粤东普通野生稻遗传多样性研究及初级核心种质构建

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1、分类号：S321、S326学校代码：10758密级：公开学号：08020029硕士学位论文粤东普通野生稻遗传多样性研究及初级核心种质构建StudyontheGeneticDiversityandEstablishmentofPre-coreCollectionofCommonWildRice(OryzarufipogonGriff.)inEastenareaofGuangdongProvinceinChina研究生姓名李杜娟导师姓名及职称李晨副研究员合作导师姓名及职称陈全家教授学位门类级别农学硕士专业名称作物遗传育种研究方向水稻分子育种所在学院农学院新疆·乌鲁木齐二〇一二年五月独创性声明本

2、人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得新疆农业大学或其他教育单位的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：时间：年月日关于学位论文使用授权的说明本人完全了解新疆农业大学有关保留、使用学位论文的规定，即：新疆农业大学有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子文档，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文，允许论文被查阅和借阅。本人授权新疆农业大学将学位论文的

3、全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以公布(包括刊登)论文的全部或部分内容。(保密的学位论文在解密后应遵守此协议)研究生签名：时间：年月日导师签名：时间：年月日本文是农业部作物种质资源保护项目“野生稻种质更新复壮、编目与利用”（项目编号：NB2010-2130135-12）；公益性行业（农业）科研专项经费“农业野生植物资源保护利用技术研究与示范”（项目编号：201003021）；广东省科技基础条件建设项目“广东水稻种质资源圃建设”（项目编号：2010B060200026）；广东省科技厅农业攻关专项“水稻和甜玉米资源鉴评及重要性状的基因定位与克隆”（项目编号：2009A020102003

4、）的部分研究成果课题主持人：潘大建研究员（广东省农业科学院）I粤东普通野生稻遗传多样性研究及初级核心种质构建摘要普通野生稻（OryzarufipogonGriff.以下简称―普野‖），广泛分布于我国境内。作为是亚洲野生稻公认的祖先，普野是其中最重要和最宝贵的种质资源。粤东普野主要分布在广东省的东部沿海地区，在我国稻种资源占有独特地位。本文以粤东普野6个自然居群167份材料为对象，分别从遗传多样性、籼粳分化等方面对其进行了分析，并分别从表型水平和DNA水平构建了其初级核心种质。主要结果如下：1.对粤东普野23个表型性状进行考察记录，分析其表型变异，并结合SPSS和DPS软件进行表型相关、聚类

5、和方差分析。粤东普野在表型性状上存在丰富的变异，众多重要性状之间呈极显著相关性；所聚类的6类粤东普野植株群体存在显著性差异；各居群材料既具有较高的相似性，又存在一定程度的差异、具有各自的特点；粤东普野的表型变异具有一定的规律性。据粤东普野丰富的表型多样性和自身的独特性，故亟待选择一批具有代表性的材料重点开发利用。2.以中国栽培稻微核心种质为对照，筛选并利用可鉴别籼粳亚种的34对SSR引物对粤东普野材料进行研究，结果表明：粤东普野群体同时存在偏粳、偏籼和比较原始纯合的组群和个体，其中偏粳多于偏籼；粤东普野虽然已经出现了一定程度的籼粳分化，但与栽培稻相比分化是初步的、不显著的，总体上比较原始；

6、在遗传结构上比较原始纯合的粤东普野组群，在遗传距离上具有偏粳趋势。说明粤东普野在亚洲栽培稻的起源演化和遗传分化研究上具有重要的地位，在基因发掘和育种实践中具有巨大的利用前景。3.以表型调查数据和分子标记数据为基础，以系统聚类方法取样，并通过多重比较确定了适宜的取样规模，构建了基于表型水平的核心种质(占原种质20%的34份材料)和分子水平的核心种质(占原种质10%的17份材料)。利用表型保留比例、Shanno-Wavear指数、表型方差、变异系数以及等位基因保留比例、Simpson指数等重要参数分别对两套核心种质进行评价。结果表明30%的核心样品对原种质有良好的代表性，表型保留比例达到95.

7、38%，等位基因保留比例达到近90％，其他各项参数表明核心种质较大程度地消除了原种质的遗传重复，完全符合核心种质构建要求。粤东普野核心种质的构建为今后的有效保存和深入研究利用奠定了良好基础。关键词：普通野生稻；遗传多样性；籼粳分化；核心种质；SSR标记IIStudyontheGeneticDiversityandEstablishmentofPre-coreCollectionofCommonWildRice(Oryza