茄子遗传多样性研究与遗传连锁图谱构建

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1、K^Jf^fAGRICULTURALUNIVERSITYOFHEBEI博士学位(毕业)论文前子遗传多样性研究与遗传连锁图谱构建学位申请人:陈雪平指导教师:申书兴教授学科专业:蔬菜学学位类别:农学博士授予单位:河北农业大学答辩日期:二〇一五年六月六日独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研宄工作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研宄成果,也不包含为获得河北农业大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研宄所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者

2、签名:签字日期:《=>〃/年/月令曰学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解河北农业大学有关保留、使用学位论文的规定,有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权河北农业大学可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)学位论文作者签名:导师签名:签字曰期:y//年士月《日签字日期々年〈月幺日学位论文作者毕业后去向:工作单位:电话:通讯地址:邮编:分类号:S641.1单位代码:10086密级:公开学号:200721茄子遗传多样性研究与

3、遗传连锁图谱构建StudyonGeneticDiversityandGeneticLinkageMapConstructioninEggplant学位申请人:陈雪平指导教师:申书兴教授学科专业:蔬菜学学位类别:农学博士授予单位:河北农业大学答辩日期:二○一五年六月六日摘要SolanummelongenaL.作为最重要的茄子栽培种在亚洲、欧洲中南部和地中沿岸等地得到广泛种植,其年生产量和生产值均已跃居于世界蔬菜生产的前十位。但目前茄子遗传育种的研究水平与其作为世界性大宗蔬菜的生产地位不相称,严重制约着茄子生产的发展与产品的质量水平。分析可能造成这种局面的原因,主要有以下几点:一

4、是茄子栽培种内遗传背景狭窄,直接制约着遗传研究和育种实践水平;二是茄子数量性状遗传的研究手段仍局限于传统方法;三是茄子重要经济性状的关联标记开发和基因挖掘严重滞后。在目前关于茄子遗传育种的研究中,主要体现在遗传多样性研究所用资源的地理来源的丰度不高,用于遗传多样性研究的分子标记资源有限,已构建的遗传图谱分子标记的饱和度不够,鉴定的与重要经济性状相关的QTL及与其紧密连锁的可用于分子标记辅助育种(marker-assistedselection,MAS)和基因组选择育种(genomicselection,GS)的分子标记较少。针对上述问题与不足,本研究以来自5个洲33个国家的茄

5、子种质资源为试材,利用SSR和SRAP两种分子标记,结合形态学表型性状鉴定,采用关联作图的方法对其进行遗传多样性及性状关联标记的研究;同时,以存在多个性状差异的高代自交系为亲本获得F1及F2代分离群体,利用高通量简化基因组测序技术开发高多态性的新型分子标记,构建高密度的茄子遗传图谱,开展目标性状的QTL定位研究。主要研究结果如下:1.对133份茄子及其近缘种的27个形态学性状进行遗传多样性分析表明,研究群体内存在着丰富的形态变异,Shannon多样性指数H'和均一度值J的总体平均值分别为2.110和0.753;与育种密切相关的性状中果形指数、果长、果色、萼下果色和果形等变异系

6、数较大;叶刺、果萼刺和果棱的变异系数最高,可作为植物学分类的重要依据。依据因子分析结果对供试材料进行形态学聚类分析,可将其清晰划分为7个组,命名为GⅠ-GⅦ,GⅠ组进而分为4个亚组,命名为subG1-subG4。2.利用5对SSR引物和25对SRAP引物对133份材料进行遗传多样性分析表明,引物多态性条带率99.24%,各位点PIC值范围为0.015-0.500,平均值0.312;有效等位基因数范围1.2905-1.7459,平均值为1.5114;Nei's多样性指数H范围为0.1701-0.4056,平均值为0.2992;Shannon指数I范围为0.02661-0.585

7、5,平均值为0.4550。相似系数范围0.024-0.968,平均值0.764,反映出群体内分子水平的遗传多样性不高,遗传背景较为狭窄。利用PIC>0.25的位点聚类,可将材料划分为M1-M6六个类别。S.melongena和S.dasyphyllum、S.integrifolium、S.aethiopicum、S.macrocarpen、S.viarum及S.anguivi之间的平均相似系数依次为0.837、0.828、0.822、0.767、0.589和0.541。3.利用Structure2.3.

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