，对基因和

5、饼进行了目标序列重测序，并分析目的基因在供试自交系中的核昔酸多态性和单倍型密度。在此基础上，结爸兰亚和青岛的产量相关性状的测定数据，，采用候选基因关联分析方法筛选出与产量相关的优异等位变异位点。主要研究结果如下；１、对８７份玉米自交系中和基因序列进行多态性分析，结果发现：基－－因饼ｎｉ３共检测到１３６个ＳＮＰ和９５个Ｉｎｄｅｌ／，其中编码区有７个ＳＮＰ，基因ＧｎＪ４共检测到１５８个ＳＮＰ和６９个Ｉｎｄｅｌ，其中编码区有２０个ＳＮＰ。尽管基因Ｇ／ｎＷ和编码区的变异频率远低于内含子区段，但编码区的ＳＮＰ仍将两个基因分别划分为７个和１９个单倍型。和饼基因的多态

6、性位点之间处于商度的连锁不平衡，其连锁不平衡随物理距离的增加而迅速衰减。２、基于候选基因关联分析的结果发孤基因编码臣共检测到３个多态性位点：ＳＮＰ２１４（Ｃ／Ｔ）６１％ＳＮＰ４４ＡＣ）与产量性状显著关联与粒厚显著关联，贡献率．８；（／＿＿，７１％４９Ａ与穗重显著关联．７ＳＮＰ（Ｃ／），贡献率；Ｊ与粒长、粒重、穗重显著关联对穗重的贡献率最大为８．４４％。饼基因编码区在两个环境中共检测到８个与产量性状显著关联的多态性位点：其中与Ｈ亚表型数据共关联到５个位点，分别与粒长、粒宽、穗粗和壳顶长显著关联，与青岛表型数据共关联到５个位点，分别与轴粗、穗粗、秀顶长

7、、粒长、穗行数和粒宽显著关联，５０（ＴＰＬ），其中位点ＳＮＰ／Ｃ）为非同义突变，引起氨基酸的改变（／，＿＾在两个环境中均与粒长达到了盈著关联，贡献率分别为５．４４％和６．２５％。关键词：玉米；产量性状：饼；彷序列变异：关联分析ＳｅｑｕｅｎｃｅＶａｒｉａｔｉｏｎＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＧｌｕｔａｍｉｎｅＳｙｎｔｈｅｔａｓｅＧｅｎｅ－－ｉａｎｄＧ／ｗ７４ａｎｄＩｔｓＡｓｓｏｃＧ／ｎｉｉａｔｉｏｎｗｉ化Ｇｒａ