玉米自交系产量和品质相关性状与简单重复序列(ssr)的关联分析(可编辑)

玉米自交系产量和品质相关性状与简单重复序列(ssr)的关联分析(可编辑)

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1、玉米自交系产量和品质相关性状与简单重复序列(SSR)的关联分析碟襁僦榴耥蹴搿农。::/麓/..飘明?一。。尊研究报告玉米自交系产量和品质相关性状与简单重复序关联分析李伟忠姚希勤许崇香闵丽陈庆山胡国华,黑龙江省农垦科研育种中心,哈尔滨;东北农业大学,哈尔滨同等贡献作者通讯作者,.;..摘要为寻找并确定控制玉米产量、品质的基因组区域,本研究利用对核心标记对份玉米.自交系构成的群体进行基因分型,分析群体连锁不平衡位点、群体结构,在此基础上,采用软件的程序对株高、穗位、生育期、穗长、穗行数、百粒重、脂肪含量、蛋白质含量和淀粉含量共个性状的表型数据与标记进行回归分析,确定标记对表型的解释率。

2、结果表明:在公共图谱上的位点组合都有一定程度连锁不平衡,,.时,成对位点占总位点组合.%,’.成对位点比例为.%。数据遗传结构分析表明,群体可分为个亚群。共鉴定出个标记位点与个性状相关联,大多集中在、、和染色体上,其中第染色体上标记最多,为个。个位点的变异分别与株高、穗位、生育期、穗长、穗行数和蛋白质含量等个表型性状极显著相关.,分别为作用于株高,对表型的解释率为.%;及作用于穗位,对表型的解释率为.%.%;及作用于生育期,对表型的解释率为.%.%;作用于穗长,对表型的解释率为.%;作用于穗行数,对表型的解释率为.%;及作用于蛋白质含量,对表型的解释率为.%.%;其他个标记与个性状

3、显著相关.。与单个性状关联的标记数目为~个,解释率为.%~.%。与产量相关性状关联的位点次累计为个,与品质相关性状关联的位点次累计为个,位点数目上品质性状远少于产量性状。部分标记与多个性状关联,可能是性状相关或一因多效的遗传基础,一些标记同时与某性状关联,多数标记与定位于遗传图谱的一致,也有互补性。研究结果表明,这些位点及其区域内存在很多与产量、品质等性状相关的,对提高玉米产量、改善玉米品质可能起到重要作用。关键词玉米,,关联分析,连锁不平衡,群体结构?????,“?,,,;,,..;..基金项目:公益性行业农业科研专项项目.和引进国际先进农业科学技术计划计划项目收稿日期:..接受

4、日期:??,.,,,,,,,一,,,,.:..%.,.%’...,,.,.,,,,,.:...%:.%.%;.%.%;.%:.%:.%.%....,.%.%...,.,..,,,,玉米的产量、品质相关性状多属于数量性状,于连锁作图,关联分析具有以下优点:获取研究群了解并掌握其基因型是玉米科研、育种工作的基本体周期短,只需要某种分子标记;检测范围广,能够前提。目前研究植物数量性状的方法主要是利用不同时扫描多个特异等位基因;选取材料广度大,自同的分子标记方法与适宜的分离群体进行连锁作然群体即可;检测精确度较高。图,。遗传连锁作图存在缺等首次通过关联分析法揭点:短期内很难构建出合适的分离

5、群体;仅能分析示了基因与玉米开花期的关系,将此方法两个材料的后代群体,只涉及两个特异等位基因;引入玉米。等选用高油玉米材料构成获得分离群体过程中,基因重组的次数较少,影响自然群体,对与油分有关的特异基因进行研究,结作图精度。果表明,与分离群体检测到数目相比,利用该针对遗传连锁作图法的缺点,研究基因间人工选择的群体检测到控制油分的数目是前连锁和重组的关联分析法发展起来。该方法选取实者的倍左右。等用全基因组关验材料,基于基因间连锁不平衡,对性状与特异等联分析对拟南芥口.与开花期位基因进行作图的关和抗病性状相关的特异等位基因进行了研究。近年联分析法.,;苗丽丽等,。相对来,采用全基因组扫

6、描,在玉米、大豆玉米自交系产量和品质相关性状与简单重复序列的关联分析.、小麦.等作物淀粉。分析表表明,份玉米自交系遗传差异重要性状与特异等位基因进行关联分析研究较大,遗传基础较丰富,试验材料构成的群体中可.,;杨小红等,;.,能存在优异等位变异。;张军等,;文自翔等,;窦秉德等,.位点的分析。随着各主要物种全基因组测序的完成及单核苷酸多态性.图为参与扫描的标记在供试玉米自交系连锁群上连锁不平衡表现,图中对角线上方的出现,关联分析法在玉米数量性状定位中的显示为’值,对角线下方为成对位点支持概应用会越来越广泛。率,其中方格的颜色分别与右侧色差代码相对应。各本研究选取对标记与份遗传基连锁

7、群上水平较高的标记’.多分布于础丰富的玉米自交系进行关联分析。基于群体连锁”、及”连锁群上黑色圈内,还包括其不平衡和遗传结构分析,运用全基因组扫描的关联他与这几个位点的组合,这几个群内用于扫描的分析方法,研究玉米自交系群体结构及初步确定与产量、品质相关性状相关联的标记位点,对玉米中位点数分别为、及个。全部用于扫描的标记位点组合数为个,无论是共线性组控制株高、穗位、生育期及蛋白质含量等重要产量、合同一染色体群,还是非共线性组合不同染色体品质性状的基因区域进行初步定位,可

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