黍稷种质遗传资源多样性及遗传图谱构建研究

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1、分类号：Q943.2单位代码：10193密级：公开学号：2012234硕士学位论文黍稷种质遗传资源多样性及遗传图谱构建研究AssessmentofgeneticdiversityandconstructionofgeneticlinkagemapofBroomcornmillet(PanicummiliaceumL.)作者姓名：王银月学位类别：理学硕士专业名称：生物化学与分子生物学研究方向：植物基因工程指导教师：崔喜艳副教授陆平研究员所在学院：生命科学学院2015年5月独创性声明本人郑重声明：所呈

2、交的学位论文是本人在导师指导下，独立进行研究所取得的成果。尽我所知，除文中特别加以标注和致谢所列内容外，论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得吉林农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。本学位论文所有内容若有不实之处，本人愿意承担一切相关法律责任和后果。学位论文作者签名：签字日期：年月日关于学位论文使用授权的声明1、本人完全了解吉林农业大学有关保留和使用学位论文的规定，即：研究生

3、在校攻读学位期间所完成的论文及相关成果的知识产权属吉林农业大学所有，并同意将本论文的版权授权给吉林农业大学，学校有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。2、本人（同意/不同意，务必打印后填写）吉林农业大学将本论文版权授权给不同媒体进行电子出版、多媒体出版、网络出版以及其他形式出版（涉密学位论文解密后应遵守此协议）。3、本人声明毕业后若发表在攻读研究生学位期间完成的论文及相关的学术成果，必须以吉林农业大学作为第一署名单位。学位论文作

4、者签名：签字日期：年月日指导教师签名：签字日期：年月日摘要黍稷（PanicummiliaceumL.）又被称为糜子，早在10000年前就被驯化栽培，作为主要的粮食作物。在我国，黍稷主要分布种植于西北、东北以及华北等地的干旱贫瘠地区，常用来改善盐渍地、整治沙漠和开辟荒地，于此同时因为黍稷生育期较短又可以利用它作为抗旱救灾作物。此外，黍稷营养丰富，具有较高的蛋白质含量和脂肪含量，氨基酸种类丰富，富含多种微量元素和维生素，长期以来一直是我国北方地区不可或缺的特色粮食作物。然而迄今为止，国内外很少有从分子

5、水平研究黍稷种质资源的报道。本研究利用本实验室开发的SSR标记对国内黍稷主要育成品种及其亲本进行了遗传多样性分析，同时利用育成品种与野生材料创制遗传群体，结合筛选到的SSR标记，构建黍稷分子遗传图谱。本实验的主要研究结果如下：1）对来自中国各省收集的黍稷88份黍稷育成品种及其亲本进行遗传多样性分析。从67对SSR引物的扩增片段看出黍稷种质多样性呈中等水平。共检测179个等位基因，平均每个位点的等位基因数为2.7个。多态信息含量（PIC）以及预期杂合度（HE）分别介于0.043到0.729之间（平均

6、0.376）和0.045到0.771（平均0.445）之间。2）UPGMA聚类分析结果显示，在遗传相似值为0.633处将88份材料分成四组。遗传结构分析表明，在地域和遗传多样性之间具有密切的相关性。这些研究结果对于黍稷的基因库遗传多样性分析、黍稷的遗传育种有着重要的价值。另外，开发到的黍稷专用SSR标记还可有效于黍稷种质资源遗传多样性和种群结构的评估。3）用于遗传图谱构建的SSR多态性筛选结果显示：共3506对引物进行SSR多态性筛选，得到有多态的引物235对，占总数的6.7%，其中群体一的两个亲

7、本所特有的引物有36对，群体二的两个亲本中特有的引物有98对，两个群体共有的多态性引物有111对；引物碱基结构分析发现选用的3506对引物中有1173个双碱基重复SSR和2333个三碱基重复SSR，筛选到的多态性引物中，双碱基重复有102个，三碱基重复133个。将这些引物上群体后得到在群体中有多态的引物150对，其中在群体一中有多态的有130对，在群体二中有多态的有101对。I4）黍稷分子遗传图谱构建结果显示：利用winQTLcart软件得到黍稷连锁图谱，其中群体一覆盖了660.3cM，包含13个

8、连锁群，连锁群上最小标记间的距离是0.2cM，最大标记间的距离为44.7cM，平均两个标记的距离是63.2cM。连锁群上最多包括20个标记，最少包括2个标记，平均每条连锁群上包含4个标记。最长连锁群覆盖了约126.7cM的长度，而最短的连锁群只覆盖24.6cM的长度，平均每个连锁群长度为50.8cM。群体二覆盖了251.3cM，包含了3个连锁群，连锁群上最小标记间的距离是0.7cM，最大标记间的距离为46.5cM，平均两个标记的距离是9.3cM。连锁群上最多包括23个标记，最少包括