characterization of a novel badnavirus infecting taro grown in china by deep sequencing论文

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1、■-碱《葦义净HUAZHONGAGRICULTURALUNIVER別TYI博±学位论文PhDDISSERTATIONCHARACTERIZATIONOFANOVELBADNAVIRUSINFECTINGTAROGROWNINCHINABYDEEPSEQUENCING妍究生:CANDIDATEAMBERKAZMI:SYEDA肆师:拱奠教授SUPERVISOR:PROFESSORHONGNI专业:植物病理学MAJO

2、R:PLANTPATHOLOGY妍究方向;慟病毒学FIELD;化ANTVIROLOGY巾岡武汉WUHANCHINA,二〇一五年六月:密级分类号;华中农业大学博±学位论文CHARACTERIZATIONOFANOVELB乂DNAVIRUSINFECTINGTAROGROWNINCHINABYDEEPSEQUENCING博±研究生:SYEDAAMBERKAZMI学号:2011301060001指导教师:洪竟教授指

3、导小组:王国平教授T芳副教授徐文兴副教授王利平副教授专业:植物病理学研巧方向:植物病毒学获得学位名称:2015年12月:农学巧±获得学位时间华中农业大学植物科学技术学院二〇—五年六月华中农业大学学位论文独创性声明及使用授权书如需保密,解密时间年月曰在独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中特别加LX标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得华中

4、农业大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料一,指导教师对此进行了审定。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中做了明确的说明,并表示了谢意。研究生签名;心时间:巧年6月曰学位论文使用授权书本人完全了解华中农业大学关于保存、使用学位论文的规定,巧学生必须按照学校要求提交学位论文的印刷本和电子版本;学校有权保存提交论文的印刷版和电子版,并提供目录检索和阅览服务,可L乂采用《印.缩印或担描等复制手段保存、汇编学位论文1;(用不同方式在不同、传播学位论文的全

5、。本人同意华中农业大学可媒体上发表部或部分内容,为存在馆际合作关系的兄弟高校用户提供文献传递和交换服务,同时本人保留在其他媒体发表论文的权力.注:保密学位论文(巧涉及技术秘密、商业秘巧或申请专利等潜在巧巧提交保密的论文)在解巧后适用于本巧权书.学位论文作者签名:导师签雀:■56王签4曰巧I日:如年月曰签名曰期:年4月注:请将本表直接装订在学位论文的痛巧和目录之间Charac化lizationofanovelbadnavirusinfectingtaro

6、growninChinabydeepsequencingCONTENTSABSTRACTILISTOFABBREVIATIONSIllCHAPTER1LITERATUREREVIEW111.Taro121.Virusesin托ctintaro1g1.3TheenusBadnavirus2g1.31Introduction.2rhoo1.3.2Mol2pgy1.3.3Genomeoranization

7、g21.3.4ReplicationStrategyinBadnavirus51.4RollinCircleAmlification6gpe-seuenc1inofs.5DepqgRNA716RNASilencin7.g1.6silencin7.1Geneg1.6.2VirusinducedRNAsilencinginplants8coune-1.6.3Viraltrdefenseainstsilencin9

8、agg1.7BackgroundandObectivesofResearch9jCHAPTER2DETECTIONANDSEQUENCEVARIABILITYOFNOVELBADNAVIRUS1121INTRODUCTION11.2.2MATERIALSANDMETHODS122.2.1SurveyandSamleCollection12p2.2.2Primersusedforbad

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