玉米株高相关基因dwarf3和dwarf9的序列变异及其与产量相关性状的关联分析

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5、ｒｅｅｏｆＡｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｇＳｕｅｒｖｉｓｏｒＢＰｒｏｆ．ＣｈｅｎｗｕＸｕｐｙＡｎｄＡｓｓｏｃｉａｔｅＰｒｏｆ．Ｚｅ／ｃ解妨ｗ客ＹａｎｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｇｙＹａｎｚｈｏｕ２２５００９，ＲＲ．Ｃｈｉｎａｇ，Ｎｏｖｅｍｂｅｒ２０１５玉米株高相关基因公和公胃听的序列变异及其与产量相关性状的关联分析中文摘要本研究Ｗ８１份变异丰富的优良玉米自交系为试验群体，基于ＮｉｍｂｌｅＧｅｎ目标序列捕获平台技术，对公和公ｗａ妍基因进行了目标序列重测序，并分析目的基因在供试自。１３交系

6、中的核昔酸多态性在此基础上，结合个产量相关性状，采用候选基因关联分析方法，筛选出与产量相关的优异等位变异位点。主要研究结果如下：＞１、基因序列进行多态性分析：对８１份玉米自交系中公ｗａ听和０＞＾所，结果发现ＺＶａ诉基因在供试群体中共有３０８个变异位点，包括２１９个ＳＮＰ和８８个ＩｎＤｅｌ，其中编码区有３９个ＳＮＰ；基因共检测到８２个ＳＮＰ和２５个ＩｎＤｅｌ，其中编码区有５２个ＳＮＰ。对目的基因的ＳＮＰ位点进行连锁不平衡分析，结果显示，部分ＳＮＰ位点处于较强的连锁不一些ＳＮＰ位点之间连锁不平衡现象比较弱平衡（ＬＤ）状态，而另。这种ＳＮＰ位点间Ｌ

7、Ｄ程度的差异，可能是由于自交系在选育过程中，不同基因承受的选择压力不同所导致的。２＞、基于候选基因关联分析的结果发现，在两个环境下￡＾０诉基因筛选到８个ＳＮＰ位点与产量相关性状显著关联，其中ＳＮＰ２８２０与株高显著关联，对株高的贡献率为＿７．４４％，且该位点为有义突变，能引起氨基酸序列的改变（Ｔ／Ｐ）。基因编码区共检测到８个多态性位点与产量性状显著关联：ＳＮＰ１５６９（Ａ／Ｃ）与株高显著关联，贡献率为６．３８％，且ＳＮＰ＿１５６９为非同义突变位点，能引起编码蛋白质序列的改变。ＳＮＰＷ５（Ｇ／Ｔ）＿分别与穗长和秀顶长显著关联，。