ssr标记与玉米自交系主要性状的关联分析

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1、山东农业大学硕士学位论文SSR标记与玉米自交系主要性状的关联分析姓名:张倩倩申请学位级别:硕士专业:作物遗传育种指导教师:张春庆20120614山东农业大学硕士学位论文中文摘要一些重要的分子标记对玉米遗传性状的改良非常重要。本研究目的在于发掘与产量相关性状显著关联的位点,对分子标记辅助育种有重要的指导意义。以94份玉米自交系为试验材料,对调查的26个表型性状进行表型多样性分析;在分子水平上,用204对SSR引物对其进行遗传多样性、群体结构和SSR标记间的连锁不平衡(LD)分析:最后,运用基于全基

2、因组扫描的关联分析策略寻找与产量相关性状显著关联的位点,研究结果主要有以下几个方面:1.对该群体材料调查的26个表型性状进行表型多样性分析。用SPSS软件对2010年和2011年两年性状做相关分析。然后对两年性状的均值进行统计分析。轴重的变化范围为7.56-48.379,变幅最大,平均值为23.979,变异系数为37.88%。成熟期的变化范围为87.107天,变幅最小,平均值为97天,变异系数为4.76%。该群体材料26个性状均符合正态分布。这一变化反映出我们的群体材料有广泛的表型多样性,并且可

3、以用做关联分析。2.利用均匀分布于玉米lO条染色体的204对SSR引物对94份玉米自交系进行遗传多样性分析。结果表明,204对引物共检测到1286个等位变异,平均每个标记6.3个等位变异,变化范围为2.16个。PIC值和基因多样性值在每条染色体上分布均匀,平均值分别为O.61和O.66。基因多样性的最大值为O.8849,PIC值的最大值为0.8738,材料特性丰富。这表明本研究群体材料的遗传多样性较高。3.群体结构分析表明,当Ak=5时,得到最优分群结果,可以将自交系划分为5大种质类群,且分别对

4、应于我国玉米自交系的五大杂种优势群:旅大红骨、四平头、PB、Reid和BSSS群。以遗传相似性比例Q堂70%为划分标准,有73.40/0的自交系被归到相应的类群中,而其他材料遗传相似比例

5、平下,2010年和2011年分别有138和96个标记与26个性状关联,两年性状均值的关联位点有106个。2010年和2011年只有6个重复的关联位点。而这6个关联位点与两年数据均值比较得到3个重复的关联SSR标记与玉米自交系主要性状的关联分析位点。找到了一些强的关联位点,如在P<0.01水平下,umcl917分别和散粉期(AD)和百粒重(I-IKW)相关联,umcl397分别和轴粗(CD)和出籽率(KRO)相关联,在P<0.001水平下,umc2025和轴粗(CD)关联。发现了一些新的关联位点,

6、如bnl92162,bnlglll8,phi077,umcl161和苞叶长(BYC)相关联,bnlgll18和成熟期绿叶数(GLN)相关联。5.探讨遗传距离与产量杂种优势的关系,发现遗传距离与亩产量存在显著相关,相关系数为r=0.45”,建立数学模型.问.34422.9.96氟2+9.729x-2.089。遗传成分AQ值与亩产量也存在显著相关,r--0.50¨,建立数学模型尸∞.069x3-0.136x2+0.399。昌7—2是典型的SPT群,而齐319是典型的PB群,其遗传距离较远为1.104

7、9,因而其组配的杂交种的亩产量属于高产组合。一些遗传距离比较近的自交系,其组配的杂交种,被归为了低产组合。Reid和SPT,Reid和LRC,SPT和PB群组配的杂交组合产量较高。本研究结果对育种实践有一定的指导意义。关键词:玉米自交系;SSR标记;遗传多样性;群体结构;关联分析2山东农业大学硕士学位论文AbstractThegeneticmarkersofimportanttraitsareevaluatedinordertoimprovethemaizeinbredlines.Theobje

8、ctivesofourresearchweretofindsomeimportantyieldrelatedtraits而血strongassociationsofloci,whichwouldbeusefulforgeneticimprovementandmolecularmaker-assistedbreedinginmaize.Ninety—fourmaizeinbredlineswereusedtoaSSeSSthegeneticandphenotypicdiversityandmake

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