牡丹ssr标记遗传连锁图谱的构建

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1、分类号UDC密级编号硕士学位论文牡丹SSR标记遗传连锁图谱的构建ConstructionofGeneticLinkageMapUsingSSRMolecularMarkersinTreePeony学位申请人：郭琪指导教师：侯小改教授一级学科：生物学二级学科：植物学学位类别：理学硕士2016年05月万方数据独创性声明本人声明，所呈交的论文是我个人在导师指导下完成的研究工作及取得的研究成果。据我所知，文中除了特别加以标注和致谢的地方外，不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得河南科技大学或

2、其它教育机构的其他学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：日期：关于论文使用授权的说明本人完全了解河南科技大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校拥有对所有学位论文的复制权、传播权、汇编权及其它使用权(特殊情况需要保密的论文应提前说明，但在解密后应遵守此规定)。需要保密的论文请填写：本学位论文在年月至年月期间需要保密，解密后适用本授权书。(需要保密的学位论文无须向图书馆提供论文的电子文档)研究生签名：导师签名：日期：万方

3、数据摘要摘要牡丹（PaeoniasuffruticosaAndrews.）属芍药科（Paeoniaceae）芍药属（PaeoniaL.）牡丹组（Sect.MoutanDC.）植物，是多年生木本落叶灌木，其花大色艳、花香浓郁，为我国的传统名花。长期以来，牡丹的育种工作一直是牡丹工作者的研究重点，致力于培育拥有高经济价值和观赏价值的牡丹新品种，从而满足市场需求，这对于牡丹的产业化发展具有重要的意义。由于牡丹遗传背景复杂，传统的研究方法有一定的局限性。因此，近年来，人们对开始从分子水平对其进行研究，主要集

4、中在遗传多样性研究、亲缘关系分析和种质资源分类等。而对于用SSR分子标记构建牡丹遗传连锁图谱的报道尚未见到。因此，以牡丹品种‘凤丹’为母本，‘新日月锦’为父本，及其杂交后代F1群体120株植物材料作为本研究的试材，基于已开发的牡丹基因组SSR标记，利用JoinMap4.0软件进行结果分析，从而构建了首张牡丹SSR标记遗传连锁图谱。得到的主要结果如下：（1）从已发表的相关文献结合课题组转录组数据，共合成SSR引物705对。选取‘凤丹’与‘新日月锦’两亲本材料进行引物初筛试验。最终发现在合成的705对S

5、SR引物中，有142对出现了清晰、多态性高、重复性好的条带，多态性率为20.14%。（2）用142对SSR引物依次对杂交后代进行PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳，最终发现有18对引物的扩增效果并不理想，弃之不用。其余的124对SSR引物共扩增出261条具多态性的条带，平均每对引物得到多态性条带数为2.1。其中，母本所特有的分离位点有45个，父本所特有的分离位点有47个，双亲共有的分离位点为169个。（3）统计124对SSR引物的扩增结果，利用JoinMap4.0作图软件中的“CP”模型构建牡丹遗传连锁

6、图谱。图谱包含35个标记，作图位点率为28.2%，覆盖5个连锁群，图谱总长度覆盖牡丹基因组338.2cM，连锁群的长度范围为51.0cM～120.9cM，标记间平均间距为9.7cM，连锁群长度为29.8～120.9cM，遗传连锁图谱各连锁群含标记数从3～14个，平均每个连锁群包含7.0个标记。5个连锁群上相邻标记间距大于10cM的区间有12个。I万方数据摘要关键词：牡丹；分子标记；SSR；遗传图谱论文类型：基础研究选题来源：国家自然科学基金项目（31370697）II万方数据ABSTRACTABST

7、RACTTreePeony(PaeoniaL.)isaperennialwoodydeciduousshrubplantanditbelongstosectionmoutan,Paeoniaceaefamily,Paeoniaceaegenus.Theflowerisatraditionalfamousflowersofourcountryduetotheirlarge,showy,colorfulandfragrantflowers.Asfamousornamentalplantbeusedtocu

8、ltivate,TreePeonyspecieshasalongutilizinghistory.Chinaistheoriginanddevelopmentalcenterofthecultivatedtreepeony,anditswidelycultivatedinmanycountriesinAsia,AmericaEuropeandAustralia,whichhasbecomeaworldfamouscommonornamentalflowers.Fora