欧李果实转录组测序及苹果酸积累关键酶基因的克隆与表达分析

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1、。Ｒ？ＨＰ繼码１。…学号２０１１１０１９强悔山巧裴素六聲全曰制博±学位论文欧李果实转录组测序及苹果酸巧累关键酶基因的克隆与表达分析姓名；王鹏飞指导教师；杜俊杰教授学科专业；果树学培养单位：园艺学院中国？山西？太谷二〇—五年六月ＳｈａｎｘｉＡｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｇｙＦｕ－ｌｌＴｉｍｅＰｈ．Ｄ．Ｄｉｓｓｅｉｉ；ａｔｉｏｎＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅＳｅｑｕｅｎｃｉｎｇｏｆＦｒｕｉｔｓｏｆＣｈｉｎｅｓｅＤｗａｒｆＣｈｅｒｒｙＣｅｒａｓｕｓｈｕｍｉｌｉｓＢｅ．Ｓｏｋ

2、．ａｎｄＣｌｏｎｉｎａｎｄＥｘｒｅｓｓｉｏｎ＼（ｇ）］ｇｐＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＫｅｙＥｎｚｍｅＧｅｎｅｓＩｎｖｏｌｖｅｄｉｎＭａｌｉｃＡｃｉｄｙＡｃｃｕｍｕｌａｔｉｏｎＮａｍｅ－：Ｗａｎｇｅｎｆｅｉｐｇ－Ｓｕｐｅｒｖｉｓｏｒ：Ｐｒｏｆ．ＤｕｕｎｉｅｊｊＭａｏｒ：ＰｏｍｏｌｏｊｇｙＴｒａｉｎｉｎＵｎｉｔ：ＣｏｌｌｅｅｏｆＨｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒｅｇｇＴａｉｇｕＳｈａｎｘｉＣｈｉｎａｔＪｕｎｅ，２０１５学位论文原创性声贿本人郑重声明，是在导师指导下，独立进行：所提交的学

3、位论文研究工作所取得的成果。除文中已注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文研究做出过重要贡献的个人和集体，均已在文中ｋ乂明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担。之〇／文么月６日作者签名（亲《）：心心年／＾学位论文版权使用授枚书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定。即学位论文的知识产权属山西农业大学；同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的原件、复印件和电子版；允许论文被查阅和借巧；本人授权山西农业大学可ｋ乂将学位论文的全部或部分内容编入有

4、关数据库进行检索，可从采用影印、缩印或柱描等复制手段保存、；〔编学位论文。兴■＇作者签义（亲笔）ｉ《月日：主Ｗ名衣年２叫？年导师签違（亲笔／月日资助项目山西省科技重大专项（２０１２１１０１０１０）教育部高等学校博去学科点专项科研基金项目（２０１２１４０３１１０００３）山西省科技基础条件平台建设项目（２０１３０９１００４－０１０）目录摘要１一第章文献综述４１．１欧李种质资源与育种研究进展４１丄１欧李概述４１丄２欧李种质资源分布与收集４１丄３欧李种质资源遗传多样性与分类４１丄４欧

5、李品种选育５１．２果实苹果酸代谢研究６１．２．１苹果酸的特性与生理功能６１．６．２２果实中苹果酸代谢途径与积累模式１．２．３果实中苹果酸代谢关键酶及其基因研究进展７１１１．３转录组学研究１１．３．１转录组学概念１１．３．２转录組学研究方法１１１１１．３．３测序技术的发展１．３．４转录组测序技术在高等植物上的应用１３１．４本研究的目的意义１３第二章欧李果实转录组测序分析１５２．１试验材料１５２．２试验方法１５２．２．１试验设计１５２．２．２欧李果实转录组ｃＤＮＡ文库构建１５

6、２－．２．３欧李果实ＲＮＡｓｅｑ信息分析１７２．２．３．１测序产量统计１７２．．１８．２３２组装结果分析２．２．３．３Ｕｎｉｇｅｎ故功能注释及ＣＯＧ分类１９２．．ｉ通路分析２０．２３４Ｕｎｅｎｅ（ＫＥＧＧｇ）代谢２．２．３．５预测编码蛋白框ＣＤＳ）２０（２３６Ｕｎｉ２０．２．．ｇｅｎｅ表达差异分析２．３．ｉｅｎｅＯ和Ｐａｔｈｗａ２２．２７差异Ｕｎｇ的Ｇｙ分析２．３结果与分析２３２３１２３．．欧李转录组测序产量统计２２４．３．２欧李转录组测序组装２ｉｅｎｅ２６．３．

7、３欧李Ｕｎｇ功能注释２．３．２６．３１注释结果汇总２．３．３．２ＮＲ分类２６２３３３ＣＯＧ２７．．．分类２．３．３．４Ｕｎｉｇｅｎｅ的ＧＯ分类２８２．３．４欧李Ｕｎｉｇｅｎｅ代谢通路分析２８２．３．５预测编码蛋白框（ＣＤＳ）巧２．３．５．１ＣＤＳ核酸序列统计３３２．３．５．２ＣＤＳ蛋白质序列３４２．３．６不同欧李品种Ｕｎｉｇｅｎｅ表达差异分析３５２．３．７差异表达基因的ＧＯ功能分析３５２．３．７．１差异表达基因的ＧＯ功能分类３５２．３．７．２差异表达基因的ＧＯ功能富集３７２

8、．３．８差异表法基因的Ｐ