转移野生稻基因组dna创新种质的遗传多样性和基因变异分析

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1、中图分类号UDC25$336学校代码10533硕士学位论文转移野生稻基因组DNA创新种质的遗传多样性和基因变异分析GeneticdiversityandgenevariationanalysisofthevariantsderivedfromgenomeDNAtransformationofwildrice作者姓名：学科专业：研究方向：学院(系、所)：指导教师：论文答辩日期垄!三：三：三2孙一丹作物遗传育种基因组DNA转移隆平分院赵炳然中南大学2013年5月答辩委员会主席原创性声明本人声明，所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了论文中特别加以标注和致谢

2、的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中南大学或其他单位的学位或证书而使用过的材料。与我共同工作的同志对本研究所作的贡献均已在论文中作了明确的说明。作者签名：堑二立日期：竺!三年—』￡月二堕二日学位论文版权使用授权书本人了解中南大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留学位论文并根据国家或湖南省有关部门规定送交学位论文，允许学位论文被查阅和借阅；学校可以公布学位论文的全部或部分内容，可以采用复印、缩印或其它手段保存学位论文。同时授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》，并通过网络向社会公众提供信息服务。日期：独!月妊转移野生

3、稻基因组DNA创新种质的遗传多样性和基因变异分析摘要：为了增加现代栽培稻的遗传多样性，进一步增强杂种优势，本研究将小粒野生稻和紧穗野生稻的基因组DNA通过穗茎注射法导入杂交水稻恢复系材料RH78，导入后的第一代共获得23株变异。这些变异株在剑叶长宽、植株高度、有效穗数、穗长、总颖花数、结实率和百粒重等性状上都有差异。部分变异株与受体相比在产量相关性状方面有很大改善，而且株型相关性状也有改良。通过240对微卫星和插入缺失引物检测23个变异株，发现有供体带型或新带型。根据带型数据，利用分子统计分析方法，证明穗茎注射法是有效的引起遗传变异、增加遗传多样性的方法。将小粒野生稻基因组DNA导入杂交水稻保

4、持系V20B仓tl造出稳定变异系YvB，其株型、稻米品质、产量相关性状有明显变化或改良。通过全基因组测序，比较分析了27个表型性状差异相关的基因，发现与受体V20B相比，YvB在与株型相关的基因中存在21个SNP和30个InDel，分别有10个SNP和4个InDel位于编码序列；稻米品质相关的基因中存在124个SNP和28个InDel，并有25个SNP位于编码序列；产量相关基因中存在65个SNP和42个IrtDel，分别有10个SNP和2个InDel位于编码序列。部分位于编码序列的变异引起了错义突变和移码突变，并导致编码氨基酸的序列或极性状态变化，部分对应表型性状变异。设计引物重新测序供受体和

5、变异系的相关基因序列，发现变异系在耽基因的5’非翻译区超过400bpl拘片段与供体相同，与受体存在SNP，验证了供体基因组DNA对受体产生影响。实时荧光定量PCR的结果则表明淀粉合酶同工型基因RNA表达量在两个材料中存在差异，推测与非编码区的变异相关，对应表型性状变异。这些都为寻找引起变异系YVB表型变化的关键基因及位点提供了依据。图11幅，表10个，参考文献64篇关键词：种质创新；穗茎注射法；遗传多样性；全基因组测序；基因变异；分子育种分类号：$336GeneticdiversityandgenevariationanalysisofthevariantsderivedfromgenomeD

6、NAtransformationofwildriceAbstract：Inanattempttoincreasethegeneticdiversityofcultivatedriceandtoenhanceheterosisofhybrids，genomicDNAofeitherOryzaminutaor0．eichingeriwasinjectedintotheplantofarestorelineofhybridrice，RH78，throughthespike．stalkinjectionmethod．Asetof23variantplantswetederivedfromthefirs

7、tgeneration．Itwasfoundthatthevariantsweremorphologicallydifferentintraitssuchasflagleaflengthandwidth，plantheight，thenumberofpaniclespervariantplant，paniclelength，spikeletsperpanicle，seedset，andweight