玉米gbss基因序列变异及其与籽粒淀粉品质性状的关联分析

玉米gbss基因序列变异及其与籽粒淀粉品质性状的关联分析

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1、可.奔兰柄巧.練'一龙.斬纖键、-*一'違一^‘'.巧?.年一YANGZHOUuniversity坪一,^、W、^’(学术型X巧)―"'.六:苗、'.:今'辦A:,':每'岭.衫琴军米G公做基因序列变异及其与舒粒淀扭昂两兴>爲知性状的关联分析,蠢紙若r._,、??一項如静為巧吝寒心一:光^-的V记.决:抑%冷巧黄.指导教师姓复徐辰武教授,扬州大学,江苏扬州,225009、‘'一一?-?:..?户?二■*卢'‘式^.…戈二杨泽峰副教授,,江苏扬州‘:;扬州大学,2250

2、09:;申^位级别:学科专业名称:屋補應寞<,.A.论文提巧日期;2015年5月论文答辩日期:2015年5月4乃.'^'*■■巧C^-吟每^W’—.学位授予单位:扬州大学学位授予日期:2015年6月>_’"-"答辩委员会主席';:—陈秀g^^笔装V户接—纖输.隸議讓V击SeuenceVariationsofMaizeGBSSGenesandTheirqAssociationswithStarchualitTraitsQyByJinLiu

3、gADissertationSubmitedt;oYangzhouUniversityinPartialFul巧llmentoftheReuirementfor化eMasterDereeofqgAriculturalSciencegSuervisorBProf.ChenwuXupyAndAssociateProf.yit班各YanzhouUniversitgyYanzhou225009P.R.Chinag,,May2015玉米G公微基因序列变异及其与巧粒淀紛

4、品质性状的关联分析摘要玉米是全球超过9亿人口的主食。玉米淀粉在世界淀粉市场中占据了80%的份额,在食品和工业应用中具有重要的经济价值。淀粉含量和组成是受很多基因控制的复杂的数量性状。研究淀粉合成相关基因和玉米淀粉好粒品质性状间的关系对优良品种的选育和淀粉品质的遗传改良有重要的指导意义/知基因是颗粒结合型淀粉合成酶。和G化班GBSS)基因员,参与玉米好粒中直链淀粉的合成。本研究首先对91(家族的重要成份优良玉米自交系(80份普通玉米自交系和U份懦玉米自交系)中这两个基因的序列进行目的基因重测序,并分析了该二基因

5、在供试玉米自交系群体中的变异情况;在此基础上,基于候选基因的关联分析方法对该基因中的变异位点与玉米梓粒中淀粉糊化特性(包括峰值黏度PV、谷值黏度TV、终值黏度FV、崩解值BD、回复值SB、糊化时间PT、糊化温度PTP)、热力学特性(包括糊化起始温度To、峰值温度巧、终值温度Tc、热焰值AH)和直链淀粉含量AC共12个性状进斤了关联分析。分析结果如下:(1)对91份玉米自交系中G化掛/和G公SS/A7基因序列进行多态性分析结果发现:G化拍/基因在900SNP(70InDel1个玉米自交系中共检测到1个单核巧酸多态性位点)

6、和个一一(.SNP,62.4bIlGS猫化插入/缺失事件),平均每4368bp有个每p发生个nDe。J基54一S因在91个玉米自交系中共检测到199个SNP位点和个InDel,约每34.6bp有个NP,4b一IDl每]27.p生个ne。发(2)方差分析结果表明,12个品质性状在80份普通玉米自交系间和H份懦玉米自交系间均达到极显著水平。相关分析发现,淀粉热力学特性参数与糊化特性参数W及AC一:AHTVV、SB显,PTP7、T,AC间存在定的相关性与、F著正相关与>c显著相关与AH显著相关。在91份自交系中,无论普通玉米

7、自交系还是懦玉米自交系中AC与糊化特性各性状间均无显著相关关系。(3)基于候选基因关联分析发现,G化SSZ基因的两个SNP和两个InDel事件与AC、 ̄TV,224%、FV、SB、PTPt^及AH6个淀粉品质相关性状存在思著关联可解释8.14%.3的表型变异InDel3与AC、FV、SB、PTP、AH五个品质性状间均存在极显著。其中位点_〇〇〇19.1/1726/〇、21.97%、8.14%和9.69/〇;InDl2关联,贡献率分别为7〇、.e与AC极显著关_■联,贡献率达17.49%。此外,G做細口基因的4个

8、SNP与Tc、TV化及SB3个淀粉品质?%4.62%8。其中SNP9T,相关性状显著关联,可解释表型变异为.09与c存在显著关

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